Protein–RNA interactions for Protein: Q03088

SVL3, Styryl dye vacuolar localization protein 3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVL3Q03088 NSR1YGR159C 1245 nt19.41■□□□□ 0.7
SVL3Q03088 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.2■□□□□ 0.66
SVL3Q03088 NOP1YDL014W 984 nt18.55■□□□□ 0.56
SVL3Q03088 MDJ1YFL016C 1536 nt17.59■□□□□ 0.41
SVL3Q03088 YKL036CYKL036C 393 nt16.7■□□□□ 0.26
SVL3Q03088 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
SVL3Q03088 SRX1YKL086W 384 nt16.14■□□□□ 0.17
SVL3Q03088 Q0297Q0297 156 nt16.03■□□□□ 0.16
SVL3Q03088 YCR051WYCR051W 669 nt15.33■□□□□ 0.04
SVL3Q03088 DBP2YNL112W 1641 nt15.32■□□□□ 0.04
SVL3Q03088 YBR190WYBR190W 312 nt15.13■□□□□ 0.01
SVL3Q03088 SCS3YGL126W 1143 nt14.94□□□□□ -0.02
SVL3Q03088 RTC3YHR087W 336 nt14.83□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SVL3Q03088 CCC1YLR220W 969 nt14.71□□□□□ -0.05
SVL3Q03088 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
SVL3Q03088 Q0182Q0182 405 nt14.48□□□□□ -0.09
SVL3Q03088 YOL085CYOL085C 342 nt14.43□□□□□ -0.1
SVL3Q03088 RPP1BYDL130W 321 nt14.4□□□□□ -0.1
SVL3Q03088 PKP1YIL042C 1185 nt14.28□□□□□ -0.12
SVL3Q03088 SCJ1YMR214W 1134 nt14.2□□□□□ -0.14
SVL3Q03088 PUT4YOR348C 1884 nt13.96□□□□□ -0.17
SVL3Q03088 SSA3YBL075C 1950 nt13.94□□□□□ -0.18
SVL3Q03088 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SVL3Q03088 MOT3YMR070W 1473 nt13.88□□□□□ -0.19
SVL3Q03088 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
SVL3Q03088 PET122YER153C 765 nt13.79□□□□□ -0.2
SVL3Q03088 URN1YPR152C 1398 nt13.69□□□□□ -0.22
SVL3Q03088 SCR1SCR1 522 nt13.61□□□□□ -0.23
SVL3Q03088 ARE1YCR048W 1833 nt13.59□□□□□ -0.23
SVL3Q03088 DEP1YAL013W 1218 nt13.57□□□□□ -0.24
SVL3Q03088 SAH1YER043C 1350 nt13.57□□□□□ -0.24
SVL3Q03088 OPI9YLR338W 858 nt13.55□□□□□ -0.24
SVL3Q03088 POA1YBR022W 534 nt13.55□□□□□ -0.24
SVL3Q03088 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.49□□□□□ -0.25
SVL3Q03088 RPN10YHR200W 807 nt13.47□□□□□ -0.25
SVL3Q03088 YDJ1YNL064C 1230 nt13.46□□□□□ -0.25
SVL3Q03088 RRN5YLR141W 1092 nt13.35□□□□□ -0.27
SVL3Q03088 YNL208WYNL208W 600 nt13.33□□□□□ -0.28
SVL3Q03088 BSC6YOL137W 1494 nt13.33□□□□□ -0.28
SVL3Q03088 ATS1YAL020C 1002 nt13.25□□□□□ -0.29
SVL3Q03088 GAR1YHR089C 618 nt13.23□□□□□ -0.29
SVL3Q03088 BUD23YCR047C 828 nt13.19□□□□□ -0.3
SVL3Q03088 PUN1YLR414C 792 nt13.19□□□□□ -0.3
SVL3Q03088 SSA1YAL005C 1929 nt13.15□□□□□ -0.3
SVL3Q03088 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.08□□□□□ -0.32
SVL3Q03088 PTC2YER089C 1395 nt13.07□□□□□ -0.32
SVL3Q03088 YJR018WYJR018W 363 nt13.04□□□□□ -0.32
SVL3Q03088 RSB1YOR049C 1065 nt13.01□□□□□ -0.33
SVL3Q03088 NAB2YGL122C 1578 nt12.96□□□□□ -0.33
SVL3Q03088 SPT5YML010W 3192 nt12.81□□□□□ -0.36
SVL3Q03088 TIR1YER011W 765 nt12.79□□□□□ -0.36
SVL3Q03088 RPP2BYDR382W 333 nt12.73□□□□□ -0.37
SVL3Q03088 FPR4YLR449W 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
SVL3Q03088 DAL1YIR027C 1383 nt12.71□□□□□ -0.37
SVL3Q03088 FIS1YIL065C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
SVL3Q03088 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
SVL3Q03088 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
SVL3Q03088 YJR120WYJR120W 351 nt12.65□□□□□ -0.38
SVL3Q03088 PHO4YFR034C 939 nt12.59□□□□□ -0.39
SVL3Q03088 MEP2YNL142W 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
SVL3Q03088 YPS1YLR120C 1710 nt12.45□□□□□ -0.42
SVL3Q03088 YBL100CYBL100C 315 nt12.45□□□□□ -0.42
SVL3Q03088 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
SVL3Q03088 FPS1YLL043W 2010 nt12.42□□□□□ -0.42
SVL3Q03088 BDH2YAL061W 1254 nt12.34□□□□□ -0.43
SVL3Q03088 YDR095CYDR095C 411 nt12.33□□□□□ -0.44
SVL3Q03088 SRB2YHR041C 633 nt12.32□□□□□ -0.44
SVL3Q03088 DCW1YKL046C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
SVL3Q03088 PST2YDR032C 597 nt12.31□□□□□ -0.44
SVL3Q03088 FUN26YAL022C 1554 nt12.27□□□□□ -0.44
SVL3Q03088 ALF1YNL148C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
SVL3Q03088 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
SVL3Q03088 TRM9YML014W 840 nt12.21□□□□□ -0.45
SVL3Q03088 EMI2YDR516C 1503 nt12.18□□□□□ -0.46
SVL3Q03088 WWM1YFL010C 636 nt12.14□□□□□ -0.47
SVL3Q03088 BDF1YLR399C 2061 nt12.13□□□□□ -0.47
SVL3Q03088 RPP2AYOL039W 321 nt12.12□□□□□ -0.47
SVL3Q03088 LSM3YLR438C-A 270 nt12.11□□□□□ -0.47
SVL3Q03088 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 CCT6YDR188W 1641 nt12.06□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.05□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.05□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 YBR220CYBR220C 1683 nt12.04□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 PTP1YDL230W 1008 nt12.03□□□□□ -0.48
SVL3Q03088 YGR021WYGR021W 873 nt12.02□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 CAC2YML102W 1407 nt12.01□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 TAT1YBR069C 1860 nt12□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 SIS1YNL007C 1059 nt11.97□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 SDH1YKL148C 1923 nt11.96□□□□□ -0.49
SVL3Q03088 SHU1YHL006C 453 nt11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms