RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	LDS2	Q08218	356 aa		1.72	□□□□□ -2.13
VAR1	Q0140	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		1.72	□□□□□ -2.13
VAR1	Q0140	BRF1	P29056	596 aa		1.71	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	DBF4	P32325	704 aa		1.71	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ANP1	P32629	500 aa		1.71	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RTS3	P53289	263 aa		1.71	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	1.71	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	LDS1	P31379	325 aa		1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	BIO3	P50277	480 aa		1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	NRM1	P53718	249 aa		1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MRX11	Q03079	207 aa		1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	DON1	Q05610	365 aa		1.7	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	TIR2	P33890	251 aa		1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	IRC6	P43615	237 aa		1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YDR131C	Q03899	556 aa		1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RUP1	Q12242	671 aa		1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RTN2	Q12443	393 aa		1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	1.69	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RPS23B	P0CX30	145 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	UNG1	P12887	359 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YPS1	P32329	569 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ATG12	P38316	186 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	GEP4	P38812	185 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	UFE1	P41834	346 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	CIN2	P46670	268 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	FSH2	Q05015	223 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YOP1	Q12402	180 aa		1.68	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	CLB1	P24868	471 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	TKL2	P33315	681 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	SHE1	P38200	338 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	STE24	P47154	453 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YGR015C	P53208	328 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	SED5	Q01590	340 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YMR010W	Q03687	405 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ACL4	Q03771	387 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	YMR155W	Q03795	547 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MED2	Q12124	431 aa		1.67	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	STE2	D6VTK4	431 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MRP7	P12687	371 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	RRN9	P53437	365 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	ATP16	Q12165	160 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MED1	Q12321	566 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	FLO11	P08640	1367 aa		1.66	□□□□□ -2.14
VAR1	Q0140	MKK1	P32490	508 aa		1.65	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	COS9	P36034	407 aa		1.65	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	RBG1	P39729	369 aa		1.65	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	TOS2	P50078	622 aa		1.65	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	MTR10	Q99189	972 aa		1.65	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	CDC21	P06785	304 aa		1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	TOM22	P49334	152 aa		1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	PIB2	P53191	635 aa		1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	RGM1	Q00453	211 aa		1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	YDL211C	Q12121	372 aa		1.64	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	INM1	P38710	295 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	BDH1	P39714	382 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ATM1	P40416	690 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	YJR054W	P47114	497 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	MIX17	Q03667	156 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ISN1	Q99312	450 aa		1.63	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	TPK3	P05986	398 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	SNF6	P18888	332 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	SAG1	P20840	650 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	STN1	P38960	494 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	YGL088W	P53151	121 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	CDH1	P53197	566 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	MRPL19	P53875	158 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	API2	Q04413	109 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	YOL029C	Q08187	201 aa		1.62	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	HEM4	P06174	275 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	COX10	P21592	462 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	REC107	P21651	314 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ERG3	P32353	365 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ABM1	P47146	123 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	MMR1	Q06324	491 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	FRE8	Q12209	686 aa		1.61	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	CUP2	P15315	225 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	MIG1	P27705	504 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ECM14	P38836	430 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	VHS2	P40463	436 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	APC4	Q04601	652 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	ROY1	Q04847	553 aa		1.6	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	YRF1-4	O13559	1382 aa		1.59	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	RED1	P14291	827 aa		1.59	□□□□□ -2.15
VAR1	Q0140	CPT1	P17898	393 aa		1.59	□□□□□ -2.15

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