Protein–RNA interactions for Protein: P31539

HSP104, Heat shock protein 104, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP104P31539 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.37■■□□□ 1.81
HSP104P31539 NSR1YGR159C 1245 nt25.91■■□□□ 1.74
HSP104P31539 NOP1YDL014W 984 nt25.7■■□□□ 1.7
HSP104P31539 YKL036CYKL036C 393 nt24.05■■□□□ 1.44
HSP104P31539 MDJ1YFL016C 1536 nt22.75■■□□□ 1.23
HSP104P31539 Q0297Q0297 156 nt22.64■■□□□ 1.21
HSP104P31539 YJL027CYJL027C 417 nt22.5■■□□□ 1.19
HSP104P31539 SRX1YKL086W 384 nt22.5■■□□□ 1.19
HSP104P31539 SCS3YGL126W 1143 nt22.07■■□□□ 1.12
HSP104P31539 YCR051WYCR051W 669 nt21.38■■□□□ 1.01
HSP104P31539 YOL085CYOL085C 342 nt20.84■□□□□ 0.93
HSP104P31539 PKP1YIL042C 1185 nt20.51■□□□□ 0.87
HSP104P31539 RPP1BYDL130W 321 nt20.32■□□□□ 0.84
HSP104P31539 DBP2YNL112W 1641 nt20.29■□□□□ 0.84
HSP104P31539 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.17■□□□□ 0.82
HSP104P31539 CCC1YLR220W 969 nt19.98■□□□□ 0.79
HSP104P31539 SCJ1YMR214W 1134 nt19.9■□□□□ 0.78
HSP104P31539 ATS1YAL020C 1002 nt19.82■□□□□ 0.76
HSP104P31539 PET122YER153C 765 nt19.4■□□□□ 0.7
HSP104P31539 YBR190WYBR190W 312 nt19.28■□□□□ 0.68
HSP104P31539 SCR1SCR1 522 nt19.23■□□□□ 0.67
HSP104P31539 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.19■□□□□ 0.66
HSP104P31539 RVS167YDR388W 1449 nt19.05■□□□□ 0.64
HSP104P31539 RTC3YHR087W 336 nt18.87■□□□□ 0.61
HSP104P31539 RRN5YLR141W 1092 nt18.87■□□□□ 0.61
HSP104P31539 RSB1YOR049C 1065 nt18.56■□□□□ 0.56
HSP104P31539 YDJ1YNL064C 1230 nt18.54■□□□□ 0.56
HSP104P31539 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.5■□□□□ 0.55
HSP104P31539 SHR5YOL110W 714 nt18.5■□□□□ 0.55
HSP104P31539 PST2YDR032C 597 nt18.32■□□□□ 0.52
HSP104P31539 GAR1YHR089C 618 nt18.1■□□□□ 0.49
HSP104P31539 DEP1YAL013W 1218 nt17.9■□□□□ 0.46
HSP104P31539 URN1YPR152C 1398 nt17.8■□□□□ 0.44
HSP104P31539 YKL097CYKL097C 411 nt17.73■□□□□ 0.43
HSP104P31539 YNL208WYNL208W 600 nt17.61■□□□□ 0.41
HSP104P31539 RPN10YHR200W 807 nt17.55■□□□□ 0.4
HSP104P31539 SHU1YHL006C 453 nt17.52■□□□□ 0.4
HSP104P31539 TIR1YER011W 765 nt17.48■□□□□ 0.39
HSP104P31539 OPI9YLR338W 858 nt17.47■□□□□ 0.39
HSP104P31539 SAH1YER043C 1350 nt17.31■□□□□ 0.36
HSP104P31539 PUT4YOR348C 1884 nt17.31■□□□□ 0.36
HSP104P31539 SSA1YAL005C 1929 nt17.23■□□□□ 0.35
HSP104P31539 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.17■□□□□ 0.34
HSP104P31539 ARE1YCR048W 1833 nt17.1■□□□□ 0.33
HSP104P31539 SRB2YHR041C 633 nt17.05■□□□□ 0.32
HSP104P31539 YJR018WYJR018W 363 nt17■□□□□ 0.31
HSP104P31539 YOR139CYOR139C 393 nt17■□□□□ 0.31
HSP104P31539 PUN1YLR414C 792 nt16.94■□□□□ 0.3
HSP104P31539 YJR120WYJR120W 351 nt16.85■□□□□ 0.29
HSP104P31539 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.84■□□□□ 0.29
HSP104P31539 POA1YBR022W 534 nt16.8■□□□□ 0.28
HSP104P31539 WWM1YFL010C 636 nt16.78■□□□□ 0.28
HSP104P31539 NPL3YDR432W 1245 nt16.74■□□□□ 0.27
HSP104P31539 MNP1YGL068W 585 nt16.72■□□□□ 0.27
HSP104P31539 YGR021WYGR021W 873 nt16.72■□□□□ 0.27
HSP104P31539 HOM6YJR139C 1080 nt16.72■□□□□ 0.27
HSP104P31539 PTC2YER089C 1395 nt16.71■□□□□ 0.27
HSP104P31539 RPP2BYDR382W 333 nt16.7■□□□□ 0.26
HSP104P31539 SSA3YBL075C 1950 nt16.51■□□□□ 0.23
HSP104P31539 YOL037CYOL037C 354 nt16.5■□□□□ 0.23
HSP104P31539 BUD23YCR047C 828 nt16.48■□□□□ 0.23
HSP104P31539 RKM5YLR137W 1104 nt16.47■□□□□ 0.23
HSP104P31539 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.46■□□□□ 0.23
HSP104P31539 BDH2YAL061W 1254 nt16.46■□□□□ 0.23
HSP104P31539 NAB2YGL122C 1578 nt16.44■□□□□ 0.22
HSP104P31539 BSC6YOL137W 1494 nt16.35■□□□□ 0.21
HSP104P31539 INM2YDR287W 879 nt16.33■□□□□ 0.2
HSP104P31539 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.32■□□□□ 0.2
HSP104P31539 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.32■□□□□ 0.2
HSP104P31539 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.32■□□□□ 0.2
HSP104P31539 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.32■□□□□ 0.2
HSP104P31539 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.32■□□□□ 0.2
HSP104P31539 LSM3YLR438C-A 270 nt16.29■□□□□ 0.2
HSP104P31539 DAL1YIR027C 1383 nt16.28■□□□□ 0.2
HSP104P31539 FIS1YIL065C 468 nt16.25■□□□□ 0.19
HSP104P31539 FPR4YLR449W 1179 nt16.25■□□□□ 0.19
HSP104P31539 YBL100CYBL100C 315 nt16.24■□□□□ 0.19
HSP104P31539 PHO4YFR034C 939 nt16.13■□□□□ 0.17
HSP104P31539 YLR281CYLR281C 468 nt16.13■□□□□ 0.17
HSP104P31539 PUS2YGL063W 1113 nt16.09■□□□□ 0.17
HSP104P31539 TRM9YML014W 840 nt16.09■□□□□ 0.17
HSP104P31539 FUN26YAL022C 1554 nt16.07■□□□□ 0.16
HSP104P31539 WHI5YOR083W 888 nt16.04■□□□□ 0.16
HSP104P31539 CCT6YDR188W 1641 nt15.91■□□□□ 0.14
HSP104P31539 MOT3YMR070W 1473 nt15.78■□□□□ 0.12
HSP104P31539 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.78■□□□□ 0.12
HSP104P31539 YPR011CYPR011C 981 nt15.76■□□□□ 0.11
HSP104P31539 ALF1YNL148C 765 nt15.74■□□□□ 0.11
HSP104P31539 YPS1YLR120C 1710 nt15.72■□□□□ 0.11
HSP104P31539 DSK2YMR276W 1122 nt15.72■□□□□ 0.11
HSP104P31539 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.71■□□□□ 0.11
HSP104P31539 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.71■□□□□ 0.11
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