RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.1■■■■□ 3.05
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NME4-201ENST00000219479 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
NME4-201ENST00000219479 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.07■■■■□ 3.05
NME4-201ENST00000219479 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.07■■■■□ 3.05
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NME4-201ENST00000219479 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.03■■■■□ 3.04
NME4-201ENST00000219479 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.02■■■■□ 3.04
NME4-201ENST00000219479 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.01■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 KIF3BO15066 747 aa34■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 TSPY4P0CV99 314 aa34■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 TSPY10P0CW01 314 aa34■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 PZPP20742 1482 aa33.99■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.98■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 MIA2Q96PC5 1412 aa33.97■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 TNRQ92752 1358 aa33.96■■■■□ 3.03
NME4-201ENST00000219479 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
NME4-201ENST00000219479 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.94■■■■□ 3.02
NME4-201ENST00000219479 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.91■■■■□ 3.02
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NME4-201ENST00000219479 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.83■■■■□ 3.01
NME4-201ENST00000219479 NLRP1Q9C000 1473 aa33.82■■■■□ 3
NME4-201ENST00000219479 CPS1P31327 1500 aa33.79■■■■□ 3
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NME4-201ENST00000219479 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.76■■■□□ 2.99
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NME4-201ENST00000219479 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.75■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.75■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.73■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.73■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 MED14O60244 1454 aa33.71■■■□□ 2.99
NME4-201ENST00000219479 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 CEP152O94986 1710 aa33.69■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 IQGAP1P46940 1657 aa33.68■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 ERVK-7P63135 1459 aa33.67■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 ABCC5O15440 1437 aa33.66■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 DAPK1P53355 1430 aa33.64■■■□□ 2.98
NME4-201ENST00000219479 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
NME4-201ENST00000219479 KIF15Q9NS87 1388 aa33.61■■■□□ 2.97
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NME4-201ENST00000219479 TOM1O60784 492 aa33.6■■■□□ 2.97
NME4-201ENST00000219479 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.6■■■□□ 2.97
NME4-201ENST00000219479 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.59■■■□□ 2.97
NME4-201ENST00000219479 HSPA1LP34931 641 aa33.59■■■□□ 2.97
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NME4-201ENST00000219479 ALKQ9UM73 1620 aa33.58■■■□□ 2.97
NME4-201ENST00000219479 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.56■■■□□ 2.96
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NME4-201ENST00000219479 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
NME4-201ENST00000219479 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.53■■■□□ 2.96
NME4-201ENST00000219479 ERBINQ96RT1 1412 aa33.51■■■□□ 2.95
NME4-201ENST00000219479 SYNMO15061 1565 aa33.51■■■□□ 2.95
NME4-201ENST00000219479 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.48■■■□□ 2.95
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.46■■■□□ 2.95
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NME4-201ENST00000219479 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.44■■■□□ 2.94
NME4-201ENST00000219479 SLIT1O75093 1534 aa33.43■■■□□ 2.94
NME4-201ENST00000219479 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
NME4-201ENST00000219479 PIK3C2BO00750 1634 aa33.39■■■□□ 2.94
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NME4-201ENST00000219479 ADGRL2O95490 1459 aa33.36■■■□□ 2.93
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NME4-201ENST00000219479 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
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NME4-201ENST00000219479 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
NME4-201ENST00000219479 EID1Q9Y6B2 187 aa33.25■■■□□ 2.91
NME4-201ENST00000219479 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.19■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 ROCK1Q13464 1354 aa33.18■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 IDI1Q13907 227 aa33.17■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 NOS1P29475 1434 aa33.17■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 ADGRB3O60242 1522 aa33.16■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 TET3O43151 1660 aa33.14■■■□□ 2.9
NME4-201ENST00000219479 TMEM94Q12767 1356 aa33.09■■■□□ 2.89
NME4-201ENST00000219479 NWD1Q149M9 1564 aa33.06■■■□□ 2.88
NME4-201ENST00000219479 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.06■■■□□ 2.88
NME4-201ENST00000219479 KCNA6P17658 529 aa33.05■■■□□ 2.88
NME4-201ENST00000219479 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.05■■■□□ 2.88
NME4-201ENST00000219479 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.04■■■□□ 2.88
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