RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF3BO15066 747 aa29.38■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.36■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNRQ92752 1358 aa29.35■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCOA2Q15596 1464 aa29.34■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.34■■■□□ 2.29
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 PZPP20742 1482 aa29.31■■■□□ 2.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.3■■■□□ 2.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.3■■■□□ 2.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.29■■■□□ 2.28
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.26■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.22■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPY4P0CV99 314 aa29.22■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPY10P0CW01 314 aa29.22■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 MIA2Q96PC5 1412 aa29.2■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 CPS1P31327 1500 aa29.2■■■□□ 2.27
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.2■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.2■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLRP1Q9C000 1473 aa29.19■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIP4K2BP78356 416 aa29.18■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.17■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 TOM1O60784 492 aa29.15■■■□□ 2.26
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.12■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSPA1LP34931 641 aa29.12■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.12■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 DEPDC5O75140 1603 aa29.11■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCC3O15438 1527 aa29.1■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 MED14O60244 1454 aa29.09■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.09■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.08■■■□□ 2.25
UPK3BP1-201ENST00000428678 IQGAP1P46940 1657 aa29.06■■■□□ 2.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERVK-7P63135 1459 aa29.03■■■□□ 2.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 MROH1Q8NDA8 1641 aa29■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP152O94986 1710 aa29■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.98■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALKQ9UM73 1620 aa28.96■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.96■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.96■■■□□ 2.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K1Q13233 1512 aa28.94■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.94■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.93■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.93■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYNMO15061 1565 aa28.91■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF15Q9NS87 1388 aa28.88■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.84■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.84■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 LTKP29376 864 aa28.83■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.83■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.83■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERBINQ96RT1 1412 aa28.83■■■□□ 2.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.82■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLIT1O75093 1534 aa28.82■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCC5O15440 1437 aa28.81■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.8■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 EID1Q9Y6B2 187 aa28.8■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIK3C2BO00750 1634 aa28.76■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 KANK1Q14678 1352 aa28.76■■■□□ 2.2
UPK3BP1-201ENST00000428678 APLP2Q06481 763 aa28.75■■■□□ 2.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.75■■■□□ 2.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 DAPK1P53355 1430 aa28.75■■■□□ 2.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.72■■■□□ 2.19
UPK3BP1-201ENST00000428678 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.69■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.69■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.68■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.67■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.65■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 IDI1Q13907 227 aa28.65■■■□□ 2.18
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM94Q12767 1356 aa28.61■■■□□ 2.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.59■■■□□ 2.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNA6P17658 529 aa28.58■■■□□ 2.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.58■■■□□ 2.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGRB3O60242 1522 aa28.57■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 TET3O43151 1660 aa28.56■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOS1P29475 1434 aa28.56■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCANQ96GW7 911 aa28.53■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.51■■■□□ 2.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGRL2O95490 1459 aa28.51■■■□□ 2.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.51■■■□□ 2.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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