Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.17■□□□□ 0.98
UFE1P41834 NSR1YGR159C 1245 nt20.89■□□□□ 0.93
UFE1P41834 NOP1YDL014W 984 nt20.7■□□□□ 0.9
UFE1P41834 YKL036CYKL036C 393 nt19.27■□□□□ 0.68
UFE1P41834 MDJ1YFL016C 1536 nt18.32■□□□□ 0.52
UFE1P41834 Q0297Q0297 156 nt18.18■□□□□ 0.5
UFE1P41834 SRX1YKL086W 384 nt18.07■□□□□ 0.48
UFE1P41834 YJL027CYJL027C 417 nt18.01■□□□□ 0.47
UFE1P41834 SCS3YGL126W 1143 nt17.62■□□□□ 0.41
UFE1P41834 YCR051WYCR051W 669 nt17.14■□□□□ 0.33
UFE1P41834 YOL085CYOL085C 342 nt16.67■□□□□ 0.26
UFE1P41834 PKP1YIL042C 1185 nt16.36■□□□□ 0.21
UFE1P41834 RPP1BYDL130W 321 nt16.31■□□□□ 0.2
UFE1P41834 DBP2YNL112W 1641 nt16.3■□□□□ 0.2
UFE1P41834 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.23■□□□□ 0.19
UFE1P41834 CCC1YLR220W 969 nt16.02■□□□□ 0.16
UFE1P41834 SCJ1YMR214W 1134 nt15.9■□□□□ 0.14
UFE1P41834 ATS1YAL020C 1002 nt15.81■□□□□ 0.12
UFE1P41834 YBR190WYBR190W 312 nt15.61■□□□□ 0.09
UFE1P41834 PET122YER153C 765 nt15.54■□□□□ 0.08
UFE1P41834 SCR1SCR1 522 nt15.45■□□□□ 0.06
UFE1P41834 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.41■□□□□ 0.06
UFE1P41834 RVS167YDR388W 1449 nt15.41■□□□□ 0.06
UFE1P41834 RTC3YHR087W 336 nt15.25■□□□□ 0.03
UFE1P41834 RRN5YLR141W 1092 nt15.1■□□□□ 0.01
UFE1P41834 YDJ1YNL064C 1230 nt14.92□□□□□ -0.02
UFE1P41834 SHR5YOL110W 714 nt14.92□□□□□ -0.02
UFE1P41834 RSB1YOR049C 1065 nt14.86□□□□□ -0.03
UFE1P41834 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.82□□□□□ -0.04
UFE1P41834 PST2YDR032C 597 nt14.62□□□□□ -0.07
UFE1P41834 GAR1YHR089C 618 nt14.52□□□□□ -0.09
UFE1P41834 DEP1YAL013W 1218 nt14.37□□□□□ -0.11
UFE1P41834 URN1YPR152C 1398 nt14.35□□□□□ -0.11
UFE1P41834 RPN10YHR200W 807 nt14.23□□□□□ -0.13
UFE1P41834 YNL208WYNL208W 600 nt14.21□□□□□ -0.13
UFE1P41834 YKL097CYKL097C 411 nt14.15□□□□□ -0.14
UFE1P41834 OPI9YLR338W 858 nt14.12□□□□□ -0.15
UFE1P41834 TIR1YER011W 765 nt14.04□□□□□ -0.16
UFE1P41834 PUT4YOR348C 1884 nt13.99□□□□□ -0.17
UFE1P41834 SHU1YHL006C 453 nt13.96□□□□□ -0.17
UFE1P41834 SAH1YER043C 1350 nt13.95□□□□□ -0.18
UFE1P41834 SSA1YAL005C 1929 nt13.81□□□□□ -0.2
UFE1P41834 ARE1YCR048W 1833 nt13.8□□□□□ -0.2
UFE1P41834 PUN1YLR414C 792 nt13.73□□□□□ -0.21
UFE1P41834 YJR018WYJR018W 363 nt13.71□□□□□ -0.21
UFE1P41834 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.65□□□□□ -0.22
UFE1P41834 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.63□□□□□ -0.23
UFE1P41834 SRB2YHR041C 633 nt13.59□□□□□ -0.23
UFE1P41834 POA1YBR022W 534 nt13.56□□□□□ -0.24
UFE1P41834 YJR120WYJR120W 351 nt13.53□□□□□ -0.24
UFE1P41834 YOR139CYOR139C 393 nt13.53□□□□□ -0.24
UFE1P41834 RPP2BYDR382W 333 nt13.51□□□□□ -0.25
UFE1P41834 PTC2YER089C 1395 nt13.49□□□□□ -0.25
UFE1P41834 YGR021WYGR021W 873 nt13.48□□□□□ -0.25
UFE1P41834 SSA3YBL075C 1950 nt13.47□□□□□ -0.25
UFE1P41834 WWM1YFL010C 636 nt13.44□□□□□ -0.26
UFE1P41834 HOM6YJR139C 1080 nt13.41□□□□□ -0.26
UFE1P41834 NPL3YDR432W 1245 nt13.39□□□□□ -0.27
UFE1P41834 MNP1YGL068W 585 nt13.35□□□□□ -0.27
UFE1P41834 BUD23YCR047C 828 nt13.32□□□□□ -0.28
UFE1P41834 NAB2YGL122C 1578 nt13.3□□□□□ -0.28
UFE1P41834 BDH2YAL061W 1254 nt13.27□□□□□ -0.29
UFE1P41834 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.26□□□□□ -0.29
UFE1P41834 YOL037CYOL037C 354 nt13.26□□□□□ -0.29
UFE1P41834 BSC6YOL137W 1494 nt13.24□□□□□ -0.29
UFE1P41834 RKM5YLR137W 1104 nt13.22□□□□□ -0.29
UFE1P41834 INM2YDR287W 879 nt13.21□□□□□ -0.29
UFE1P41834 DAL1YIR027C 1383 nt13.17□□□□□ -0.3
UFE1P41834 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
UFE1P41834 FIS1YIL065C 468 nt13.14□□□□□ -0.31
UFE1P41834 FPR4YLR449W 1179 nt13.11□□□□□ -0.31
UFE1P41834 YBL100CYBL100C 315 nt13.11□□□□□ -0.31
UFE1P41834 PHO4YFR034C 939 nt13.04□□□□□ -0.32
UFE1P41834 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13□□□□□ -0.33
UFE1P41834 IMT4tM(CAU)E 72 nt13□□□□□ -0.33
UFE1P41834 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13□□□□□ -0.33
UFE1P41834 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13□□□□□ -0.33
UFE1P41834 IMT2tM(CAU)P 72 nt13□□□□□ -0.33
UFE1P41834 TRM9YML014W 840 nt12.98□□□□□ -0.33
UFE1P41834 FUN26YAL022C 1554 nt12.96□□□□□ -0.33
UFE1P41834 YLR281CYLR281C 468 nt12.91□□□□□ -0.34
UFE1P41834 CCT6YDR188W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
UFE1P41834 PUS2YGL063W 1113 nt12.83□□□□□ -0.36
UFE1P41834 WHI5YOR083W 888 nt12.83□□□□□ -0.36
UFE1P41834 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
UFE1P41834 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.73□□□□□ -0.37
UFE1P41834 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.73□□□□□ -0.37
UFE1P41834 YPS1YLR120C 1710 nt12.71□□□□□ -0.38
UFE1P41834 YDR095CYDR095C 411 nt12.68□□□□□ -0.38
UFE1P41834 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.67□□□□□ -0.38
UFE1P41834 IMP2'YIL154C 1041 nt12.6□□□□□ -0.39
UFE1P41834 DSK2YMR276W 1122 nt12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms