RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001700.6

Hoxc13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc13, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lekr1B2RVN1 116 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chic2Q9D9G3 165 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Setbp1Q9Z180 1582 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trim44Q9QXA7 346 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Erbb4Q61527 1308 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Shroom4Q1W617 1475 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zscan21Q07231 555 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 TnnQ80Z71 1560 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mtus2Q3UHD3 1353 aa28.76■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.75■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dnajc14Q921R4 703 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CadpsQ80TJ1 1355 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ssh1Q76I79 1042 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gys2Q8VCB3 704 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dcaf11Q91VU6 549 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ttc41Q692V3 1318 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 SlkO54988 1233 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gse1Q3U3C9 1213 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pkd2O35245 966 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tshz2Q68FE9 1030 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 VgfQ0VGU4 617 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Q7TT23 1179 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fbxo2Q80UW2 297 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dapk1Q80YE7 1442 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mknk2Q8CDB0 459 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cux1P53564 1515 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mug1P28665 1476 aa28.57■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Naip6Q9JIB6 1403 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rundc1Q0VDN7 615 aa28.56■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Apbb1Q9QXJ1 710 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Catsper2A2ARP9 588 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plcb2A3KGF7 1181 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rabep1O35551 862 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif16bB1AVY7 1312 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pik3c2gO70167 1506 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mbd5B1AYB6 1498 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Card11Q8CIS0 1159 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmem132aQ922P8 1018 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pdcl2Q78Y63 240 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm14025A2AP89 1413 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ush1cQ9ES64 910 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccnb3Q810T2 1396 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CrbnQ8C7D2 445 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zfp644E9QA22 1323 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kiaa0753Q6A000 959 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tspyl2Q7TQI8 677 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mug2P28666 1451 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ddit3P35639 168 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Esx1O88933 382 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sox12Q04890 314 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rgl3Q3UYI5 709 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Stac3Q8BZ71 360 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Terf2O35144 541 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Erich6bQ9D4S6 220 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Soga1E1U8D0 1418 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Aebp1Q640N1 1128 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc94Q9D6J3 314 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28.29■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rock1P70335 1354 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ift140E9PY46 1464 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Becn1O88597 448 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zhx1P70121 873 aa28.26■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gzf1Q4VBD9 706 aa28.26■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.26■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plcd3Q8K2J0 785 aa28.25■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fam13bQ8K2H3 851 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif27Q7M6Z4 1394 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fez1Q8K0X8 392 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa28.22■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pnma3Q8JZW8 466 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Carmil1Q6EDY6 1374 aa28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.1 ms