RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.74■■■■■ 7.95
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UBAP2L-209ENST00000437652 ABCC9O60706 1549 aa57.76■■■■■ 6.84
UBAP2L-209ENST00000437652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.07■■■■■ 6.41
UBAP2L-209ENST00000437652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.83■■■■■ 6.37
UBAP2L-209ENST00000437652 NACADO15069 1562 aa54.76■■■■■ 6.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.05■■■■■ 6.24
UBAP2L-209ENST00000437652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.98■■■■■ 6.23
UBAP2L-209ENST00000437652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.91■■■■■ 6.22
UBAP2L-209ENST00000437652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.77■■■■■ 6.2
UBAP2L-209ENST00000437652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.65■■■■■ 6.18
UBAP2L-209ENST00000437652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.46■■■■■ 6.15
UBAP2L-209ENST00000437652 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.38■■■■■ 6.14
UBAP2L-209ENST00000437652 SCRIBQ14160 1630 aa52.83■■■■■ 6.05
UBAP2L-209ENST00000437652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.69■■■■■ 6.03
UBAP2L-209ENST00000437652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.15■■■■■ 5.94
UBAP2L-209ENST00000437652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.08■■■■■ 5.93
UBAP2L-209ENST00000437652 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.99■■■■■ 5.91
UBAP2L-209ENST00000437652 NCAPD3P42695 1498 aa50.56■■■■■ 5.68
UBAP2L-209ENST00000437652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.43■■■■■ 5.66
UBAP2L-209ENST00000437652 SMARCA4P51532 1647 aa50.42■■■■■ 5.66
UBAP2L-209ENST00000437652 SMARCA2P51531 1590 aa50.32■■■■■ 5.65
UBAP2L-209ENST00000437652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.24■■■■■ 5.63
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UBAP2L-209ENST00000437652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.98■■■■■ 5.59
UBAP2L-209ENST00000437652 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.89■■■■■ 5.58
UBAP2L-209ENST00000437652 ERCC6Q03468 1493 aa49.88■■■■■ 5.58
UBAP2L-209ENST00000437652 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.88■■■■■ 5.58
UBAP2L-209ENST00000437652 NESP48681 1621 aa49.66■■■■■ 5.54
UBAP2L-209ENST00000437652 CUX2O14529 1486 aa49.63■■■■■ 5.54
UBAP2L-209ENST00000437652 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.42■■■■■ 5.5
UBAP2L-209ENST00000437652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.36■■■■■ 5.49
UBAP2L-209ENST00000437652 WIZO95785 1651 aa49.31■■■■■ 5.48
UBAP2L-209ENST00000437652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.15■■■■■ 5.46
UBAP2L-209ENST00000437652 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.08■■■■■ 5.45
UBAP2L-209ENST00000437652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
UBAP2L-209ENST00000437652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49■■■■■ 5.43
UBAP2L-209ENST00000437652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.98■■■■■ 5.43
UBAP2L-209ENST00000437652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
UBAP2L-209ENST00000437652 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.62■■■■■ 5.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CFTRP13569 1480 aa48.52■■■■■ 5.36
UBAP2L-209ENST00000437652 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.51■■■■■ 5.36
UBAP2L-209ENST00000437652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.48■■■■■ 5.35
UBAP2L-209ENST00000437652 WDR62O43379 1518 aa48.44■■■■■ 5.35
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.19■■■■■ 5.31
UBAP2L-209ENST00000437652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
UBAP2L-209ENST00000437652 PRDM2Q13029 1718 aa48.01■■■■■ 5.28
UBAP2L-209ENST00000437652 OSCARQ8IYS5 282 aa47.61■■■■■ 5.21
UBAP2L-209ENST00000437652 TOPBP1Q92547 1522 aa47.58■■■■■ 5.21
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCC8Q09428 1581 aa47.58■■■■■ 5.21
UBAP2L-209ENST00000437652 IFT140Q96RY7 1462 aa47.54■■■■■ 5.2
UBAP2L-209ENST00000437652 TRIM41Q8WV44 630 aa47.42■■■■■ 5.18
UBAP2L-209ENST00000437652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.41■■■■■ 5.18
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.4■■■■■ 5.18
UBAP2L-209ENST00000437652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
UBAP2L-209ENST00000437652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
UBAP2L-209ENST00000437652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
UBAP2L-209ENST00000437652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
UBAP2L-209ENST00000437652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.08■■■■■ 5.131e-6■■■■□ 20.3
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UBAP2L-209ENST00000437652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.96■■■■■ 5.11
UBAP2L-209ENST00000437652 FBLN2P98095 1184 aa46.87■■■■■ 5.09
UBAP2L-209ENST00000437652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
UBAP2L-209ENST00000437652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.86■■■■■ 5.09
UBAP2L-209ENST00000437652 CUX1P39880 1505 aa46.84■■■■■ 5.09
UBAP2L-209ENST00000437652 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
UBAP2L-209ENST00000437652 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
UBAP2L-209ENST00000437652 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.76■■■■■ 5.08
UBAP2L-209ENST00000437652 CHD1O14646 1710 aa46.74■■■■■ 5.07
UBAP2L-209ENST00000437652 WDR97A6NE52 1622 aa46.64■■■■■ 5.06
UBAP2L-209ENST00000437652 ARHGEF11O15085 1522 aa46.64■■■■■ 5.06
UBAP2L-209ENST00000437652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
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UBAP2L-209ENST00000437652 GRIN2BQ13224 1484 aa46.5■■■■■ 5.03
UBAP2L-209ENST00000437652 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.47■■■■■ 5.03
UBAP2L-209ENST00000437652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.03
UBAP2L-209ENST00000437652 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.39■■■■■ 5.02
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.33■■■■■ 5.01
UBAP2L-209ENST00000437652 SYNJ2O15056 1496 aa46.3■■■■■ 5
UBAP2L-209ENST00000437652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.28■■■■■ 5
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UBAP2L-209ENST00000437652 SYNJ1O43426 1573 aa46.25■■■■■ 4.99
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.18■■■■■ 4.98
UBAP2L-209ENST00000437652 ARAP1Q96P48 1450 aa46.18■■■■■ 4.98
UBAP2L-209ENST00000437652 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.17■■■■■ 4.98
UBAP2L-209ENST00000437652 TOP2BQ02880 1626 aa46.17■■■■■ 4.98
UBAP2L-209ENST00000437652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.14■■■■■ 4.98
UBAP2L-209ENST00000437652 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
UBAP2L-209ENST00000437652 GRIN2AQ12879 1464 aa45.87■■■■■ 4.93
UBAP2L-209ENST00000437652 ADAMTS12P58397 1594 aa45.81■■■■■ 4.92
UBAP2L-209ENST00000437652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.81■■■■■ 4.92
UBAP2L-209ENST00000437652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.77■■■■■ 4.92
UBAP2L-209ENST00000437652 NUP160Q12769 1436 aa45.69■■■■■ 4.9
UBAP2L-209ENST00000437652 CEP170Q5SW79 1584 aa45.65■■■■■ 4.9
UBAP2L-209ENST00000437652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.5■■■■■ 4.87
UBAP2L-209ENST00000437652 SHROOM2Q13796 1616 aa45.41■■■■■ 4.86
UBAP2L-209ENST00000437652 JPH4Q96JJ6 628 aa45.41■■■■■ 4.86
UBAP2L-209ENST00000437652 KIF27Q86VH2 1401 aa45.37■■■■■ 4.85
UBAP2L-209ENST00000437652 IGF1RP08069 1367 aa45.33■■■■■ 4.85
UBAP2L-209ENST00000437652 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
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