RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.56■■■□□ 2.48
MUC1-211ENST00000438413 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.56■■■□□ 2.48
MUC1-211ENST00000438413 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.55■■■□□ 2.48
MUC1-211ENST00000438413 PZPP20742 1482 aa30.51■■■□□ 2.48
MUC1-211ENST00000438413 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.51■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 TNRQ92752 1358 aa30.5■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.47■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.47■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 TSPY4P0CV99 314 aa30.45■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 TSPY10P0CW01 314 aa30.45■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 ILDR2Q71H61 639 aa30.45■■■□□ 2.47
MUC1-211ENST00000438413 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.44■■■□□ 2.46
MUC1-211ENST00000438413 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.44■■■□□ 2.46
MUC1-211ENST00000438413 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.41■■■□□ 2.46
MUC1-211ENST00000438413 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
MUC1-211ENST00000438413 MIA2Q96PC5 1412 aa30.38■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 NLRP1Q9C000 1473 aa30.38■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.36■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.35■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 MAP3K1Q13233 1512 aa30.34■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 CPS1P31327 1500 aa30.33■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
MUC1-211ENST00000438413 ABCC3O15438 1527 aa30.32■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.32■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.31■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.3■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 DEPDC5O75140 1603 aa30.3■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 SOCS7O14512 581 aa30.3■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.28■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 CEP152O94986 1710 aa30.27■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 MED14O60244 1454 aa30.26■■■□□ 2.44
MUC1-211ENST00000438413 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.26■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 IQGAP1P46940 1657 aa30.23■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 ERVK-7P63135 1459 aa30.23■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.22■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
MUC1-211ENST00000438413 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.2■■■□□ 2.42
MUC1-211ENST00000438413 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
MUC1-211ENST00000438413 TOM1O60784 492 aa30.18■■■□□ 2.42
MUC1-211ENST00000438413 PIP4K2BP78356 416 aa30.17■■■□□ 2.42
MUC1-211ENST00000438413 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.16■■■□□ 2.42
MUC1-211ENST00000438413 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.14■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 HSPA1LP34931 641 aa30.13■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 KIF15Q9NS87 1388 aa30.13■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.12■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 ABCC5O15440 1437 aa30.1■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 ERBINQ96RT1 1412 aa30.1■■■□□ 2.41
MUC1-211ENST00000438413 ALKQ9UM73 1620 aa30.07■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 SYNMO15061 1565 aa30.07■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.06■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 APLP2Q06481 763 aa30.06■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.05■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 DAPK1P53355 1430 aa30.05■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.04■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 SLIT1O75093 1534 aa30.02■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.01■■■□□ 2.4
MUC1-211ENST00000438413 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.01■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 PIK3C2BO00750 1634 aa30■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 LTKP29376 864 aa29.97■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 KANK1Q14678 1352 aa29.97■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.96■■■□□ 2.39
MUC1-211ENST00000438413 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.93■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 EID1Q9Y6B2 187 aa29.92■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.91■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.91■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
MUC1-211ENST00000438413 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.89■■■□□ 2.37
MUC1-211ENST00000438413 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.88■■■□□ 2.37
MUC1-211ENST00000438413 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.87■■■□□ 2.37
MUC1-211ENST00000438413 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
MUC1-211ENST00000438413 ADGRL2O95490 1459 aa29.82■■■□□ 2.36
MUC1-211ENST00000438413 IDI1Q13907 227 aa29.82■■■□□ 2.36
MUC1-211ENST00000438413 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
MUC1-211ENST00000438413 NOS1P29475 1434 aa29.79■■■□□ 2.36
MUC1-211ENST00000438413 ADGRB3O60242 1522 aa29.78■■■□□ 2.36
MUC1-211ENST00000438413 TET3O43151 1660 aa29.75■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.71■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 TMEM94Q12767 1356 aa29.7■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.7■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.7■■■□□ 2.35
MUC1-211ENST00000438413 KCNA6P17658 529 aa29.69■■■□□ 2.34
MUC1-211ENST00000438413 NWD1Q149M9 1564 aa29.67■■■□□ 2.34
MUC1-211ENST00000438413 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.66■■■□□ 2.34
MUC1-211ENST00000438413 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.66■■■□□ 2.34
MUC1-211ENST00000438413 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.66■■■□□ 2.34
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