RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-209	ENST00000437652	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.94	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	PKD2	Q13563	968 aa		40.91	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.91	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.88	■■■■■ 4.14
UBAP2L-209	ENST00000437652	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.88	■■■■■ 4.13
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.88	■■■■■ 4.13
UBAP2L-209	ENST00000437652	TNR	Q92752	1358 aa		40.85	■■■■■ 4.13
UBAP2L-209	ENST00000437652	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.83	■■■■■ 4.13
UBAP2L-209	ENST00000437652	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.83	■■■■■ 4.13
UBAP2L-209	ENST00000437652	PZP	P20742	1482 aa		40.82	■■■■■ 4.12
UBAP2L-209	ENST00000437652	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.75	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.73	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.71	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.71	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.7	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
UBAP2L-209	ENST00000437652	ABCC5	O15440	1437 aa		40.69	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.66	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.65	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	ABCC3	O15438	1527 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBAP2L-209	ENST00000437652	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.63	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.62	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	DAPK1	P53355	1430 aa		40.6	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.6	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.6	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.59	■■■■■ 4.09	1e-6	■■■□□ 19.2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.58	■■■■■ 4.09
UBAP2L-209	ENST00000437652	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.56	■■■■■ 4.08	5e-9	■■■■□ 20.9
UBAP2L-209	ENST00000437652	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.56	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.54	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.53	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.52	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	CEP152	O94986	1710 aa		40.52	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
UBAP2L-209	ENST00000437652	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.49	■■■■■ 4.07
UBAP2L-209	ENST00000437652	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.48	■■■■■ 4.07
UBAP2L-209	ENST00000437652	KANK1	Q14678	1352 aa		40.47	■■■■■ 4.07
UBAP2L-209	ENST00000437652	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.45	■■■■■ 4.07
UBAP2L-209	ENST00000437652	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.43	■■■■■ 4.06
UBAP2L-209	ENST00000437652	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
UBAP2L-209	ENST00000437652	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.39	■■■■■ 4.06
UBAP2L-209	ENST00000437652	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
UBAP2L-209	ENST00000437652	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.35	■■■■■ 4.05
UBAP2L-209	ENST00000437652	MED14	O60244	1454 aa		40.35	■■■■■ 4.05
UBAP2L-209	ENST00000437652	CPS1	P31327	1500 aa		40.29	■■■■■ 4.04
UBAP2L-209	ENST00000437652	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.27	■■■■■ 4.04
UBAP2L-209	ENST00000437652	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.27	■■■■■ 4.04
UBAP2L-209	ENST00000437652	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.26	■■■■■ 4.04
UBAP2L-209	ENST00000437652	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.25	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.25	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	TOM1	O60784	492 aa		40.22	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.22	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.21	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.2	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.2	■■■■■ 4.03
UBAP2L-209	ENST00000437652	LTK	P29376	864 aa		40.19	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.18	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	IDI1	Q13907	227 aa		40.17	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.14	■■■■■ 4.02
UBAP2L-209	ENST00000437652	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.12	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.12	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLIT1	O75093	1534 aa		40.11	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.11	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.08	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.07	■■■■■ 4.01
UBAP2L-209	ENST00000437652	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.05	■■■■■ 4
UBAP2L-209	ENST00000437652	NOS1	P29475	1434 aa		40.04	■■■■■ 4
UBAP2L-209	ENST00000437652	ITGAE	P38570	1179 aa		40.03	■■■■■ 4
UBAP2L-209	ENST00000437652	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.01	■■■■■ 4
UBAP2L-209	ENST00000437652	SYNM	O15061	1565 aa		40	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	ROCK1	Q13464	1354 aa		39.98	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		39.97	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	HSPA1L	P34931	641 aa		39.97	■■■■□ 3.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	TET3	O43151	1660 aa		39.92	■■■■□ 3.98
UBAP2L-209	ENST00000437652	ILDR2	Q71H61	639 aa		39.91	■■■■□ 3.98
UBAP2L-209	ENST00000437652	BCAN	Q96GW7	911 aa		39.9	■■■■□ 3.98
UBAP2L-209	ENST00000437652	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.87	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		39.87	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.86	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	UNC13B	O14795	1591 aa		39.86	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		39.84	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
UBAP2L-209	ENST00000437652	NUP155	O75694	1391 aa		39.82	■■■■□ 3.96
UBAP2L-209	ENST00000437652	KCNA6	P17658	529 aa		39.81	■■■■□ 3.96
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	39.78	■■■■□ 3.96
UBAP2L-209	ENST00000437652	ALK	Q9UM73	1620 aa		39.78	■■■■□ 3.96

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