RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.48■■■■■ 8.23
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PBRM1-218ENST00000458294 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.81■■■■■ 7.17
PBRM1-218ENST00000458294 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.99■■■■■ 6.71
PBRM1-218ENST00000458294 NACADO15069 1562 aa56.56■■■■■ 6.65
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.26■■■■■ 6.6
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.07■■■■■ 6.57
PBRM1-218ENST00000458294 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.77■■■■■ 6.52
PBRM1-218ENST00000458294 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.68■■■■■ 6.5
PBRM1-218ENST00000458294 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.65■■■■■ 6.5
PBRM1-218ENST00000458294 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.3■■■■■ 6.44
PBRM1-218ENST00000458294 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.07■■■■■ 6.41
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.97■■■■■ 6.39
PBRM1-218ENST00000458294 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.65■■■■■ 6.34
PBRM1-218ENST00000458294 SCRIBQ14160 1630 aa54.39■■■■■ 6.3
PBRM1-218ENST00000458294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.11■■■■■ 6.25
PBRM1-218ENST00000458294 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.97■■■■■ 6.23
PBRM1-218ENST00000458294 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.97■■■■■ 6.23
PBRM1-218ENST00000458294 NCAPD3P42695 1498 aa52.2■■■■■ 5.95
PBRM1-218ENST00000458294 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.99■■■■■ 5.91
PBRM1-218ENST00000458294 SMARCA4P51532 1647 aa51.91■■■■■ 5.9
PBRM1-218ENST00000458294 SMARCA2P51531 1590 aa51.87■■■■■ 5.89
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.86■■■■■ 5.89
PBRM1-218ENST00000458294 HMGXB3Q12766 1538 aa51.82■■■■■ 5.89
PBRM1-218ENST00000458294 CUX2O14529 1486 aa51.75■■■■■ 5.88
PBRM1-218ENST00000458294 ERCC6Q03468 1493 aa51.73■■■■■ 5.87
PBRM1-218ENST00000458294 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.66■■■■■ 5.86
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PBRM1-218ENST00000458294 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.45■■■■■ 5.83
PBRM1-218ENST00000458294 NESP48681 1621 aa51.36■■■■■ 5.81
PBRM1-218ENST00000458294 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.19■■■■■ 5.79
PBRM1-218ENST00000458294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.08■■■■■ 5.77
PBRM1-218ENST00000458294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.95■■■■■ 5.75
PBRM1-218ENST00000458294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.77■■■■■ 5.72
PBRM1-218ENST00000458294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.75■■■■■ 5.71
PBRM1-218ENST00000458294 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.58■■■■■ 5.69
PBRM1-218ENST00000458294 WIZO95785 1651 aa50.58■■■■■ 5.69
PBRM1-218ENST00000458294 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.33■■■■■ 5.65
PBRM1-218ENST00000458294 WDR62O43379 1518 aa50.23■■■■■ 5.63
PBRM1-218ENST00000458294 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.09■■■■■ 5.61
PBRM1-218ENST00000458294 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.07■■■■■ 5.61
PBRM1-218ENST00000458294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.01■■■■■ 5.6
PBRM1-218ENST00000458294 CFTRP13569 1480 aa49.99■■■■■ 5.59
PBRM1-218ENST00000458294 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.97■■■■■ 5.59
PBRM1-218ENST00000458294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.6■■■■■ 5.53
PBRM1-218ENST00000458294 PRDM2Q13029 1718 aa49.52■■■■■ 5.52
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM41Q8WV44 630 aa49.45■■■■■ 5.51
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.36■■■■■ 5.49
PBRM1-218ENST00000458294 OSCARQ8IYS5 282 aa49.3■■■■■ 5.48
PBRM1-218ENST00000458294 IFT140Q96RY7 1462 aa49.11■■■■■ 5.45
PBRM1-218ENST00000458294 TOPBP1Q92547 1522 aa49.04■■■■■ 5.44
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.99■■■■■ 5.43
PBRM1-218ENST00000458294 ABCC8Q09428 1581 aa48.98■■■■■ 5.43
PBRM1-218ENST00000458294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.87■■■■■ 5.41
PBRM1-218ENST00000458294 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
PBRM1-218ENST00000458294 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.7■■■■■ 5.39
PBRM1-218ENST00000458294 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.7■■■■■ 5.39
PBRM1-218ENST00000458294 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.7■■■■■ 5.39
PBRM1-218ENST00000458294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGEF11O15085 1522 aa48.53■■■■■ 5.36
PBRM1-218ENST00000458294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.53■■■■■ 5.36
PBRM1-218ENST00000458294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.52■■■■■ 5.366e-6■■■■□ 23.2
PBRM1-218ENST00000458294 CHD1O14646 1710 aa48.43■■■■■ 5.34
PBRM1-218ENST00000458294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.31■■■■■ 5.32
PBRM1-218ENST00000458294 SOGA1O94964 1423 aa48.29■■■■■ 5.32
PBRM1-218ENST00000458294 WDR97A6NE52 1622 aa48.21■■■■■ 5.31
PBRM1-218ENST00000458294 FBLN2P98095 1184 aa48.21■■■■■ 5.31
PBRM1-218ENST00000458294 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.19■■■■■ 5.31
PBRM1-218ENST00000458294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
PBRM1-218ENST00000458294 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.12■■■■■ 5.29
PBRM1-218ENST00000458294 CUX1P39880 1505 aa48.12■■■■■ 5.29
PBRM1-218ENST00000458294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.06■■■■■ 5.28
PBRM1-218ENST00000458294 ARAP1Q96P48 1450 aa48.03■■■■■ 5.28
PBRM1-218ENST00000458294 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
PBRM1-218ENST00000458294 GRIN2BQ13224 1484 aa47.92■■■■■ 5.26
PBRM1-218ENST00000458294 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.88■■■■■ 5.26
PBRM1-218ENST00000458294 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
PBRM1-218ENST00000458294 SYNJ1O43426 1573 aa47.86■■■■■ 5.25
PBRM1-218ENST00000458294 SYNJ2O15056 1496 aa47.79■■■■■ 5.24
PBRM1-218ENST00000458294 PBRM1Q86U86 1689 aa47.73■■■■■ 5.23
PBRM1-218ENST00000458294 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.72■■■■■ 5.23
PBRM1-218ENST00000458294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.66■■■■■ 5.22
PBRM1-218ENST00000458294 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
PBRM1-218ENST00000458294 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
PBRM1-218ENST00000458294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.62■■■■■ 5.21
PBRM1-218ENST00000458294 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.18
PBRM1-218ENST00000458294 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.35■■■■■ 5.17
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PBRM1-218ENST00000458294 GRIN2AQ12879 1464 aa47.3■■■■■ 5.16
PBRM1-218ENST00000458294 ADAMTS12P58397 1594 aa47.27■■■■■ 5.16
PBRM1-218ENST00000458294 NUP160Q12769 1436 aa47.16■■■■■ 5.14
PBRM1-218ENST00000458294 CEP170Q5SW79 1584 aa47.13■■■■■ 5.14
PBRM1-218ENST00000458294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.12■■■■■ 5.13
PBRM1-218ENST00000458294 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.08■■■■■ 5.13
PBRM1-218ENST00000458294 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.07■■■■■ 5.12
PBRM1-218ENST00000458294 SHROOM2Q13796 1616 aa46.99■■■■■ 5.11
PBRM1-218ENST00000458294 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
PBRM1-218ENST00000458294 JPH4Q96JJ6 628 aa46.63■■■■■ 5.06
PBRM1-218ENST00000458294 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.62■■■■■ 5.05
PBRM1-218ENST00000458294 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.42■■■■■ 5.02
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