Protein–RNA interactions for Protein: Q12165

ATP16, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATP16Q12165 NSR1YGR159C 1245 nt15.46■□□□□ 0.07
ATP16Q12165 MDJ1YFL016C 1536 nt14.83□□□□□ -0.04
ATP16Q12165 SSA3YBL075C 1950 nt14.8□□□□□ -0.04
ATP16Q12165 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.54□□□□□ -0.08
ATP16Q12165 NOP1YDL014W 984 nt13.68□□□□□ -0.22
ATP16Q12165 YJL027CYJL027C 417 nt13.59□□□□□ -0.23
ATP16Q12165 YBR190WYBR190W 312 nt12.97□□□□□ -0.33
ATP16Q12165 PUT4YOR348C 1884 nt12.66□□□□□ -0.38
ATP16Q12165 SSA4YER103W 1929 nt12.64□□□□□ -0.39
ATP16Q12165 RTC3YHR087W 336 nt12.64□□□□□ -0.39
ATP16Q12165 DBP2YNL112W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
ATP16Q12165 PAC11YDR488C 1602 nt12.55□□□□□ -0.4
ATP16Q12165 SPT5YML010W 3192 nt12.44□□□□□ -0.42
ATP16Q12165 NVJ2YPR091C 2313 nt12.32□□□□□ -0.44
ATP16Q12165 BDF1YLR399C 2061 nt12.28□□□□□ -0.44
ATP16Q12165 POA1YBR022W 534 nt12.18□□□□□ -0.46
ATP16Q12165 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
ATP16Q12165 TAT1YBR069C 1860 nt12.09□□□□□ -0.47
ATP16Q12165 ARE1YCR048W 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
ATP16Q12165 FPS1YLL043W 2010 nt11.94□□□□□ -0.5
ATP16Q12165 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.94□□□□□ -0.5
ATP16Q12165 SRX1YKL086W 384 nt11.91□□□□□ -0.5
ATP16Q12165 YKL036CYKL036C 393 nt11.82□□□□□ -0.52
ATP16Q12165 URN1YPR152C 1398 nt11.68□□□□□ -0.54
ATP16Q12165 SAH1YER043C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
ATP16Q12165 RVS167YDR388W 1449 nt11.67□□□□□ -0.54
ATP16Q12165 BUD23YCR047C 828 nt11.59□□□□□ -0.55
ATP16Q12165 Q0297Q0297 156 nt11.54□□□□□ -0.56
ATP16Q12165 MEP2YNL142W 1500 nt11.53□□□□□ -0.56
ATP16Q12165 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 OPI9YLR338W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SSA1YAL005C 1929 nt11.43□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 SCJ1YMR214W 1134 nt11.43□□□□□ -0.58
ATP16Q12165 UME6YDR207C 2511 nt11.36□□□□□ -0.59
ATP16Q12165 CCC1YLR220W 969 nt11.35□□□□□ -0.59
ATP16Q12165 YBR220CYBR220C 1683 nt11.33□□□□□ -0.6
ATP16Q12165 DCW1YKL046C 1350 nt11.29□□□□□ -0.6
ATP16Q12165 PCH2YBR186W 1695 nt11.27□□□□□ -0.61
ATP16Q12165 GUT2YIL155C 1950 nt11.24□□□□□ -0.61
ATP16Q12165 YCR051WYCR051W 669 nt11.23□□□□□ -0.61
ATP16Q12165 NAB2YGL122C 1578 nt11.21□□□□□ -0.61
ATP16Q12165 YMR090WYMR090W 684 nt11.21□□□□□ -0.61
ATP16Q12165 PTC2YER089C 1395 nt11.18□□□□□ -0.62
ATP16Q12165 SEC11YIR022W 504 nt11.14□□□□□ -0.63
ATP16Q12165 PUN1YLR414C 792 nt11.13□□□□□ -0.63
ATP16Q12165 EMI2YDR516C 1503 nt11.13□□□□□ -0.63
ATP16Q12165 BOR1YNL275W 1731 nt11.11□□□□□ -0.63
ATP16Q12165 SDH1YKL148C 1923 nt11.04□□□□□ -0.64
ATP16Q12165 DEP1YAL013W 1218 nt11.03□□□□□ -0.64
ATP16Q12165 PIB2YGL023C 1908 nt10.99□□□□□ -0.65
ATP16Q12165 RPN10YHR200W 807 nt10.97□□□□□ -0.65
ATP16Q12165 SHR5YOL110W 714 nt10.95□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 YDL221WYDL221W 552 nt10.94□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 YPS1YLR120C 1710 nt10.93□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 MCH5YOR306C 1566 nt10.91□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.91□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 YJL225CYJL225C 5277 nt10.91□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 FIS1YIL065C 468 nt10.9□□□□□ -0.66
ATP16Q12165 RTF1YGL244W 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
ATP16Q12165 DAL1YIR027C 1383 nt10.83□□□□□ -0.68
ATP16Q12165 SCC4YER147C 1875 nt10.79□□□□□ -0.68
ATP16Q12165 FPR4YLR449W 1179 nt10.79□□□□□ -0.68
ATP16Q12165 YJR018WYJR018W 363 nt10.78□□□□□ -0.68
ATP16Q12165 YNL208WYNL208W 600 nt10.74□□□□□ -0.69
ATP16Q12165 PHO4YFR034C 939 nt10.73□□□□□ -0.69
ATP16Q12165 YOL085CYOL085C 342 nt10.72□□□□□ -0.69
ATP16Q12165 YSC84YHR016C 1407 nt10.7□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.69□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.69□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 PTK1YKL198C 1989 nt10.68□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 CAC2YML102W 1407 nt10.67□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 YDR095CYDR095C 411 nt10.67□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 BOP3YNL042W 1191 nt10.67□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 ALG12YNR030W 1656 nt10.65□□□□□ -0.7
ATP16Q12165 YHL050CYHL050C 2094 nt10.57□□□□□ -0.72
ATP16Q12165 INM2YDR287W 879 nt10.56□□□□□ -0.72
ATP16Q12165 PTP1YDL230W 1008 nt10.53□□□□□ -0.72
ATP16Q12165 SCS3YGL126W 1143 nt10.52□□□□□ -0.73
ATP16Q12165 IRC15YPL017C 1500 nt10.52□□□□□ -0.73
ATP16Q12165 GIS3YLR094C 1509 nt10.5□□□□□ -0.73
ATP16Q12165 HSP60YLR259C 1719 nt10.49□□□□□ -0.73
ATP16Q12165 RPP2AYOL039W 321 nt10.48□□□□□ -0.73
ATP16Q12165 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.45□□□□□ -0.74
ATP16Q12165 YFL054CYFL054C 1941 nt10.44□□□□□ -0.74
ATP16Q12165 SPT8YLR055C 1809 nt10.42□□□□□ -0.74
ATP16Q12165 RRT12YCR045C 1476 nt10.37□□□□□ -0.75
ATP16Q12165 RPP1BYDL130W 321 nt10.36□□□□□ -0.75
ATP16Q12165 NAR1YNL240C 1476 nt10.34□□□□□ -0.75
ATP16Q12165 YJR120WYJR120W 351 nt10.31□□□□□ -0.76
ATP16Q12165 RPP2BYDR382W 333 nt10.27□□□□□ -0.77
ATP16Q12165 YNL195CYNL195C 786 nt10.26□□□□□ -0.77
ATP16Q12165 YBL100CYBL100C 315 nt10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms