Protein–RNA interactions for Protein: O35144

Terf2, Telomeric repeat-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Terf2O35144 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Terf2O35144 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Terf2O35144 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Terf2O35144 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Terf2O35144 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Terf2O35144 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Terf2O35144 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Terf2O35144 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Terf2O35144 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Terf2O35144 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Terf2O35144 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Terf2O35144 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Terf2O35144 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Terf2O35144 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Terf2O35144 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Terf2O35144 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Terf2O35144 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Terf2O35144 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Terf2O35144 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Terf2O35144 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Terf2O35144 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Terf2O35144 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Terf2O35144 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Terf2O35144 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Terf2O35144 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Terf2O35144 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Terf2O35144 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Terf2O35144 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Terf2O35144 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Terf2O35144 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Terf2O35144 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Terf2O35144 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Terf2O35144 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Terf2O35144 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Terf2O35144 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Terf2O35144 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Terf2O35144 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Terf2O35144 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Terf2O35144 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Terf2O35144 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Terf2O35144 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Terf2O35144 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Terf2O35144 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Terf2O35144 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Terf2O35144 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Terf2O35144 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Terf2O35144 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Terf2O35144 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Terf2O35144 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Terf2O35144 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Terf2O35144 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Terf2O35144 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Terf2O35144 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Terf2O35144 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Terf2O35144 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Terf2O35144 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Terf2O35144 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Terf2O35144 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Terf2O35144 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Terf2O35144 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Terf2O35144 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Terf2O35144 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Terf2O35144 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Terf2O35144 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Terf2O35144 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Terf2O35144 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Terf2O35144 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Terf2O35144 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Terf2O35144 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Terf2O35144 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Terf2O35144 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Terf2O35144 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Terf2O35144 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Terf2O35144 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Terf2O35144 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Terf2O35144 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Terf2O35144 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Terf2O35144 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Terf2O35144 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Terf2O35144 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Terf2O35144 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Terf2O35144 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Terf2O35144 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Terf2O35144 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Terf2O35144 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Terf2O35144 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Terf2O35144 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Terf2O35144 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Terf2O35144 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Terf2O35144 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Terf2O35144 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Terf2O35144 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Terf2O35144 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Terf2O35144 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Terf2O35144 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Terf2O35144 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Terf2O35144 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Terf2O35144 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Terf2O35144 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Terf2O35144 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms