Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 NSR1YGR159C 1245 nt18.36■□□□□ 0.53
NIC96P34077 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.36■□□□□ 0.53
NIC96P34077 NOP1YDL014W 984 nt17.79■□□□□ 0.44
NIC96P34077 MDJ1YFL016C 1536 nt16.47■□□□□ 0.23
NIC96P34077 YKL036CYKL036C 393 nt16.23■□□□□ 0.19
NIC96P34077 SRX1YKL086W 384 nt15.5■□□□□ 0.07
NIC96P34077 Q0297Q0297 156 nt15.46■□□□□ 0.07
NIC96P34077 YJL027CYJL027C 417 nt15.22■□□□□ 0.03
NIC96P34077 YCR051WYCR051W 669 nt14.73□□□□□ -0.05
NIC96P34077 SCS3YGL126W 1143 nt14.65□□□□□ -0.06
NIC96P34077 SSA3YBL075C 1950 nt14.45□□□□□ -0.1
NIC96P34077 DBP2YNL112W 1641 nt14.44□□□□□ -0.1
NIC96P34077 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.11□□□□□ -0.15
NIC96P34077 YBR190WYBR190W 312 nt14.09□□□□□ -0.15
NIC96P34077 YOL085CYOL085C 342 nt14.03□□□□□ -0.16
NIC96P34077 CCC1YLR220W 969 nt14□□□□□ -0.17
NIC96P34077 Q0182Q0182 405 nt13.99□□□□□ -0.17
NIC96P34077 RPP1BYDL130W 321 nt13.89□□□□□ -0.19
NIC96P34077 PKP1YIL042C 1185 nt13.85□□□□□ -0.19
NIC96P34077 RTC3YHR087W 336 nt13.82□□□□□ -0.2
NIC96P34077 RVS167YDR388W 1449 nt13.66□□□□□ -0.22
NIC96P34077 SCJ1YMR214W 1134 nt13.47□□□□□ -0.25
NIC96P34077 MOT3YMR070W 1473 nt13.38□□□□□ -0.27
NIC96P34077 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.29□□□□□ -0.28
NIC96P34077 PET122YER153C 765 nt13.28□□□□□ -0.28
NIC96P34077 SCR1SCR1 522 nt13.15□□□□□ -0.3
NIC96P34077 SHR5YOL110W 714 nt13.1□□□□□ -0.31
NIC96P34077 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
NIC96P34077 ATS1YAL020C 1002 nt13.05□□□□□ -0.32
NIC96P34077 RRN5YLR141W 1092 nt12.87□□□□□ -0.35
NIC96P34077 YDJ1YNL064C 1230 nt12.87□□□□□ -0.35
NIC96P34077 URN1YPR152C 1398 nt12.83□□□□□ -0.36
NIC96P34077 DEP1YAL013W 1218 nt12.78□□□□□ -0.36
NIC96P34077 OPI9YLR338W 858 nt12.67□□□□□ -0.38
NIC96P34077 RPN10YHR200W 807 nt12.66□□□□□ -0.38
NIC96P34077 SAH1YER043C 1350 nt12.63□□□□□ -0.39
NIC96P34077 GAR1YHR089C 618 nt12.62□□□□□ -0.39
NIC96P34077 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.61□□□□□ -0.39
NIC96P34077 ARE1YCR048W 1833 nt12.6□□□□□ -0.39
NIC96P34077 RSB1YOR049C 1065 nt12.6□□□□□ -0.39
NIC96P34077 SSA4YER103W 1929 nt12.59□□□□□ -0.39
NIC96P34077 YNL208WYNL208W 600 nt12.58□□□□□ -0.4
NIC96P34077 SPT5YML010W 3192 nt12.57□□□□□ -0.4
NIC96P34077 POA1YBR022W 534 nt12.56□□□□□ -0.4
NIC96P34077 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.49□□□□□ -0.41
NIC96P34077 BSC6YOL137W 1494 nt12.47□□□□□ -0.41
NIC96P34077 PUN1YLR414C 792 nt12.34□□□□□ -0.43
NIC96P34077 YJR018WYJR018W 363 nt12.23□□□□□ -0.45
NIC96P34077 BUD23YCR047C 828 nt12.21□□□□□ -0.45
NIC96P34077 BDF1YLR399C 2061 nt12.2□□□□□ -0.46
NIC96P34077 TIR1YER011W 765 nt12.2□□□□□ -0.46
NIC96P34077 PTC2YER089C 1395 nt12.19□□□□□ -0.46
NIC96P34077 PST2YDR032C 597 nt12.09□□□□□ -0.47
NIC96P34077 PAC11YDR488C 1602 nt12.08□□□□□ -0.48
NIC96P34077 NAB2YGL122C 1578 nt12.06□□□□□ -0.48
NIC96P34077 SSA1YAL005C 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
NIC96P34077 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.48
NIC96P34077 RPP2BYDR382W 333 nt11.99□□□□□ -0.49
NIC96P34077 YJR120WYJR120W 351 nt11.94□□□□□ -0.5
NIC96P34077 FPR4YLR449W 1179 nt11.88□□□□□ -0.51
NIC96P34077 DAL1YIR027C 1383 nt11.88□□□□□ -0.51
NIC96P34077 FIS1YIL065C 468 nt11.85□□□□□ -0.51
NIC96P34077 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
NIC96P34077 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
NIC96P34077 NVJ2YPR091C 2313 nt11.77□□□□□ -0.52
NIC96P34077 SRB2YHR041C 633 nt11.77□□□□□ -0.53
NIC96P34077 PHO4YFR034C 939 nt11.76□□□□□ -0.53
NIC96P34077 YBL100CYBL100C 315 nt11.7□□□□□ -0.54
NIC96P34077 BDH2YAL061W 1254 nt11.67□□□□□ -0.54
NIC96P34077 SHU1YHL006C 453 nt11.65□□□□□ -0.54
NIC96P34077 WWM1YFL010C 636 nt11.62□□□□□ -0.55
NIC96P34077 DCW1YKL046C 1350 nt11.59□□□□□ -0.55
NIC96P34077 YKL097CYKL097C 411 nt11.58□□□□□ -0.56
NIC96P34077 YPS1YLR120C 1710 nt11.57□□□□□ -0.56
NIC96P34077 YGR021WYGR021W 873 nt11.55□□□□□ -0.56
NIC96P34077 FUN26YAL022C 1554 nt11.54□□□□□ -0.56
NIC96P34077 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.53□□□□□ -0.56
NIC96P34077 YBR220CYBR220C 1683 nt11.52□□□□□ -0.57
NIC96P34077 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.5□□□□□ -0.57
NIC96P34077 TRM9YML014W 840 nt11.5□□□□□ -0.57
NIC96P34077 LSM3YLR438C-A 270 nt11.49□□□□□ -0.57
NIC96P34077 YDR095CYDR095C 411 nt11.48□□□□□ -0.57
NIC96P34077 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.46□□□□□ -0.57
NIC96P34077 ALF1YNL148C 765 nt11.46□□□□□ -0.57
NIC96P34077 HOM6YJR139C 1080 nt11.45□□□□□ -0.58
NIC96P34077 YMR090WYMR090W 684 nt11.43□□□□□ -0.58
NIC96P34077 EMI2YDR516C 1503 nt11.42□□□□□ -0.58
NIC96P34077 MNP1YGL068W 585 nt11.37□□□□□ -0.59
NIC96P34077 CCT6YDR188W 1641 nt11.37□□□□□ -0.59
NIC96P34077 PCH2YBR186W 1695 nt11.34□□□□□ -0.59
NIC96P34077 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.34□□□□□ -0.59
NIC96P34077 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.34□□□□□ -0.59
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