Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J0

Plcd3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcd3Q8K2J0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Plcd3Q8K2J0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Plcd3Q8K2J0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Plcd3Q8K2J0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Plcd3Q8K2J0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Plcd3Q8K2J0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Plcd3Q8K2J0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Plcd3Q8K2J0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Plcd3Q8K2J0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Plcd3Q8K2J0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Plcd3Q8K2J0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Plcd3Q8K2J0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Plcd3Q8K2J0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Plcd3Q8K2J0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Plcd3Q8K2J0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Plcd3Q8K2J0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Plcd3Q8K2J0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Plcd3Q8K2J0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Plcd3Q8K2J0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Plcd3Q8K2J0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Plcd3Q8K2J0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Plcd3Q8K2J0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Plcd3Q8K2J0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Plcd3Q8K2J0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Plcd3Q8K2J0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Plcd3Q8K2J0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Plcd3Q8K2J0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Plcd3Q8K2J0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Plcd3Q8K2J0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Plcd3Q8K2J0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Plcd3Q8K2J0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Plcd3Q8K2J0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Plcd3Q8K2J0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Plcd3Q8K2J0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Plcd3Q8K2J0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Plcd3Q8K2J0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Plcd3Q8K2J0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Plcd3Q8K2J0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Plcd3Q8K2J0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Plcd3Q8K2J0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Plcd3Q8K2J0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Plcd3Q8K2J0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Plcd3Q8K2J0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Plcd3Q8K2J0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Plcd3Q8K2J0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Plcd3Q8K2J0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Plcd3Q8K2J0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Plcd3Q8K2J0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Plcd3Q8K2J0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Plcd3Q8K2J0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Plcd3Q8K2J0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Plcd3Q8K2J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Plcd3Q8K2J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Plcd3Q8K2J0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Plcd3Q8K2J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Plcd3Q8K2J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Plcd3Q8K2J0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Plcd3Q8K2J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Plcd3Q8K2J0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Plcd3Q8K2J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Plcd3Q8K2J0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Plcd3Q8K2J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Plcd3Q8K2J0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Plcd3Q8K2J0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plcd3Q8K2J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Plcd3Q8K2J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Plcd3Q8K2J0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Plcd3Q8K2J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Plcd3Q8K2J0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Plcd3Q8K2J0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Plcd3Q8K2J0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Plcd3Q8K2J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Plcd3Q8K2J0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Plcd3Q8K2J0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Plcd3Q8K2J0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Plcd3Q8K2J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Plcd3Q8K2J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Plcd3Q8K2J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Plcd3Q8K2J0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Plcd3Q8K2J0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Plcd3Q8K2J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Plcd3Q8K2J0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Plcd3Q8K2J0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Plcd3Q8K2J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Plcd3Q8K2J0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Plcd3Q8K2J0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Plcd3Q8K2J0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Plcd3Q8K2J0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Plcd3Q8K2J0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Plcd3Q8K2J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Plcd3Q8K2J0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Plcd3Q8K2J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Plcd3Q8K2J0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Plcd3Q8K2J0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Plcd3Q8K2J0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Plcd3Q8K2J0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Plcd3Q8K2J0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Plcd3Q8K2J0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Plcd3Q8K2J0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Plcd3Q8K2J0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms