Protein–RNA interactions for Protein: P35725

YKL063C, Uncharacterized protein YKL063C, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CP35725 NSR1YGR159C 1245 nt17.48■□□□□ 0.39
YKL063CP35725 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.31■□□□□ 0.36
YKL063CP35725 NOP1YDL014W 984 nt16.77■□□□□ 0.28
YKL063CP35725 MDJ1YFL016C 1536 nt15.73■□□□□ 0.11
YKL063CP35725 YKL036CYKL036C 393 nt15.22■□□□□ 0.03
YKL063CP35725 SRX1YKL086W 384 nt14.66□□□□□ -0.06
YKL063CP35725 Q0297Q0297 156 nt14.62□□□□□ -0.07
YKL063CP35725 SSA3YBL075C 1950 nt14.55□□□□□ -0.08
YKL063CP35725 YJL027CYJL027C 417 nt14.49□□□□□ -0.09
YKL063CP35725 YCR051WYCR051W 669 nt13.84□□□□□ -0.19
YKL063CP35725 DBP2YNL112W 1641 nt13.83□□□□□ -0.2
YKL063CP35725 YBR190WYBR190W 312 nt13.72□□□□□ -0.21
YKL063CP35725 SCS3YGL126W 1143 nt13.71□□□□□ -0.21
YKL063CP35725 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.4□□□□□ -0.26
YKL063CP35725 RTC3YHR087W 336 nt13.35□□□□□ -0.27
YKL063CP35725 CCC1YLR220W 969 nt13.21□□□□□ -0.29
YKL063CP35725 YOL085CYOL085C 342 nt13.19□□□□□ -0.3
YKL063CP35725 PUT4YOR348C 1884 nt13.11□□□□□ -0.31
YKL063CP35725 RPP1BYDL130W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
YKL063CP35725 PKP1YIL042C 1185 nt12.98□□□□□ -0.33
YKL063CP35725 RVS167YDR388W 1449 nt12.94□□□□□ -0.34
YKL063CP35725 SCJ1YMR214W 1134 nt12.82□□□□□ -0.36
YKL063CP35725 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
YKL063CP35725 POA1YBR022W 534 nt12.62□□□□□ -0.39
YKL063CP35725 SPT5YML010W 3192 nt12.6□□□□□ -0.39
YKL063CP35725 ARE1YCR048W 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
YKL063CP35725 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.58□□□□□ -0.4
YKL063CP35725 BSC6YOL137W 1494 nt12.53□□□□□ -0.4
YKL063CP35725 PET122YER153C 765 nt12.52□□□□□ -0.41
YKL063CP35725 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.45□□□□□ -0.42
YKL063CP35725 SHR5YOL110W 714 nt12.44□□□□□ -0.42
YKL063CP35725 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
YKL063CP35725 SCR1SCR1 522 nt12.33□□□□□ -0.44
YKL063CP35725 SAH1YER043C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
YKL063CP35725 NVJ2YPR091C 2313 nt12.28□□□□□ -0.44
YKL063CP35725 BDF1YLR399C 2061 nt12.25□□□□□ -0.45
YKL063CP35725 URN1YPR152C 1398 nt12.23□□□□□ -0.45
YKL063CP35725 ATS1YAL020C 1002 nt12.2□□□□□ -0.46
YKL063CP35725 YDJ1YNL064C 1230 nt12.2□□□□□ -0.46
YKL063CP35725 OPI9YLR338W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
YKL063CP35725 RRN5YLR141W 1092 nt12.13□□□□□ -0.47
YKL063CP35725 DEP1YAL013W 1218 nt12.12□□□□□ -0.47
YKL063CP35725 BUD23YCR047C 828 nt12.09□□□□□ -0.47
YKL063CP35725 TAT1YBR069C 1860 nt12.08□□□□□ -0.48
YKL063CP35725 FPS1YLL043W 2010 nt12.08□□□□□ -0.48
YKL063CP35725 RPN10YHR200W 807 nt12.01□□□□□ -0.49
YKL063CP35725 YNL208WYNL208W 600 nt11.95□□□□□ -0.5
YKL063CP35725 GAR1YHR089C 618 nt11.91□□□□□ -0.5
YKL063CP35725 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.9□□□□□ -0.5
YKL063CP35725 MEP2YNL142W 1500 nt11.88□□□□□ -0.51
YKL063CP35725 PUN1YLR414C 792 nt11.85□□□□□ -0.51
YKL063CP35725 NAB2YGL122C 1578 nt11.82□□□□□ -0.52
YKL063CP35725 PTC2YER089C 1395 nt11.8□□□□□ -0.52
YKL063CP35725 RSB1YOR049C 1065 nt11.79□□□□□ -0.52
YKL063CP35725 SSA1YAL005C 1929 nt11.77□□□□□ -0.53
YKL063CP35725 YJR018WYJR018W 363 nt11.66□□□□□ -0.54
YKL063CP35725 DCW1YKL046C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
YKL063CP35725 YBR220CYBR220C 1683 nt11.57□□□□□ -0.56
YKL063CP35725 YMR090WYMR090W 684 nt11.56□□□□□ -0.56
YKL063CP35725 TIR1YER011W 765 nt11.55□□□□□ -0.56
YKL063CP35725 FIS1YIL065C 468 nt11.51□□□□□ -0.57
YKL063CP35725 EMI2YDR516C 1503 nt11.48□□□□□ -0.57
YKL063CP35725 DAL1YIR027C 1383 nt11.47□□□□□ -0.57
YKL063CP35725 YPS1YLR120C 1710 nt11.46□□□□□ -0.57
YKL063CP35725 YJR120WYJR120W 351 nt11.44□□□□□ -0.58
YKL063CP35725 YJL225CYJL225C 5277 nt11.43□□□□□ -0.58
YKL063CP35725 PCH2YBR186W 1695 nt11.41□□□□□ -0.58
YKL063CP35725 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.4□□□□□ -0.58
YKL063CP35725 FPR4YLR449W 1179 nt11.4□□□□□ -0.58
YKL063CP35725 SEC11YIR022W 504 nt11.38□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 GUT2YIL155C 1950 nt11.37□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 SDH1YKL148C 1923 nt11.37□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 PST2YDR032C 597 nt11.36□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 RPP2BYDR382W 333 nt11.35□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 PHO4YFR034C 939 nt11.35□□□□□ -0.59
YKL063CP35725 YDL221WYDL221W 552 nt11.32□□□□□ -0.6
YKL063CP35725 INM2YDR287W 879 nt11.3□□□□□ -0.6
YKL063CP35725 UME6YDR207C 2511 nt11.29□□□□□ -0.6
YKL063CP35725 YDR095CYDR095C 411 nt11.25□□□□□ -0.61
YKL063CP35725 SRB2YHR041C 633 nt11.21□□□□□ -0.61
YKL063CP35725 SCC4YER147C 1875 nt11.15□□□□□ -0.62
YKL063CP35725 YBL100CYBL100C 315 nt11.13□□□□□ -0.63
YKL063CP35725 CAC2YML102W 1407 nt11.11□□□□□ -0.63
YKL063CP35725 PIB2YGL023C 1908 nt11.11□□□□□ -0.63
YKL063CP35725 BDH2YAL061W 1254 nt11.1□□□□□ -0.63
YKL063CP35725 RPP2AYOL039W 321 nt11.05□□□□□ -0.64
YKL063CP35725 PTP1YDL230W 1008 nt11.04□□□□□ -0.64
YKL063CP35725 RTF1YGL244W 1677 nt11.04□□□□□ -0.64
YKL063CP35725 YSC84YHR016C 1407 nt11□□□□□ -0.65
YKL063CP35725 FUN26YAL022C 1554 nt10.99□□□□□ -0.65
YKL063CP35725 WWM1YFL010C 636 nt10.99□□□□□ -0.65
YKL063CP35725 BOR1YNL275W 1731 nt10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms