RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.59■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PRAME-210ENST00000442481 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.58■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 HSPA1LP34931 641 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 CPS1P31327 1500 aa18.56■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 TNRQ92752 1358 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 PZPP20742 1482 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 KIF3BO15066 747 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 PIP4K2BP78356 416 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 TOM1O60784 492 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PRAME-210ENST00000442481 NLRP1Q9C000 1473 aa18.52■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 TSPY4P0CV99 314 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 TSPY10P0CW01 314 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 NCOA2Q15596 1464 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 ALKQ9UM73 1620 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 MIA2Q96PC5 1412 aa18.47■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.47■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PRAME-210ENST00000442481 MED14O60244 1454 aa18.46■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 DEPDC5O75140 1603 aa18.45■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 IQGAP1P46940 1657 aa18.42■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.42■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.39■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 ABCC3O15438 1527 aa18.39■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.38■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 SYNMO15061 1565 aa18.36■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-7P63135 1459 aa18.35■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.35■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.34■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.33■□□□□ 0.53
PRAME-210ENST00000442481 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.32■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.32■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 MAP3K1Q13233 1512 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 CEP152O94986 1710 aa18.3■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 LTKP29376 864 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 EID1Q9Y6B2 187 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 ERBINQ96RT1 1412 aa18.25■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLIT1O75093 1534 aa18.24■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 KANK1Q14678 1352 aa18.24■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 KIF15Q9NS87 1388 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.22■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 APLP2Q06481 763 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-210ENST00000442481 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 PIK3C2BO00750 1634 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.16■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 ABCC5O15440 1437 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.495e-17■■□□□ 11.4
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 TMEM94Q12767 1356 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 DAPK1P53355 1430 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 POTEAQ6S8J7 498 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 TET3O43151 1660 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 KCNA6P17658 529 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 IDI1Q13907 227 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.08■□□□□ 0.49
PRAME-210ENST00000442481 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.08■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 ADGRB3O60242 1522 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 NWD1Q149M9 1564 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 BCANQ96GW7 911 aa18.05■□□□□ 0.48
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