Protein–RNA interactions for Protein: P14291

RED1, Protein RED1, yeastyeast

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RED1P14291 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.94■□□□□ 0.78
RED1P14291 NSR1YGR159C 1245 nt19.74■□□□□ 0.75
RED1P14291 NOP1YDL014W 984 nt19.58■□□□□ 0.72
RED1P14291 YKL036CYKL036C 393 nt18.28■□□□□ 0.52
RED1P14291 Q0297Q0297 156 nt17.26■□□□□ 0.35
RED1P14291 MDJ1YFL016C 1536 nt17.15■□□□□ 0.34
RED1P14291 SRX1YKL086W 384 nt17.12■□□□□ 0.33
RED1P14291 YJL027CYJL027C 417 nt17.06■□□□□ 0.32
RED1P14291 SCS3YGL126W 1143 nt16.72■□□□□ 0.27
RED1P14291 YCR051WYCR051W 669 nt16.16■□□□□ 0.18
RED1P14291 YOL085CYOL085C 342 nt15.82■□□□□ 0.12
RED1P14291 RPP1BYDL130W 321 nt15.45■□□□□ 0.06
RED1P14291 PKP1YIL042C 1185 nt15.44■□□□□ 0.06
RED1P14291 DBP2YNL112W 1641 nt15.35■□□□□ 0.05
RED1P14291 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.32■□□□□ 0.04
RED1P14291 SCJ1YMR214W 1134 nt15.27■□□□□ 0.04
RED1P14291 ATS1YAL020C 1002 nt15.06■□□□□ 0
RED1P14291 CCC1YLR220W 969 nt15.04■□□□□ -0
RED1P14291 PET122YER153C 765 nt14.68□□□□□ -0.06
RED1P14291 YBR190WYBR190W 312 nt14.67□□□□□ -0.06
RED1P14291 SCR1SCR1 522 nt14.63□□□□□ -0.07
RED1P14291 SSA3YBL075C 1950 nt14.59□□□□□ -0.07
RED1P14291 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.56□□□□□ -0.08
RED1P14291 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
RED1P14291 RRN5YLR141W 1092 nt14.3□□□□□ -0.12
RED1P14291 RTC3YHR087W 336 nt14.24□□□□□ -0.13
RED1P14291 YDJ1YNL064C 1230 nt14.15□□□□□ -0.14
RED1P14291 SHR5YOL110W 714 nt14.07□□□□□ -0.16
RED1P14291 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.03□□□□□ -0.16
RED1P14291 RSB1YOR049C 1065 nt14.03□□□□□ -0.16
RED1P14291 PST2YDR032C 597 nt13.94□□□□□ -0.18
RED1P14291 GAR1YHR089C 618 nt13.67□□□□□ -0.22
RED1P14291 YKL097CYKL097C 411 nt13.47□□□□□ -0.25
RED1P14291 URN1YPR152C 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
RED1P14291 DEP1YAL013W 1218 nt13.45□□□□□ -0.26
RED1P14291 YNL208WYNL208W 600 nt13.39□□□□□ -0.27
RED1P14291 RPN10YHR200W 807 nt13.38□□□□□ -0.27
RED1P14291 OPI9YLR338W 858 nt13.28□□□□□ -0.28
RED1P14291 TIR1YER011W 765 nt13.25□□□□□ -0.29
RED1P14291 SHU1YHL006C 453 nt13.25□□□□□ -0.29
RED1P14291 PUT4YOR348C 1884 nt13.11□□□□□ -0.31
RED1P14291 Q0182Q0182 405 nt13.11□□□□□ -0.31
RED1P14291 SAH1YER043C 1350 nt13.06□□□□□ -0.32
RED1P14291 SSA1YAL005C 1929 nt13.02□□□□□ -0.32
RED1P14291 ARE1YCR048W 1833 nt12.94□□□□□ -0.34
RED1P14291 PUN1YLR414C 792 nt12.9□□□□□ -0.34
RED1P14291 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.89□□□□□ -0.35
RED1P14291 YOR139CYOR139C 393 nt12.89□□□□□ -0.35
RED1P14291 YJR018WYJR018W 363 nt12.88□□□□□ -0.35
RED1P14291 SRB2YHR041C 633 nt12.82□□□□□ -0.36
RED1P14291 YGR021WYGR021W 873 nt12.76□□□□□ -0.37
RED1P14291 YJR120WYJR120W 351 nt12.74□□□□□ -0.37
RED1P14291 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.71□□□□□ -0.37
RED1P14291 HOM6YJR139C 1080 nt12.71□□□□□ -0.37
RED1P14291 RPP2BYDR382W 333 nt12.7□□□□□ -0.38
RED1P14291 NPL3YDR432W 1245 nt12.7□□□□□ -0.38
RED1P14291 WWM1YFL010C 636 nt12.67□□□□□ -0.38
RED1P14291 POA1YBR022W 534 nt12.66□□□□□ -0.38
RED1P14291 PTC2YER089C 1395 nt12.64□□□□□ -0.39
RED1P14291 YOL037CYOL037C 354 nt12.59□□□□□ -0.39
RED1P14291 MNP1YGL068W 585 nt12.58□□□□□ -0.4
RED1P14291 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.54□□□□□ -0.4
RED1P14291 BDH2YAL061W 1254 nt12.52□□□□□ -0.41
RED1P14291 SSA4YER103W 1929 nt12.5□□□□□ -0.41
RED1P14291 RKM5YLR137W 1104 nt12.5□□□□□ -0.41
RED1P14291 NAB2YGL122C 1578 nt12.48□□□□□ -0.41
RED1P14291 INM2YDR287W 879 nt12.45□□□□□ -0.42
RED1P14291 LSM3YLR438C-A 270 nt12.45□□□□□ -0.42
RED1P14291 SPT5YML010W 3192 nt12.41□□□□□ -0.42
RED1P14291 BUD23YCR047C 828 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 MOT3YMR070W 1473 nt12.39□□□□□ -0.43
RED1P14291 DAL1YIR027C 1383 nt12.37□□□□□ -0.43
RED1P14291 BSC6YOL137W 1494 nt12.35□□□□□ -0.43
RED1P14291 PAC11YDR488C 1602 nt12.31□□□□□ -0.44
RED1P14291 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
RED1P14291 YBL100CYBL100C 315 nt12.3□□□□□ -0.44
RED1P14291 YLR281CYLR281C 468 nt12.27□□□□□ -0.45
RED1P14291 PHO4YFR034C 939 nt12.22□□□□□ -0.45
RED1P14291 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
RED1P14291 FPR4YLR449W 1179 nt12.21□□□□□ -0.45
RED1P14291 FUN26YAL022C 1554 nt12.18□□□□□ -0.46
RED1P14291 BDF1YLR399C 2061 nt12.17□□□□□ -0.46
RED1P14291 PUS2YGL063W 1113 nt12.16□□□□□ -0.46
RED1P14291 WHI5YOR083W 888 nt12.16□□□□□ -0.46
RED1P14291 CCT6YDR188W 1641 nt12.12□□□□□ -0.47
RED1P14291 NVJ2YPR091C 2313 nt12.12□□□□□ -0.47
RED1P14291 FPS1YLL043W 2010 nt12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms