Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 NSR1YGR159C 1245 nt18.34■□□□□ 0.53
RRN9P53437 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.2■□□□□ 0.5
RRN9P53437 NOP1YDL014W 984 nt17.62■□□□□ 0.41
RRN9P53437 MDJ1YFL016C 1536 nt16.48■□□□□ 0.23
RRN9P53437 YKL036CYKL036C 393 nt16.05■□□□□ 0.16
RRN9P53437 SRX1YKL086W 384 nt15.41■□□□□ 0.06
RRN9P53437 Q0297Q0297 156 nt15.38■□□□□ 0.05
RRN9P53437 YJL027CYJL027C 417 nt15.18■□□□□ 0.02
RRN9P53437 YCR051WYCR051W 669 nt14.57□□□□□ -0.08
RRN9P53437 DBP2YNL112W 1641 nt14.52□□□□□ -0.08
RRN9P53437 SCS3YGL126W 1143 nt14.49□□□□□ -0.09
RRN9P53437 YBR190WYBR190W 312 nt14.18□□□□□ -0.14
RRN9P53437 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
RRN9P53437 YOL085CYOL085C 342 nt13.93□□□□□ -0.18
RRN9P53437 CCC1YLR220W 969 nt13.9□□□□□ -0.18
RRN9P53437 RTC3YHR087W 336 nt13.82□□□□□ -0.2
RRN9P53437 RPP1BYDL130W 321 nt13.79□□□□□ -0.2
RRN9P53437 PKP1YIL042C 1185 nt13.71□□□□□ -0.21
RRN9P53437 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
RRN9P53437 RVS167YDR388W 1449 nt13.55□□□□□ -0.24
RRN9P53437 SCJ1YMR214W 1134 nt13.46□□□□□ -0.25
RRN9P53437 PUT4YOR348C 1884 nt13.26□□□□□ -0.29
RRN9P53437 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.23□□□□□ -0.29
RRN9P53437 PET122YER153C 765 nt13.2□□□□□ -0.3
RRN9P53437 SHR5YOL110W 714 nt13.04□□□□□ -0.32
RRN9P53437 SCR1SCR1 522 nt12.97□□□□□ -0.33
RRN9P53437 ATS1YAL020C 1002 nt12.9□□□□□ -0.34
RRN9P53437 ARE1YCR048W 1833 nt12.85□□□□□ -0.35
RRN9P53437 YDJ1YNL064C 1230 nt12.82□□□□□ -0.36
RRN9P53437 URN1YPR152C 1398 nt12.81□□□□□ -0.36
RRN9P53437 RRN5YLR141W 1092 nt12.8□□□□□ -0.36
RRN9P53437 POA1YBR022W 534 nt12.8□□□□□ -0.36
RRN9P53437 DEP1YAL013W 1218 nt12.74□□□□□ -0.37
RRN9P53437 SAH1YER043C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
RRN9P53437 OPI9YLR338W 858 nt12.7□□□□□ -0.38
RRN9P53437 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.69□□□□□ -0.38
RRN9P53437 BSC6YOL137W 1494 nt12.62□□□□□ -0.39
RRN9P53437 RPN10YHR200W 807 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN9P53437 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.55□□□□□ -0.4
RRN9P53437 GAR1YHR089C 618 nt12.54□□□□□ -0.4
RRN9P53437 YNL208WYNL208W 600 nt12.53□□□□□ -0.4
RRN9P53437 RSB1YOR049C 1065 nt12.44□□□□□ -0.42
RRN9P53437 SPT5YML010W 3192 nt12.43□□□□□ -0.42
RRN9P53437 BUD23YCR047C 828 nt12.35□□□□□ -0.43
RRN9P53437 PUN1YLR414C 792 nt12.32□□□□□ -0.44
RRN9P53437 SSA4YER103W 1929 nt12.24□□□□□ -0.45
RRN9P53437 PTC2YER089C 1395 nt12.23□□□□□ -0.45
RRN9P53437 YJR018WYJR018W 363 nt12.22□□□□□ -0.45
RRN9P53437 NAB2YGL122C 1578 nt12.17□□□□□ -0.46
RRN9P53437 TIR1YER011W 765 nt12.14□□□□□ -0.47
RRN9P53437 SSA1YAL005C 1929 nt12.06□□□□□ -0.48
RRN9P53437 YJR120WYJR120W 351 nt12.02□□□□□ -0.49
RRN9P53437 PST2YDR032C 597 nt12.01□□□□□ -0.49
RRN9P53437 FIS1YIL065C 468 nt11.93□□□□□ -0.5
RRN9P53437 MEP2YNL142W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
RRN9P53437 DAL1YIR027C 1383 nt11.9□□□□□ -0.5
RRN9P53437 RPP2BYDR382W 333 nt11.88□□□□□ -0.51
RRN9P53437 SRB2YHR041C 633 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN9P53437 FPR4YLR449W 1179 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN9P53437 INM2YDR287W 879 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN9P53437 BDF1YLR399C 2061 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN9P53437 PHO4YFR034C 939 nt11.78□□□□□ -0.52
RRN9P53437 YPS1YLR120C 1710 nt11.74□□□□□ -0.53
RRN9P53437 DCW1YKL046C 1350 nt11.69□□□□□ -0.54
RRN9P53437 TAT1YBR069C 1860 nt11.66□□□□□ -0.54
RRN9P53437 YBL100CYBL100C 315 nt11.65□□□□□ -0.54
RRN9P53437 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN9P53437 BDH2YAL061W 1254 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN9P53437 YDR095CYDR095C 411 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN9P53437 WWM1YFL010C 636 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN9P53437 SHU1YHL006C 453 nt11.56□□□□□ -0.56
RRN9P53437 EMI2YDR516C 1503 nt11.55□□□□□ -0.56
RRN9P53437 YMR090WYMR090W 684 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN9P53437 FUN26YAL022C 1554 nt11.52□□□□□ -0.57
RRN9P53437 YBR220CYBR220C 1683 nt11.5□□□□□ -0.57
RRN9P53437 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.45□□□□□ -0.58
RRN9P53437 LSM3YLR438C-A 270 nt11.45□□□□□ -0.58
RRN9P53437 TRM9YML014W 840 nt11.45□□□□□ -0.58
RRN9P53437 YGR021WYGR021W 873 nt11.43□□□□□ -0.58
RRN9P53437 YDL221WYDL221W 552 nt11.42□□□□□ -0.58
RRN9P53437 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.4□□□□□ -0.58
RRN9P53437 HOM6YJR139C 1080 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN9P53437 PAC11YDR488C 1602 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN9P53437 RPP2AYOL039W 321 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN9P53437 SDH1YKL148C 1923 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN9P53437 PTP1YDL230W 1008 nt11.37□□□□□ -0.59
RRN9P53437 YKL097CYKL097C 411 nt11.37□□□□□ -0.59
RRN9P53437 ALF1YNL148C 765 nt11.37□□□□□ -0.59
RRN9P53437 CCT6YDR188W 1641 nt11.36□□□□□ -0.59
RRN9P53437 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN9P53437 MNP1YGL068W 585 nt11.28□□□□□ -0.6
RRN9P53437 SIS1YNL007C 1059 nt11.26□□□□□ -0.61
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