Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Catsper2A2ARP9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Catsper2A2ARP9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Catsper2A2ARP9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Catsper2A2ARP9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Catsper2A2ARP9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Catsper2A2ARP9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Catsper2A2ARP9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Catsper2A2ARP9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Catsper2A2ARP9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Catsper2A2ARP9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Catsper2A2ARP9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Catsper2A2ARP9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Catsper2A2ARP9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Catsper2A2ARP9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Catsper2A2ARP9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Catsper2A2ARP9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Catsper2A2ARP9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Catsper2A2ARP9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Catsper2A2ARP9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Catsper2A2ARP9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Catsper2A2ARP9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Catsper2A2ARP9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Catsper2A2ARP9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Catsper2A2ARP9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Catsper2A2ARP9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Catsper2A2ARP9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Catsper2A2ARP9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Catsper2A2ARP9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Catsper2A2ARP9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Catsper2A2ARP9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Catsper2A2ARP9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Catsper2A2ARP9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Catsper2A2ARP9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Catsper2A2ARP9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Catsper2A2ARP9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Catsper2A2ARP9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Catsper2A2ARP9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Catsper2A2ARP9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Catsper2A2ARP9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Catsper2A2ARP9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Catsper2A2ARP9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Catsper2A2ARP9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Catsper2A2ARP9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Catsper2A2ARP9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Catsper2A2ARP9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Catsper2A2ARP9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Catsper2A2ARP9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Catsper2A2ARP9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Catsper2A2ARP9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Catsper2A2ARP9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Catsper2A2ARP9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Catsper2A2ARP9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Catsper2A2ARP9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Catsper2A2ARP9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Catsper2A2ARP9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Catsper2A2ARP9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Catsper2A2ARP9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Catsper2A2ARP9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Catsper2A2ARP9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Catsper2A2ARP9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Catsper2A2ARP9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Catsper2A2ARP9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Catsper2A2ARP9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Catsper2A2ARP9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Catsper2A2ARP9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Catsper2A2ARP9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Catsper2A2ARP9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Catsper2A2ARP9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Catsper2A2ARP9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Catsper2A2ARP9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Catsper2A2ARP9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Catsper2A2ARP9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Catsper2A2ARP9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Catsper2A2ARP9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Catsper2A2ARP9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Catsper2A2ARP9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Catsper2A2ARP9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Catsper2A2ARP9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Catsper2A2ARP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Catsper2A2ARP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Catsper2A2ARP9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Catsper2A2ARP9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Catsper2A2ARP9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Catsper2A2ARP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Catsper2A2ARP9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Catsper2A2ARP9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Catsper2A2ARP9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Catsper2A2ARP9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Catsper2A2ARP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Catsper2A2ARP9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Catsper2A2ARP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Catsper2A2ARP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Catsper2A2ARP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Catsper2A2ARP9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Catsper2A2ARP9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Catsper2A2ARP9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Catsper2A2ARP9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Catsper2A2ARP9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Catsper2A2ARP9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms