Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		21.18	■□□□□ 0.98
ATG12	P38316	NSR1	YGR159C	1245 nt		20.83	■□□□□ 0.93
ATG12	P38316	NOP1	YDL014W	984 nt		20.74	■□□□□ 0.91
ATG12	P38316	YKL036C	YKL036C	393 nt		19.33	■□□□□ 0.68
ATG12	P38316	MDJ1	YFL016C	1536 nt		18.24	■□□□□ 0.51
ATG12	P38316	Q0297	Q0297	156 nt		18.17	■□□□□ 0.5
ATG12	P38316	YJL027C	YJL027C	417 nt		18.11	■□□□□ 0.49
ATG12	P38316	SRX1	YKL086W	384 nt		18.07	■□□□□ 0.48
ATG12	P38316	SCS3	YGL126W	1143 nt		17.68	■□□□□ 0.42
ATG12	P38316	YCR051W	YCR051W	669 nt		17.21	■□□□□ 0.35
ATG12	P38316	YOL085C	YOL085C	342 nt		16.72	■□□□□ 0.27
ATG12	P38316	PKP1	YIL042C	1185 nt		16.43	■□□□□ 0.22
ATG12	P38316	RPP1B	YDL130W	321 nt		16.33	■□□□□ 0.2
ATG12	P38316	DBP2	YNL112W	1641 nt		16.16	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		16.15	■□□□□ 0.18
ATG12	P38316	CCC1	YLR220W	969 nt		16.06	■□□□□ 0.16
ATG12	P38316	SCJ1	YMR214W	1134 nt		16.01	■□□□□ 0.15
ATG12	P38316	ATS1	YAL020C	1002 nt		15.9	■□□□□ 0.14
ATG12	P38316	YBR190W	YBR190W	312 nt		15.57	■□□□□ 0.08
ATG12	P38316	PET122	YER153C	765 nt		15.54	■□□□□ 0.08
ATG12	P38316	SCR1	SCR1	522 nt		15.52	■□□□□ 0.08
ATG12	P38316	RVS167	YDR388W	1449 nt		15.4	■□□□□ 0.06
ATG12	P38316	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		15.39	■□□□□ 0.05
ATG12	P38316	RTC3	YHR087W	336 nt		15.24	■□□□□ 0.03
ATG12	P38316	RRN5	YLR141W	1092 nt		15.14	■□□□□ 0.01
ATG12	P38316	RSB1	YOR049C	1065 nt		14.93	□□□□□ -0.02
ATG12	P38316	YDJ1	YNL064C	1230 nt		14.9	□□□□□ -0.02
ATG12	P38316	SHR5	YOL110W	714 nt		14.87	□□□□□ -0.03
ATG12	P38316	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		14.84	□□□□□ -0.03
ATG12	P38316	PST2	YDR032C	597 nt		14.67	□□□□□ -0.06
ATG12	P38316	GAR1	YHR089C	618 nt		14.54	□□□□□ -0.08
ATG12	P38316	PUT4	YOR348C	1884 nt		14.38	□□□□□ -0.11
ATG12	P38316	DEP1	YAL013W	1218 nt		14.36	□□□□□ -0.11
ATG12	P38316	URN1	YPR152C	1398 nt		14.29	□□□□□ -0.12
ATG12	P38316	YKL097C	YKL097C	411 nt		14.27	□□□□□ -0.13
ATG12	P38316	RPN10	YHR200W	807 nt		14.21	□□□□□ -0.13
ATG12	P38316	YNL208W	YNL208W	600 nt		14.18	□□□□□ -0.14
ATG12	P38316	ARE1	YCR048W	1833 nt		14.04	□□□□□ -0.16
ATG12	P38316	SSA3	YBL075C	1950 nt		14.04	□□□□□ -0.16
ATG12	P38316	TIR1	YER011W	765 nt		14.03	□□□□□ -0.16
ATG12	P38316	OPI9	YLR338W	858 nt		14.03	□□□□□ -0.16
ATG12	P38316	SAH1	YER043C	1350 nt		14.02	□□□□□ -0.17
ATG12	P38316	SHU1	YHL006C	453 nt		14	□□□□□ -0.17
ATG12	P38316	POA1	YBR022W	534 nt		13.92	□□□□□ -0.18
ATG12	P38316	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		13.86	□□□□□ -0.19
ATG12	P38316	SSA1	YAL005C	1929 nt		13.76	□□□□□ -0.21
ATG12	P38316	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		13.73	□□□□□ -0.21
ATG12	P38316	YJR018W	YJR018W	363 nt		13.66	□□□□□ -0.22
ATG12	P38316	BSC6	YOL137W	1494 nt		13.66	□□□□□ -0.22
ATG12	P38316	PUN1	YLR414C	792 nt		13.65	□□□□□ -0.22
ATG12	P38316	YOR139C	YOR139C	393 nt		13.58	□□□□□ -0.24
ATG12	P38316	BUD23	YCR047C	828 nt		13.52	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	SRB2	YHR041C	633 nt		13.52	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	RPP2B	YDR382W	333 nt		13.51	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	NPL3	YDR432W	1245 nt		13.5	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	PTC2	YER089C	1395 nt		13.49	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	YGR021W	YGR021W	873 nt		13.48	□□□□□ -0.25
ATG12	P38316	WWM1	YFL010C	636 nt		13.43	□□□□□ -0.26
ATG12	P38316	YJR120W	YJR120W	351 nt		13.4	□□□□□ -0.26
ATG12	P38316	HOM6	YJR139C	1080 nt		13.39	□□□□□ -0.27
ATG12	P38316	MNP1	YGL068W	585 nt		13.35	□□□□□ -0.27
ATG12	P38316	NAB2	YGL122C	1578 nt		13.32	□□□□□ -0.28
ATG12	P38316	YOL037C	YOL037C	354 nt		13.28	□□□□□ -0.28
ATG12	P38316	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		13.24	□□□□□ -0.29
ATG12	P38316	BDH2	YAL061W	1254 nt		13.23	□□□□□ -0.29
ATG12	P38316	SPT5	YML010W	3192 nt		13.22	□□□□□ -0.29
ATG12	P38316	RKM5	YLR137W	1104 nt		13.21	□□□□□ -0.29
ATG12	P38316	INM2	YDR287W	879 nt		13.17	□□□□□ -0.3
ATG12	P38316	FIS1	YIL065C	468 nt		13.14	□□□□□ -0.31
ATG12	P38316	LSM3	YLR438C-A	270 nt		13.13	□□□□□ -0.31
ATG12	P38316	DAL1	YIR027C	1383 nt		13.11	□□□□□ -0.31
ATG12	P38316	FPR4	YLR449W	1179 nt		13.11	□□□□□ -0.31
ATG12	P38316	YBL100C	YBL100C	315 nt		13.06	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		13.05	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		13.05	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		13.05	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		13.05	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		13.05	□□□□□ -0.32
ATG12	P38316	PHO4	YFR034C	939 nt		13	□□□□□ -0.33
ATG12	P38316	TRM9	YML014W	840 nt		12.97	□□□□□ -0.33
ATG12	P38316	YLR281C	YLR281C	468 nt		12.93	□□□□□ -0.34
ATG12	P38316	PUS2	YGL063W	1113 nt		12.92	□□□□□ -0.34
ATG12	P38316	FUN26	YAL022C	1554 nt		12.9	□□□□□ -0.34
ATG12	P38316	WHI5	YOR083W	888 nt		12.86	□□□□□ -0.35
ATG12	P38316	SSA4	YER103W	1929 nt		12.85	□□□□□ -0.35
ATG12	P38316	MEP2	YNL142W	1500 nt		12.83	□□□□□ -0.35
ATG12	P38316	YPS1	YLR120C	1710 nt		12.83	□□□□□ -0.36
ATG12	P38316	CCT6	YDR188W	1641 nt		12.77	□□□□□ -0.37
ATG12	P38316	ALF1	YNL148C	765 nt		12.72	□□□□□ -0.37
ATG12	P38316	YDR095C	YDR095C	411 nt		12.71	□□□□□ -0.37
ATG12	P38316	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		12.71	□□□□□ -0.37
ATG12	P38316	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		12.71	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms