Protein–RNA interactions for Protein: Q05934

VID22, Vacuolar import and degradation protein 22, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID22Q05934 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.19■□□□□ 0.66
VID22Q05934 NOP1YDL014W 984 nt18.89■□□□□ 0.61
VID22Q05934 NSR1YGR159C 1245 nt18.73■□□□□ 0.59
VID22Q05934 YKL036CYKL036C 393 nt17.69■□□□□ 0.42
VID22Q05934 MDJ1YFL016C 1536 nt16.7■□□□□ 0.26
VID22Q05934 YJL027CYJL027C 417 nt16.61■□□□□ 0.25
VID22Q05934 Q0297Q0297 156 nt16.53■□□□□ 0.24
VID22Q05934 SRX1YKL086W 384 nt16.4■□□□□ 0.22
VID22Q05934 SCS3YGL126W 1143 nt16.21■□□□□ 0.19
VID22Q05934 YCR051WYCR051W 669 nt15.63■□□□□ 0.09
VID22Q05934 YOL085CYOL085C 342 nt15.23■□□□□ 0.03
VID22Q05934 PKP1YIL042C 1185 nt14.95□□□□□ -0.02
VID22Q05934 SCJ1YMR214W 1134 nt14.9□□□□□ -0.02
VID22Q05934 RPP1BYDL130W 321 nt14.85□□□□□ -0.03
VID22Q05934 DBP2YNL112W 1641 nt14.66□□□□□ -0.06
VID22Q05934 ATS1YAL020C 1002 nt14.6□□□□□ -0.07
VID22Q05934 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.58□□□□□ -0.08
VID22Q05934 CCC1YLR220W 969 nt14.48□□□□□ -0.09
VID22Q05934 YBR190WYBR190W 312 nt14.39□□□□□ -0.11
VID22Q05934 SCR1SCR1 522 nt14.22□□□□□ -0.13
VID22Q05934 PET122YER153C 765 nt14.09□□□□□ -0.15
VID22Q05934 RTC3YHR087W 336 nt14□□□□□ -0.17
VID22Q05934 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.93□□□□□ -0.18
VID22Q05934 RVS167YDR388W 1449 nt13.9□□□□□ -0.18
VID22Q05934 RRN5YLR141W 1092 nt13.74□□□□□ -0.21
VID22Q05934 RSB1YOR049C 1065 nt13.65□□□□□ -0.22
VID22Q05934 SSA3YBL075C 1950 nt13.5□□□□□ -0.25
VID22Q05934 YDJ1YNL064C 1230 nt13.49□□□□□ -0.25
VID22Q05934 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.45□□□□□ -0.26
VID22Q05934 PST2YDR032C 597 nt13.42□□□□□ -0.26
VID22Q05934 SHR5YOL110W 714 nt13.4□□□□□ -0.26
VID22Q05934 PUT4YOR348C 1884 nt13.32□□□□□ -0.28
VID22Q05934 YKL097CYKL097C 411 nt13.21□□□□□ -0.29
VID22Q05934 Q0182Q0182 405 nt13.18□□□□□ -0.3
VID22Q05934 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
VID22Q05934 URN1YPR152C 1398 nt12.98□□□□□ -0.33
VID22Q05934 ARE1YCR048W 1833 nt12.97□□□□□ -0.33
VID22Q05934 OPI9YLR338W 858 nt12.9□□□□□ -0.34
VID22Q05934 SAH1YER043C 1350 nt12.88□□□□□ -0.35
VID22Q05934 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
VID22Q05934 DEP1YAL013W 1218 nt12.85□□□□□ -0.35
VID22Q05934 RPN10YHR200W 807 nt12.83□□□□□ -0.36
VID22Q05934 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.8□□□□□ -0.36
VID22Q05934 SHU1YHL006C 453 nt12.78□□□□□ -0.36
VID22Q05934 YNL208WYNL208W 600 nt12.76□□□□□ -0.37
VID22Q05934 TIR1YER011W 765 nt12.67□□□□□ -0.38
VID22Q05934 BSC6YOL137W 1494 nt12.66□□□□□ -0.38
VID22Q05934 MOT3YMR070W 1473 nt12.62□□□□□ -0.39
VID22Q05934 PUN1YLR414C 792 nt12.53□□□□□ -0.4
VID22Q05934 NPL3YDR432W 1245 nt12.46□□□□□ -0.41
VID22Q05934 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.46□□□□□ -0.41
VID22Q05934 BUD23YCR047C 828 nt12.45□□□□□ -0.42
VID22Q05934 YOR139CYOR139C 393 nt12.45□□□□□ -0.42
VID22Q05934 PTC2YER089C 1395 nt12.41□□□□□ -0.42
VID22Q05934 YJR018WYJR018W 363 nt12.37□□□□□ -0.43
VID22Q05934 SPT5YML010W 3192 nt12.37□□□□□ -0.43
VID22Q05934 SSA1YAL005C 1929 nt12.35□□□□□ -0.43
VID22Q05934 YGR021WYGR021W 873 nt12.31□□□□□ -0.44
VID22Q05934 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
VID22Q05934 RPP2BYDR382W 333 nt12.21□□□□□ -0.45
VID22Q05934 YOL037CYOL037C 354 nt12.2□□□□□ -0.46
VID22Q05934 HOM6YJR139C 1080 nt12.15□□□□□ -0.46
VID22Q05934 MNP1YGL068W 585 nt12.13□□□□□ -0.47
VID22Q05934 WWM1YFL010C 636 nt12.12□□□□□ -0.47
VID22Q05934 YJR120WYJR120W 351 nt12.12□□□□□ -0.47
VID22Q05934 FIS1YIL065C 468 nt12.11□□□□□ -0.47
VID22Q05934 DAL1YIR027C 1383 nt12.08□□□□□ -0.48
VID22Q05934 SSA4YER103W 1929 nt12.07□□□□□ -0.48
VID22Q05934 SRB2YHR041C 633 nt12.06□□□□□ -0.48
VID22Q05934 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.02□□□□□ -0.49
VID22Q05934 INM2YDR287W 879 nt12□□□□□ -0.49
VID22Q05934 RKM5YLR137W 1104 nt12□□□□□ -0.49
VID22Q05934 FPR4YLR449W 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
VID22Q05934 PHO4YFR034C 939 nt11.97□□□□□ -0.49
VID22Q05934 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.96□□□□□ -0.49
VID22Q05934 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.96□□□□□ -0.49
VID22Q05934 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.96□□□□□ -0.49
VID22Q05934 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.96□□□□□ -0.49
VID22Q05934 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.96□□□□□ -0.49
VID22Q05934 MEP2YNL142W 1500 nt11.94□□□□□ -0.5
VID22Q05934 BDH2YAL061W 1254 nt11.91□□□□□ -0.5
VID22Q05934 YPS1YLR120C 1710 nt11.86□□□□□ -0.51
VID22Q05934 LSM3YLR438C-A 270 nt11.84□□□□□ -0.51
VID22Q05934 PUS2YGL063W 1113 nt11.83□□□□□ -0.52
VID22Q05934 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
VID22Q05934 YLR281CYLR281C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
VID22Q05934 YDR095CYDR095C 411 nt11.74□□□□□ -0.53
VID22Q05934 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.73□□□□□ -0.53
VID22Q05934 DCW1YKL046C 1350 nt11.72□□□□□ -0.53
VID22Q05934 WHI5YOR083W 888 nt11.71□□□□□ -0.53
VID22Q05934 TRM9YML014W 840 nt11.67□□□□□ -0.54
VID22Q05934 FUN26YAL022C 1554 nt11.66□□□□□ -0.54
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