RNA–Protein interactions for RNA: YBR229C

ROT2, Transcript of Glucosidase II catalytic subunit, yeast

Gene ROT2, Length 2,865 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROT2	YBR229C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	COS12	P53053	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TUB4	P53378	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YML108W	Q03759	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	COX3	P00420	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ATG22	P25568	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YKL063C	P35725	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MNN2	P38069	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YHR035W	P38769	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	BIG1	P38813	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	PET100	P38958	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TAT2	P38967	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SER3	P40054	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	FAU1	P40099	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	APQ12	P40532	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	PRM10	P42946	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	KXD1	P53158	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	COG7	P53195	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	EAF1	Q06337	982 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RAD59	Q12223	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MSB2	P32334	1306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YBR063C	P38083	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YJL068C	P40363	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MTO1	P53070	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SDT1	P53078	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ROG1	P53118	685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RRN9	P53437	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	HEH2	Q03281	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SEC2	P17065	759 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	LYP1	P32487	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YPT7	P32939	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TOD6	P34219	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YBR242W	P38331	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MLH1	P38920	769 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	CCT6	P39079	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ATG18	P43601	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YJL049W	P47048	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SNX4	P47057	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RSM7	P47150	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TDA1	Q03533	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	DCI1	Q08558	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
ROT2	YBR229C	LAG2	Q92325	660 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	AI4	P03878	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	STE7	P06784	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	FMP10	P40098	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	AZF1	P41696	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	AAD14	P42884	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	QRI7	P43122	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TMN2	Q04562	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ELP6	Q04868	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RSF1	Q05043	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	VID22	Q05934	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	GPN3	Q06543	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	ASR1	Q06834	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RAX1	Q08760	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	FRE5	Q08908	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SUL2	Q12325	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	RTR2	Q12378	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SIR2	P06700	562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	PET54	P10834	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SEN2	P16658	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	SNF6	P18888	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	HYM1	P32464	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	NIC96	P34077	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	TUL1	P36096	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MBP1	P39678	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	MAD2	P40958	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	IMO32	P53219	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	YGR067C	P53243	804 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ROT2	YBR229C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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