Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.53■□□□□ 0.72
RUP1Q12242 NSR1YGR159C 1245 nt19.46■□□□□ 0.71
RUP1Q12242 NOP1YDL014W 984 nt18.99■□□□□ 0.63
RUP1Q12242 MDJ1YFL016C 1536 nt17.77■□□□□ 0.43
RUP1Q12242 YKL036CYKL036C 393 nt17.48■□□□□ 0.39
RUP1Q12242 Q0297Q0297 156 nt16.62■□□□□ 0.25
RUP1Q12242 SRX1YKL086W 384 nt16.6■□□□□ 0.25
RUP1Q12242 YJL027CYJL027C 417 nt16.38■□□□□ 0.21
RUP1Q12242 SCS3YGL126W 1143 nt15.89■□□□□ 0.13
RUP1Q12242 YCR051WYCR051W 669 nt15.72■□□□□ 0.11
RUP1Q12242 DBP2YNL112W 1641 nt15.5■□□□□ 0.07
RUP1Q12242 YBR190WYBR190W 312 nt15.4■□□□□ 0.06
RUP1Q12242 YOL085CYOL085C 342 nt15.13■□□□□ 0.01
RUP1Q12242 SSA3YBL075C 1950 nt15.13■□□□□ 0.01
RUP1Q12242 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
RUP1Q12242 RTC3YHR087W 336 nt14.96□□□□□ -0.01
RUP1Q12242 RPP1BYDL130W 321 nt14.9□□□□□ -0.02
RUP1Q12242 PKP1YIL042C 1185 nt14.89□□□□□ -0.03
RUP1Q12242 CCC1YLR220W 969 nt14.84□□□□□ -0.03
RUP1Q12242 PUT4YOR348C 1884 nt14.46□□□□□ -0.09
RUP1Q12242 RVS167YDR388W 1449 nt14.44□□□□□ -0.1
RUP1Q12242 SCJ1YMR214W 1134 nt14.3□□□□□ -0.12
RUP1Q12242 PET122YER153C 765 nt14.23□□□□□ -0.13
RUP1Q12242 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.19□□□□□ -0.14
RUP1Q12242 ATS1YAL020C 1002 nt14.19□□□□□ -0.14
RUP1Q12242 SCR1SCR1 522 nt14.08□□□□□ -0.16
RUP1Q12242 ARE1YCR048W 1833 nt13.99□□□□□ -0.17
RUP1Q12242 POA1YBR022W 534 nt13.92□□□□□ -0.18
RUP1Q12242 SHR5YOL110W 714 nt13.88□□□□□ -0.19
RUP1Q12242 RRN5YLR141W 1092 nt13.81□□□□□ -0.2
RUP1Q12242 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.79□□□□□ -0.2
RUP1Q12242 SAH1YER043C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
RUP1Q12242 URN1YPR152C 1398 nt13.77□□□□□ -0.21
RUP1Q12242 BSC6YOL137W 1494 nt13.76□□□□□ -0.21
RUP1Q12242 OPI9YLR338W 858 nt13.75□□□□□ -0.21
RUP1Q12242 YDJ1YNL064C 1230 nt13.75□□□□□ -0.21
RUP1Q12242 SPT5YML010W 3192 nt13.67□□□□□ -0.22
RUP1Q12242 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.54□□□□□ -0.24
RUP1Q12242 DEP1YAL013W 1218 nt13.53□□□□□ -0.24
RUP1Q12242 RSB1YOR049C 1065 nt13.51□□□□□ -0.25
RUP1Q12242 SSA4YER103W 1929 nt13.47□□□□□ -0.25
RUP1Q12242 RPN10YHR200W 807 nt13.47□□□□□ -0.25
RUP1Q12242 GAR1YHR089C 618 nt13.41□□□□□ -0.26
RUP1Q12242 BUD23YCR047C 828 nt13.4□□□□□ -0.26
RUP1Q12242 PUN1YLR414C 792 nt13.35□□□□□ -0.27
RUP1Q12242 YNL208WYNL208W 600 nt13.33□□□□□ -0.28
RUP1Q12242 PTC2YER089C 1395 nt13.26□□□□□ -0.29
RUP1Q12242 NAB2YGL122C 1578 nt13.21□□□□□ -0.29
RUP1Q12242 PST2YDR032C 597 nt13.15□□□□□ -0.3
RUP1Q12242 YJR018WYJR018W 363 nt13.12□□□□□ -0.31
RUP1Q12242 BDF1YLR399C 2061 nt13.04□□□□□ -0.32
RUP1Q12242 MEP2YNL142W 1500 nt13.02□□□□□ -0.33
RUP1Q12242 TIR1YER011W 765 nt12.99□□□□□ -0.33
RUP1Q12242 FIS1YIL065C 468 nt12.93□□□□□ -0.34
RUP1Q12242 DAL1YIR027C 1383 nt12.91□□□□□ -0.34
RUP1Q12242 TAT1YBR069C 1860 nt12.86□□□□□ -0.35
RUP1Q12242 SSA1YAL005C 1929 nt12.83□□□□□ -0.36
RUP1Q12242 FPR4YLR449W 1179 nt12.79□□□□□ -0.36
RUP1Q12242 YPS1YLR120C 1710 nt12.77□□□□□ -0.36
RUP1Q12242 INM2YDR287W 879 nt12.77□□□□□ -0.37
RUP1Q12242 PHO4YFR034C 939 nt12.77□□□□□ -0.37
RUP1Q12242 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
RUP1Q12242 DCW1YKL046C 1350 nt12.74□□□□□ -0.37
RUP1Q12242 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
RUP1Q12242 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.64□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 SHU1YHL006C 453 nt12.62□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 YKL097CYKL097C 411 nt12.61□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 SRB2YHR041C 633 nt12.6□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 YMR090WYMR090W 684 nt12.6□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 YBR220CYBR220C 1683 nt12.6□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 EMI2YDR516C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 YDR095CYDR095C 411 nt12.59□□□□□ -0.39
RUP1Q12242 YBL100CYBL100C 315 nt12.5□□□□□ -0.41
RUP1Q12242 YDL221WYDL221W 552 nt12.46□□□□□ -0.41
RUP1Q12242 PAC11YDR488C 1602 nt12.46□□□□□ -0.41
RUP1Q12242 SDH1YKL148C 1923 nt12.43□□□□□ -0.42
RUP1Q12242 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.41□□□□□ -0.42
RUP1Q12242 WWM1YFL010C 636 nt12.4□□□□□ -0.42
RUP1Q12242 PTP1YDL230W 1008 nt12.36□□□□□ -0.43
RUP1Q12242 BDH2YAL061W 1254 nt12.36□□□□□ -0.43
RUP1Q12242 CAC2YML102W 1407 nt12.36□□□□□ -0.43
RUP1Q12242 RPP2AYOL039W 321 nt12.35□□□□□ -0.43
RUP1Q12242 YGR021WYGR021W 873 nt12.34□□□□□ -0.43
RUP1Q12242 FUN26YAL022C 1554 nt12.33□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 YJL225CYJL225C 5277 nt12.3□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 PCH2YBR186W 1695 nt12.29□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 SEC11YIR022W 504 nt12.29□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 HOM6YJR139C 1080 nt12.29□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 ALF1YNL148C 765 nt12.29□□□□□ -0.44
RUP1Q12242 SCC4YER147C 1875 nt12.25□□□□□ -0.45
RUP1Q12242 GUT2YIL155C 1950 nt12.25□□□□□ -0.45
RUP1Q12242 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.22□□□□□ -0.45
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