Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
Ddit3P35639 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ddit3P35639 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ddit3P35639 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ddit3P35639 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ddit3P35639 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ddit3P35639 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Ddit3P35639 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ddit3P35639 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ddit3P35639 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ddit3P35639 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ddit3P35639 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Ddit3P35639 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ddit3P35639 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ddit3P35639 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ddit3P35639 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ddit3P35639 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ddit3P35639 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Ddit3P35639 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ddit3P35639 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ddit3P35639 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ddit3P35639 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ddit3P35639 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ddit3P35639 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ddit3P35639 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ddit3P35639 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Ddit3P35639 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ddit3P35639 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ddit3P35639 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ddit3P35639 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Ddit3P35639 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ddit3P35639 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ddit3P35639 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ddit3P35639 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ddit3P35639 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ddit3P35639 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ddit3P35639 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ddit3P35639 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ddit3P35639 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ddit3P35639 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ddit3P35639 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ddit3P35639 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ddit3P35639 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ddit3P35639 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ddit3P35639 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ddit3P35639 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ddit3P35639 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ddit3P35639 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ddit3P35639 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Ddit3P35639 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ddit3P35639 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ddit3P35639 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ddit3P35639 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ddit3P35639 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ddit3P35639 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ddit3P35639 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ddit3P35639 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ddit3P35639 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ddit3P35639 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ddit3P35639 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ddit3P35639 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Ddit3P35639 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ddit3P35639 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ddit3P35639 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ddit3P35639 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ddit3P35639 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ddit3P35639 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ddit3P35639 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ddit3P35639 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ddit3P35639 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ddit3P35639 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ddit3P35639 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ddit3P35639 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ddit3P35639 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ddit3P35639 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ddit3P35639 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ddit3P35639 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ddit3P35639 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ddit3P35639 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ddit3P35639 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ddit3P35639 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ddit3P35639 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ddit3P35639 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ddit3P35639 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ddit3P35639 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ddit3P35639 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ddit3P35639 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ddit3P35639 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ddit3P35639 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ddit3P35639 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ddit3P35639 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ddit3P35639 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ddit3P35639 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ddit3P35639 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ddit3P35639 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ddit3P35639 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ddit3P35639 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ddit3P35639 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ddit3P35639 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ddit3P35639 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms