Protein–RNA interactions for Protein: Q05468

RQC1, Ribosome quality control complex subunit 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RQC1Q05468 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.29■□□□□ 0.68
RQC1Q05468 NSR1YGR159C 1245 nt19.21■□□□□ 0.67
RQC1Q05468 NOP1YDL014W 984 nt18.76■□□□□ 0.59
RQC1Q05468 YKL036CYKL036C 393 nt17.3■□□□□ 0.36
RQC1Q05468 MDJ1YFL016C 1536 nt17.05■□□□□ 0.32
RQC1Q05468 Q0297Q0297 156 nt16.43■□□□□ 0.22
RQC1Q05468 SRX1YKL086W 384 nt16.4■□□□□ 0.22
RQC1Q05468 YJL027CYJL027C 417 nt16.13■□□□□ 0.17
RQC1Q05468 SCS3YGL126W 1143 nt15.74■□□□□ 0.11
RQC1Q05468 YCR051WYCR051W 669 nt15.54■□□□□ 0.08
RQC1Q05468 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
RQC1Q05468 YOL085CYOL085C 342 nt14.99□□□□□ -0.01
RQC1Q05468 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
RQC1Q05468 RPP1BYDL130W 321 nt14.74□□□□□ -0.05
RQC1Q05468 PKP1YIL042C 1185 nt14.74□□□□□ -0.05
RQC1Q05468 CCC1YLR220W 969 nt14.66□□□□□ -0.06
RQC1Q05468 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
RQC1Q05468 SSA3YBL075C 1950 nt14.25□□□□□ -0.13
RQC1Q05468 RTC3YHR087W 336 nt14.2□□□□□ -0.14
RQC1Q05468 RVS167YDR388W 1449 nt14.16□□□□□ -0.14
RQC1Q05468 SCJ1YMR214W 1134 nt14.12□□□□□ -0.15
RQC1Q05468 PET122YER153C 765 nt14.08□□□□□ -0.16
RQC1Q05468 ATS1YAL020C 1002 nt14.07□□□□□ -0.16
RQC1Q05468 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.02□□□□□ -0.17
RQC1Q05468 SCR1SCR1 522 nt13.91□□□□□ -0.18
RQC1Q05468 SHR5YOL110W 714 nt13.69□□□□□ -0.22
RQC1Q05468 RRN5YLR141W 1092 nt13.67□□□□□ -0.22
RQC1Q05468 YDJ1YNL064C 1230 nt13.58□□□□□ -0.24
RQC1Q05468 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.4□□□□□ -0.26
RQC1Q05468 RSB1YOR049C 1065 nt13.37□□□□□ -0.27
RQC1Q05468 URN1YPR152C 1398 nt13.31□□□□□ -0.28
RQC1Q05468 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
RQC1Q05468 DEP1YAL013W 1218 nt13.28□□□□□ -0.28
RQC1Q05468 GAR1YHR089C 618 nt13.25□□□□□ -0.29
RQC1Q05468 OPI9YLR338W 858 nt13.14□□□□□ -0.31
RQC1Q05468 RPN10YHR200W 807 nt13.11□□□□□ -0.31
RQC1Q05468 YNL208WYNL208W 600 nt13.09□□□□□ -0.31
RQC1Q05468 PST2YDR032C 597 nt13.05□□□□□ -0.32
RQC1Q05468 SAH1YER043C 1350 nt13.04□□□□□ -0.32
RQC1Q05468 ARE1YCR048W 1833 nt12.98□□□□□ -0.33
RQC1Q05468 TIR1YER011W 765 nt12.83□□□□□ -0.36
RQC1Q05468 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.8□□□□□ -0.36
RQC1Q05468 POA1YBR022W 534 nt12.79□□□□□ -0.36
RQC1Q05468 PUN1YLR414C 792 nt12.75□□□□□ -0.37
RQC1Q05468 SPT5YML010W 3192 nt12.72□□□□□ -0.37
RQC1Q05468 YJR018WYJR018W 363 nt12.7□□□□□ -0.38
RQC1Q05468 SSA1YAL005C 1929 nt12.68□□□□□ -0.38
RQC1Q05468 BSC6YOL137W 1494 nt12.64□□□□□ -0.39
RQC1Q05468 PTC2YER089C 1395 nt12.57□□□□□ -0.4
RQC1Q05468 SSA4YER103W 1929 nt12.55□□□□□ -0.4
RQC1Q05468 YJR120WYJR120W 351 nt12.53□□□□□ -0.4
RQC1Q05468 SHU1YHL006C 453 nt12.51□□□□□ -0.41
RQC1Q05468 BUD23YCR047C 828 nt12.5□□□□□ -0.41
RQC1Q05468 YKL097CYKL097C 411 nt12.5□□□□□ -0.41
RQC1Q05468 SRB2YHR041C 633 nt12.47□□□□□ -0.41
RQC1Q05468 RPP2BYDR382W 333 nt12.43□□□□□ -0.42
RQC1Q05468 NAB2YGL122C 1578 nt12.42□□□□□ -0.42
RQC1Q05468 Q0182Q0182 405 nt12.32□□□□□ -0.44
RQC1Q05468 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.31□□□□□ -0.44
RQC1Q05468 WWM1YFL010C 636 nt12.26□□□□□ -0.45
RQC1Q05468 FIS1YIL065C 468 nt12.26□□□□□ -0.45
RQC1Q05468 DAL1YIR027C 1383 nt12.26□□□□□ -0.45
RQC1Q05468 INM2YDR287W 879 nt12.25□□□□□ -0.45
RQC1Q05468 BDH2YAL061W 1254 nt12.2□□□□□ -0.46
RQC1Q05468 FPR4YLR449W 1179 nt12.2□□□□□ -0.46
RQC1Q05468 BDF1YLR399C 2061 nt12.2□□□□□ -0.46
RQC1Q05468 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
RQC1Q05468 HOM6YJR139C 1080 nt12.15□□□□□ -0.46
RQC1Q05468 PHO4YFR034C 939 nt12.14□□□□□ -0.47
RQC1Q05468 YBL100CYBL100C 315 nt12.12□□□□□ -0.47
RQC1Q05468 MNP1YGL068W 585 nt12.08□□□□□ -0.48
RQC1Q05468 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.07□□□□□ -0.48
RQC1Q05468 LSM3YLR438C-A 270 nt12.04□□□□□ -0.48
RQC1Q05468 YOR139CYOR139C 393 nt12.02□□□□□ -0.49
RQC1Q05468 TAT1YBR069C 1860 nt12□□□□□ -0.49
RQC1Q05468 FUN26YAL022C 1554 nt11.98□□□□□ -0.49
RQC1Q05468 RKM5YLR137W 1104 nt11.97□□□□□ -0.49
RQC1Q05468 TRM9YML014W 840 nt11.95□□□□□ -0.5
RQC1Q05468 MEP2YNL142W 1500 nt11.95□□□□□ -0.5
RQC1Q05468 YPS1YLR120C 1710 nt11.91□□□□□ -0.5
RQC1Q05468 NPL3YDR432W 1245 nt11.9□□□□□ -0.5
RQC1Q05468 YOL037CYOL037C 354 nt11.88□□□□□ -0.51
RQC1Q05468 YDR095CYDR095C 411 nt11.85□□□□□ -0.51
RQC1Q05468 CCT6YDR188W 1641 nt11.85□□□□□ -0.51
RQC1Q05468 ALF1YNL148C 765 nt11.8□□□□□ -0.52
RQC1Q05468 PAC11YDR488C 1602 nt11.79□□□□□ -0.52
RQC1Q05468 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.77□□□□□ -0.53
RQC1Q05468 DCW1YKL046C 1350 nt11.75□□□□□ -0.53
RQC1Q05468 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.74□□□□□ -0.53
RQC1Q05468 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.74□□□□□ -0.53
RQC1Q05468 MOT3YMR070W 1473 nt11.68□□□□□ -0.54
RQC1Q05468 SIS1YNL007C 1059 nt11.65□□□□□ -0.54
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