Protein–RNA interactions for Protein: P53333

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC22P53333 NSR1YGR159C 1245 nt21.44■■□□□ 1.02
CWC22P53333 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.24■□□□□ 0.99
CWC22P53333 NOP1YDL014W 984 nt20.49■□□□□ 0.87
CWC22P53333 MDJ1YFL016C 1536 nt19.41■□□□□ 0.7
CWC22P53333 YKL036CYKL036C 393 nt18.56■□□□□ 0.56
CWC22P53333 SRX1YKL086W 384 nt17.91■□□□□ 0.46
CWC22P53333 YJL027CYJL027C 417 nt17.87■□□□□ 0.45
CWC22P53333 Q0297Q0297 156 nt17.83■□□□□ 0.44
CWC22P53333 SSA3YBL075C 1950 nt17.71■□□□□ 0.43
CWC22P53333 DBP2YNL112W 1641 nt17.03■□□□□ 0.32
CWC22P53333 YCR051WYCR051W 669 nt16.95■□□□□ 0.3
CWC22P53333 SCS3YGL126W 1143 nt16.7■□□□□ 0.26
CWC22P53333 YBR190WYBR190W 312 nt16.64■□□□□ 0.25
CWC22P53333 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.43■□□□□ 0.22
CWC22P53333 CCC1YLR220W 969 nt16.24■□□□□ 0.19
CWC22P53333 RTC3YHR087W 336 nt16.23■□□□□ 0.19
CWC22P53333 YOL085CYOL085C 342 nt16.1■□□□□ 0.17
CWC22P53333 RPP1BYDL130W 321 nt16■□□□□ 0.15
CWC22P53333 PKP1YIL042C 1185 nt15.89■□□□□ 0.13
CWC22P53333 RVS167YDR388W 1449 nt15.88■□□□□ 0.13
CWC22P53333 SCJ1YMR214W 1134 nt15.77■□□□□ 0.12
CWC22P53333 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.41■□□□□ 0.06
CWC22P53333 PUT4YOR348C 1884 nt15.41■□□□□ 0.06
CWC22P53333 PET122YER153C 765 nt15.33■□□□□ 0.04
CWC22P53333 SHR5YOL110W 714 nt15.27■□□□□ 0.04
CWC22P53333 NVJ2YPR091C 2313 nt15.22■□□□□ 0.03
CWC22P53333 FPS1YLL043W 2010 nt15.15■□□□□ 0.02
CWC22P53333 PAC11YDR488C 1602 nt15.09■□□□□ 0.01
CWC22P53333 URN1YPR152C 1398 nt15.07■□□□□ 0
CWC22P53333 SCR1SCR1 522 nt15.04■□□□□ -0
CWC22P53333 SSA1YAL005C 1929 nt15.03■□□□□ -0
CWC22P53333 ARE1YCR048W 1833 nt15.01□□□□□ -0.01
CWC22P53333 DEP1YAL013W 1218 nt14.96□□□□□ -0.01
CWC22P53333 OPI9YLR338W 858 nt14.94□□□□□ -0.02
CWC22P53333 SAH1YER043C 1350 nt14.94□□□□□ -0.02
CWC22P53333 YDJ1YNL064C 1230 nt14.92□□□□□ -0.02
CWC22P53333 POA1YBR022W 534 nt14.89□□□□□ -0.03
CWC22P53333 RRN5YLR141W 1092 nt14.85□□□□□ -0.03
CWC22P53333 ATS1YAL020C 1002 nt14.83□□□□□ -0.04
CWC22P53333 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.82□□□□□ -0.04
CWC22P53333 SSA4YER103W 1929 nt14.76□□□□□ -0.05
CWC22P53333 RPN10YHR200W 807 nt14.75□□□□□ -0.05
CWC22P53333 YNL208WYNL208W 600 nt14.68□□□□□ -0.06
CWC22P53333 BSC6YOL137W 1494 nt14.64□□□□□ -0.07
CWC22P53333 GAR1YHR089C 618 nt14.64□□□□□ -0.07
CWC22P53333 SPT5YML010W 3192 nt14.59□□□□□ -0.07
CWC22P53333 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.56□□□□□ -0.08
CWC22P53333 BDF1YLR399C 2061 nt14.53□□□□□ -0.08
CWC22P53333 PUN1YLR414C 792 nt14.5□□□□□ -0.09
CWC22P53333 BUD23YCR047C 828 nt14.44□□□□□ -0.1
CWC22P53333 RSB1YOR049C 1065 nt14.42□□□□□ -0.1
CWC22P53333 PTC2YER089C 1395 nt14.38□□□□□ -0.11
CWC22P53333 YJR018WYJR018W 363 nt14.35□□□□□ -0.11
CWC22P53333 TAT1YBR069C 1860 nt14.26□□□□□ -0.13
CWC22P53333 NAB2YGL122C 1578 nt14.24□□□□□ -0.13
CWC22P53333 TIR1YER011W 765 nt14.16□□□□□ -0.14
CWC22P53333 YJR120WYJR120W 351 nt14.09□□□□□ -0.15
CWC22P53333 UME6YDR207C 2511 nt14.09□□□□□ -0.15
CWC22P53333 FIS1YIL065C 468 nt14.04□□□□□ -0.16
CWC22P53333 DAL1YIR027C 1383 nt13.99□□□□□ -0.17
CWC22P53333 RPP2BYDR382W 333 nt13.94□□□□□ -0.18
CWC22P53333 FPR4YLR449W 1179 nt13.93□□□□□ -0.18
CWC22P53333 INM2YDR287W 879 nt13.88□□□□□ -0.19
CWC22P53333 PHO4YFR034C 939 nt13.87□□□□□ -0.19
CWC22P53333 PST2YDR032C 597 nt13.81□□□□□ -0.2
CWC22P53333 SRB2YHR041C 633 nt13.8□□□□□ -0.2
CWC22P53333 MEP2YNL142W 1500 nt13.79□□□□□ -0.2
CWC22P53333 YPS1YLR120C 1710 nt13.73□□□□□ -0.21
CWC22P53333 YBL100CYBL100C 315 nt13.7□□□□□ -0.22
CWC22P53333 BDH2YAL061W 1254 nt13.62□□□□□ -0.23
CWC22P53333 YDR095CYDR095C 411 nt13.59□□□□□ -0.23
CWC22P53333 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.58□□□□□ -0.24
CWC22P53333 DCW1YKL046C 1350 nt13.57□□□□□ -0.24
CWC22P53333 FUN26YAL022C 1554 nt13.53□□□□□ -0.24
CWC22P53333 WWM1YFL010C 636 nt13.48□□□□□ -0.25
CWC22P53333 Q0182Q0182 405 nt13.44□□□□□ -0.26
CWC22P53333 TRM9YML014W 840 nt13.41□□□□□ -0.26
CWC22P53333 GUT2YIL155C 1950 nt13.4□□□□□ -0.26
CWC22P53333 ALF1YNL148C 765 nt13.39□□□□□ -0.27
CWC22P53333 EMI2YDR516C 1503 nt13.39□□□□□ -0.27
CWC22P53333 LSM3YLR438C-A 270 nt13.38□□□□□ -0.27
CWC22P53333 PTP1YDL230W 1008 nt13.34□□□□□ -0.27
CWC22P53333 SHU1YHL006C 453 nt13.34□□□□□ -0.27
CWC22P53333 RPP2AYOL039W 321 nt13.32□□□□□ -0.28
CWC22P53333 CCT6YDR188W 1641 nt13.31□□□□□ -0.28
CWC22P53333 YMR090WYMR090W 684 nt13.29□□□□□ -0.28
CWC22P53333 CAC2YML102W 1407 nt13.29□□□□□ -0.28
CWC22P53333 YGR021WYGR021W 873 nt13.28□□□□□ -0.28
CWC22P53333 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.27□□□□□ -0.29
CWC22P53333 YDL221WYDL221W 552 nt13.26□□□□□ -0.29
CWC22P53333 YBR220CYBR220C 1683 nt13.26□□□□□ -0.29
CWC22P53333 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.24□□□□□ -0.29
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