RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.08■■■■■ 4.33
PBRM1-218ENST00000458294 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
PBRM1-218ENST00000458294 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.06■■■■■ 4.32
PBRM1-218ENST00000458294 PZPP20742 1482 aa42.04■■■■■ 4.32
PBRM1-218ENST00000458294 TNRQ92752 1358 aa42.01■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.99■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 TSPY4P0CV99 314 aa41.98■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 TSPY10P0CW01 314 aa41.98■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.98■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.97■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.93■■■■■ 4.3
PBRM1-218ENST00000458294 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.89■■■■■ 4.3
PBRM1-218ENST00000458294 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.87■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.87■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 MAP3K1Q13233 1512 aa41.86■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 NLRP1Q9C000 1473 aa41.85■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 MIA2Q96PC5 1412 aa41.85■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 ILDR2Q71H61 639 aa41.84■■■■■ 4.29
PBRM1-218ENST00000458294 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.78■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.77■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 CPS1P31327 1500 aa41.77■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.76■■■■■ 4.28
PBRM1-218ENST00000458294 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.76■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 ABCC3O15438 1527 aa41.75■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.75■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.72■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 DEPDC5O75140 1603 aa41.72■■■■■ 4.27
PBRM1-218ENST00000458294 MED14O60244 1454 aa41.69■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 SOCS7O14512 581 aa41.69■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.67■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.64■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.64■■■■■ 4.26
PBRM1-218ENST00000458294 ERVK-7P63135 1459 aa41.62■■■■■ 4.25
PBRM1-218ENST00000458294 IQGAP1P46940 1657 aa41.59■■■■■ 4.25
PBRM1-218ENST00000458294 CEP152O94986 1710 aa41.59■■■■■ 4.25
PBRM1-218ENST00000458294 TOM1O60784 492 aa41.58■■■■■ 4.25
PBRM1-218ENST00000458294 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.53■■■■■ 4.24
PBRM1-218ENST00000458294 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 KIF15Q9NS87 1388 aa41.5■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 ERBINQ96RT1 1412 aa41.49■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 PIP4K2BP78356 416 aa41.48■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.48■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.47■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 ABCC5O15440 1437 aa41.47■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.45■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PBRM1-218ENST00000458294 HSPA1LP34931 641 aa41.44■■■■■ 4.22
PBRM1-218ENST00000458294 APLP2Q06481 763 aa41.42■■■■■ 4.22
PBRM1-218ENST00000458294 SYNMO15061 1565 aa41.39■■■■■ 4.22
PBRM1-218ENST00000458294 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.39■■■■■ 4.22
PBRM1-218ENST00000458294 DAPK1P53355 1430 aa41.38■■■■■ 4.22
PBRM1-218ENST00000458294 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.38■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 ALKQ9UM73 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 SLIT1O75093 1534 aa41.35■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.34■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.34■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.34■■■■■ 4.21
PBRM1-218ENST00000458294 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PBRM1-218ENST00000458294 KANK1Q14678 1352 aa41.29■■■■■ 4.2
PBRM1-218ENST00000458294 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.21e-6■■□□□ 12.1
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PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.25■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 LTKP29376 864 aa41.25■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 PIK3C2BO00750 1634 aa41.25■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.24■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 EID1Q9Y6B2 187 aa41.21■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.16■■■■■ 4.18
PBRM1-218ENST00000458294 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.16■■■■■ 4.18
PBRM1-218ENST00000458294 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.13■■■■■ 4.17
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.13■■■■■ 4.17
PBRM1-218ENST00000458294 ADGRL2O95490 1459 aa41.1■■■■■ 4.17
PBRM1-218ENST00000458294 IDI1Q13907 227 aa41.07■■■■■ 4.17
PBRM1-218ENST00000458294 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
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PBRM1-218ENST00000458294 ADGRB3O60242 1522 aa41■■■■■ 4.15
PBRM1-218ENST00000458294 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PBRM1-218ENST00000458294 TET3O43151 1660 aa40.97■■■■■ 4.15
PBRM1-218ENST00000458294 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
PBRM1-218ENST00000458294 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.95■■■■■ 4.15
PBRM1-218ENST00000458294 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
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PBRM1-218ENST00000458294 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
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PBRM1-218ENST00000458294 TMEM94Q12767 1356 aa40.88■■■■■ 4.14
PBRM1-218ENST00000458294 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.87■■■■■ 4.13
PBRM1-218ENST00000458294 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.86■■■■■ 4.13
PBRM1-218ENST00000458294 NWD1Q149M9 1564 aa40.84■■■■■ 4.13
PBRM1-218ENST00000458294 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
PBRM1-218ENST00000458294 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
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