Protein–RNA interactions for Protein: P40054

SER3, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SER3P40054 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.77■□□□□ 0.6
SER3P40054 NOP1YDL014W 984 nt18.41■□□□□ 0.54
SER3P40054 NSR1YGR159C 1245 nt18.37■□□□□ 0.53
SER3P40054 YKL036CYKL036C 393 nt17.25■□□□□ 0.35
SER3P40054 Q0297Q0297 156 nt16.17■□□□□ 0.18
SER3P40054 YJL027CYJL027C 417 nt16.17■□□□□ 0.18
SER3P40054 SRX1YKL086W 384 nt16.05■□□□□ 0.16
SER3P40054 MDJ1YFL016C 1536 nt15.99■□□□□ 0.15
SER3P40054 SCS3YGL126W 1143 nt15.82■□□□□ 0.12
SER3P40054 YCR051WYCR051W 669 nt15.28■□□□□ 0.04
SER3P40054 YOL085CYOL085C 342 nt14.91□□□□□ -0.02
SER3P40054 SSA3YBL075C 1950 nt14.67□□□□□ -0.06
SER3P40054 PKP1YIL042C 1185 nt14.65□□□□□ -0.06
SER3P40054 RPP1BYDL130W 321 nt14.52□□□□□ -0.09
SER3P40054 SCJ1YMR214W 1134 nt14.43□□□□□ -0.1
SER3P40054 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.3□□□□□ -0.12
SER3P40054 ATS1YAL020C 1002 nt14.25□□□□□ -0.13
SER3P40054 DBP2YNL112W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
SER3P40054 CCC1YLR220W 969 nt14.21□□□□□ -0.13
SER3P40054 PET122YER153C 765 nt13.82□□□□□ -0.2
SER3P40054 SCR1SCR1 522 nt13.81□□□□□ -0.2
SER3P40054 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.65□□□□□ -0.22
SER3P40054 YBR190WYBR190W 312 nt13.58□□□□□ -0.24
SER3P40054 RVS167YDR388W 1449 nt13.56□□□□□ -0.24
SER3P40054 RRN5YLR141W 1092 nt13.47□□□□□ -0.25
SER3P40054 RTC3YHR087W 336 nt13.34□□□□□ -0.27
SER3P40054 RSB1YOR049C 1065 nt13.31□□□□□ -0.28
SER3P40054 YDJ1YNL064C 1230 nt13.21□□□□□ -0.29
SER3P40054 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.2□□□□□ -0.3
SER3P40054 PST2YDR032C 597 nt13.13□□□□□ -0.31
SER3P40054 SHR5YOL110W 714 nt13.12□□□□□ -0.31
SER3P40054 PUT4YOR348C 1884 nt13□□□□□ -0.33
SER3P40054 GAR1YHR089C 618 nt12.88□□□□□ -0.35
SER3P40054 YKL097CYKL097C 411 nt12.82□□□□□ -0.36
SER3P40054 SSA4YER103W 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
SER3P40054 DEP1YAL013W 1218 nt12.65□□□□□ -0.38
SER3P40054 URN1YPR152C 1398 nt12.56□□□□□ -0.4
SER3P40054 SPT5YML010W 3192 nt12.54□□□□□ -0.4
SER3P40054 POA1YBR022W 534 nt12.54□□□□□ -0.4
SER3P40054 SHU1YHL006C 453 nt12.52□□□□□ -0.41
SER3P40054 RPN10YHR200W 807 nt12.5□□□□□ -0.41
SER3P40054 YNL208WYNL208W 600 nt12.5□□□□□ -0.41
SER3P40054 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.42
SER3P40054 ARE1YCR048W 1833 nt12.44□□□□□ -0.42
SER3P40054 TIR1YER011W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
SER3P40054 PAC11YDR488C 1602 nt12.37□□□□□ -0.43
SER3P40054 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.33□□□□□ -0.44
SER3P40054 OPI9YLR338W 858 nt12.31□□□□□ -0.44
SER3P40054 BDF1YLR399C 2061 nt12.28□□□□□ -0.44
SER3P40054 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.24□□□□□ -0.45
SER3P40054 YOR139CYOR139C 393 nt12.19□□□□□ -0.46
SER3P40054 SSA1YAL005C 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
SER3P40054 SAH1YER043C 1350 nt12.15□□□□□ -0.46
SER3P40054 TAT1YBR069C 1860 nt12.1□□□□□ -0.47
SER3P40054 NPL3YDR432W 1245 nt12.09□□□□□ -0.47
SER3P40054 NVJ2YPR091C 2313 nt12.03□□□□□ -0.48
SER3P40054 YJR018WYJR018W 363 nt12.02□□□□□ -0.49
SER3P40054 BUD23YCR047C 828 nt12□□□□□ -0.49
SER3P40054 YGR021WYGR021W 873 nt11.98□□□□□ -0.49
SER3P40054 SRB2YHR041C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
SER3P40054 PUN1YLR414C 792 nt11.98□□□□□ -0.49
SER3P40054 Q0182Q0182 405 nt11.96□□□□□ -0.49
SER3P40054 WWM1YFL010C 636 nt11.92□□□□□ -0.5
SER3P40054 HOM6YJR139C 1080 nt11.91□□□□□ -0.5
SER3P40054 RPP2BYDR382W 333 nt11.9□□□□□ -0.5
SER3P40054 MNP1YGL068W 585 nt11.89□□□□□ -0.51
SER3P40054 YOL037CYOL037C 354 nt11.85□□□□□ -0.51
SER3P40054 YJR120WYJR120W 351 nt11.82□□□□□ -0.52
SER3P40054 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
SER3P40054 PTC2YER089C 1395 nt11.76□□□□□ -0.53
SER3P40054 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.74□□□□□ -0.53
SER3P40054 RKM5YLR137W 1104 nt11.74□□□□□ -0.53
SER3P40054 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.71□□□□□ -0.53
SER3P40054 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.71□□□□□ -0.53
SER3P40054 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.71□□□□□ -0.53
SER3P40054 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.71□□□□□ -0.53
SER3P40054 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.71□□□□□ -0.53
SER3P40054 BDH2YAL061W 1254 nt11.67□□□□□ -0.54
SER3P40054 NAB2YGL122C 1578 nt11.67□□□□□ -0.54
SER3P40054 LSM3YLR438C-A 270 nt11.58□□□□□ -0.56
SER3P40054 INM2YDR287W 879 nt11.57□□□□□ -0.56
SER3P40054 DCW1YKL046C 1350 nt11.55□□□□□ -0.56
SER3P40054 PUS2YGL063W 1113 nt11.55□□□□□ -0.56
SER3P40054 YBR220CYBR220C 1683 nt11.53□□□□□ -0.56
SER3P40054 YLR281CYLR281C 468 nt11.53□□□□□ -0.56
SER3P40054 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
SER3P40054 FPR4YLR449W 1179 nt11.5□□□□□ -0.57
SER3P40054 FPS1YLL043W 2010 nt11.5□□□□□ -0.57
SER3P40054 YBL100CYBL100C 315 nt11.49□□□□□ -0.57
SER3P40054 DAL1YIR027C 1383 nt11.48□□□□□ -0.57
SER3P40054 WHI5YOR083W 888 nt11.46□□□□□ -0.57
SER3P40054 TRM9YML014W 840 nt11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms