Protein–RNA interactions for Protein: P50623

UBC9, SUMO-conjugating enzyme UBC9, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBC9P50623 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.11■□□□□ 0.65
UBC9P50623 NSR1YGR159C 1245 nt19.07■□□□□ 0.64
UBC9P50623 NOP1YDL014W 984 nt18.54■□□□□ 0.56
UBC9P50623 MDJ1YFL016C 1536 nt17.05■□□□□ 0.32
UBC9P50623 YKL036CYKL036C 393 nt16.99■□□□□ 0.31
UBC9P50623 SRX1YKL086W 384 nt16.18■□□□□ 0.18
UBC9P50623 Q0297Q0297 156 nt16.16■□□□□ 0.18
UBC9P50623 YJL027CYJL027C 417 nt15.85■□□□□ 0.13
UBC9P50623 SCS3YGL126W 1143 nt15.38■□□□□ 0.05
UBC9P50623 YCR051WYCR051W 669 nt15.37■□□□□ 0.05
UBC9P50623 DBP2YNL112W 1641 nt15.01□□□□□ -0.01
UBC9P50623 YOL085CYOL085C 342 nt14.71□□□□□ -0.05
UBC9P50623 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.68□□□□□ -0.06
UBC9P50623 CCC1YLR220W 969 nt14.58□□□□□ -0.08
UBC9P50623 YBR190WYBR190W 312 nt14.56□□□□□ -0.08
UBC9P50623 PKP1YIL042C 1185 nt14.52□□□□□ -0.09
UBC9P50623 RPP1BYDL130W 321 nt14.51□□□□□ -0.09
UBC9P50623 RTC3YHR087W 336 nt14.27□□□□□ -0.13
UBC9P50623 RVS167YDR388W 1449 nt14.14□□□□□ -0.15
UBC9P50623 SCJ1YMR214W 1134 nt13.99□□□□□ -0.17
UBC9P50623 PET122YER153C 765 nt13.88□□□□□ -0.19
UBC9P50623 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.87□□□□□ -0.19
UBC9P50623 ATS1YAL020C 1002 nt13.73□□□□□ -0.21
UBC9P50623 SCR1SCR1 522 nt13.73□□□□□ -0.21
UBC9P50623 SHR5YOL110W 714 nt13.59□□□□□ -0.23
UBC9P50623 RRN5YLR141W 1092 nt13.48□□□□□ -0.25
UBC9P50623 YDJ1YNL064C 1230 nt13.4□□□□□ -0.26
UBC9P50623 URN1YPR152C 1398 nt13.3□□□□□ -0.28
UBC9P50623 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
UBC9P50623 Q0182Q0182 405 nt13.28□□□□□ -0.28
UBC9P50623 DEP1YAL013W 1218 nt13.27□□□□□ -0.29
UBC9P50623 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.2□□□□□ -0.3
UBC9P50623 RSB1YOR049C 1065 nt13.18□□□□□ -0.3
UBC9P50623 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
UBC9P50623 OPI9YLR338W 858 nt13.11□□□□□ -0.31
UBC9P50623 RPN10YHR200W 807 nt13.08□□□□□ -0.32
UBC9P50623 SAH1YER043C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
UBC9P50623 YNL208WYNL208W 600 nt13.04□□□□□ -0.32
UBC9P50623 ARE1YCR048W 1833 nt13.02□□□□□ -0.33
UBC9P50623 MOT3YMR070W 1473 nt12.94□□□□□ -0.34
UBC9P50623 POA1YBR022W 534 nt12.9□□□□□ -0.34
UBC9P50623 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.87□□□□□ -0.35
UBC9P50623 PST2YDR032C 597 nt12.73□□□□□ -0.37
UBC9P50623 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
UBC9P50623 TIR1YER011W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
UBC9P50623 YJR018WYJR018W 363 nt12.68□□□□□ -0.38
UBC9P50623 BSC6YOL137W 1494 nt12.62□□□□□ -0.39
UBC9P50623 SSA3YBL075C 1950 nt12.61□□□□□ -0.39
UBC9P50623 PTC2YER089C 1395 nt12.6□□□□□ -0.39
UBC9P50623 BUD23YCR047C 828 nt12.59□□□□□ -0.39
UBC9P50623 SSA1YAL005C 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
UBC9P50623 NAB2YGL122C 1578 nt12.46□□□□□ -0.42
UBC9P50623 RPP2BYDR382W 333 nt12.41□□□□□ -0.42
UBC9P50623 YJR120WYJR120W 351 nt12.41□□□□□ -0.42
UBC9P50623 SRB2YHR041C 633 nt12.31□□□□□ -0.44
UBC9P50623 FPR4YLR449W 1179 nt12.28□□□□□ -0.44
UBC9P50623 DAL1YIR027C 1383 nt12.27□□□□□ -0.45
UBC9P50623 INM2YDR287W 879 nt12.24□□□□□ -0.45
UBC9P50623 SHU1YHL006C 453 nt12.24□□□□□ -0.45
UBC9P50623 FIS1YIL065C 468 nt12.23□□□□□ -0.45
UBC9P50623 YKL097CYKL097C 411 nt12.19□□□□□ -0.46
UBC9P50623 PHO4YFR034C 939 nt12.14□□□□□ -0.47
UBC9P50623 WWM1YFL010C 636 nt12.13□□□□□ -0.47
UBC9P50623 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.12□□□□□ -0.47
UBC9P50623 BDH2YAL061W 1254 nt12.12□□□□□ -0.47
UBC9P50623 YBL100CYBL100C 315 nt12.11□□□□□ -0.47
UBC9P50623 SPT5YML010W 3192 nt12.03□□□□□ -0.48
UBC9P50623 YGR021WYGR021W 873 nt12.02□□□□□ -0.49
UBC9P50623 HOM6YJR139C 1080 nt11.96□□□□□ -0.49
UBC9P50623 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.5
UBC9P50623 LSM3YLR438C-A 270 nt11.94□□□□□ -0.5
UBC9P50623 YPS1YLR120C 1710 nt11.94□□□□□ -0.5
UBC9P50623 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.93□□□□□ -0.5
UBC9P50623 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
UBC9P50623 MNP1YGL068W 585 nt11.9□□□□□ -0.5
UBC9P50623 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.85□□□□□ -0.51
UBC9P50623 MEP2YNL142W 1500 nt11.85□□□□□ -0.51
UBC9P50623 YDR095CYDR095C 411 nt11.84□□□□□ -0.51
UBC9P50623 ALF1YNL148C 765 nt11.83□□□□□ -0.52
UBC9P50623 RKM5YLR137W 1104 nt11.79□□□□□ -0.52
UBC9P50623 CCT6YDR188W 1641 nt11.78□□□□□ -0.52
UBC9P50623 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.71□□□□□ -0.53
UBC9P50623 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.71□□□□□ -0.53
UBC9P50623 YOR139CYOR139C 393 nt11.69□□□□□ -0.54
UBC9P50623 SSA4YER103W 1929 nt11.68□□□□□ -0.54
UBC9P50623 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
UBC9P50623 NPL3YDR432W 1245 nt11.66□□□□□ -0.54
UBC9P50623 YOL037CYOL037C 354 nt11.65□□□□□ -0.54
UBC9P50623 RPP2AYOL039W 321 nt11.64□□□□□ -0.55
UBC9P50623 SIS1YNL007C 1059 nt11.62□□□□□ -0.55
UBC9P50623 PTP1YDL230W 1008 nt11.57□□□□□ -0.56
UBC9P50623 EMI2YDR516C 1503 nt11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms