Protein–RNA interactions for Protein: P53859

CSL4, Exosome complex component CSL4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSL4P53859 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.14■□□□□ 0.65
CSL4P53859 NSR1YGR159C 1245 nt19.13■□□□□ 0.65
CSL4P53859 NOP1YDL014W 984 nt18.66■□□□□ 0.58
CSL4P53859 YKL036CYKL036C 393 nt17.74■□□□□ 0.43
CSL4P53859 MDJ1YFL016C 1536 nt17.17■□□□□ 0.34
CSL4P53859 YJL027CYJL027C 417 nt16.68■□□□□ 0.26
CSL4P53859 Q0297Q0297 156 nt16.47■□□□□ 0.23
CSL4P53859 SCS3YGL126W 1143 nt16.42■□□□□ 0.22
CSL4P53859 SRX1YKL086W 384 nt16.25■□□□□ 0.19
CSL4P53859 YCR051WYCR051W 669 nt15.45■□□□□ 0.06
CSL4P53859 SCJ1YMR214W 1134 nt15.45■□□□□ 0.06
CSL4P53859 YOL085CYOL085C 342 nt15.3■□□□□ 0.04
CSL4P53859 DBP2YNL112W 1641 nt15.2■□□□□ 0.02
CSL4P53859 PKP1YIL042C 1185 nt14.94□□□□□ -0.02
CSL4P53859 ATS1YAL020C 1002 nt14.87□□□□□ -0.03
CSL4P53859 RPP1BYDL130W 321 nt14.78□□□□□ -0.04
CSL4P53859 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
CSL4P53859 CCC1YLR220W 969 nt14.61□□□□□ -0.07
CSL4P53859 YBR190WYBR190W 312 nt14.61□□□□□ -0.07
CSL4P53859 RTC3YHR087W 336 nt14.25□□□□□ -0.13
CSL4P53859 SCR1SCR1 522 nt14.14□□□□□ -0.15
CSL4P53859 RVS167YDR388W 1449 nt14.07□□□□□ -0.16
CSL4P53859 PET122YER153C 765 nt13.99□□□□□ -0.17
CSL4P53859 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.93□□□□□ -0.18
CSL4P53859 RRN5YLR141W 1092 nt13.66□□□□□ -0.22
CSL4P53859 PST2YDR032C 597 nt13.65□□□□□ -0.22
CSL4P53859 SHR5YOL110W 714 nt13.62□□□□□ -0.23
CSL4P53859 RSB1YOR049C 1065 nt13.61□□□□□ -0.23
CSL4P53859 YKL097CYKL097C 411 nt13.5□□□□□ -0.25
CSL4P53859 YDJ1YNL064C 1230 nt13.45□□□□□ -0.26
CSL4P53859 PUT4YOR348C 1884 nt13.43□□□□□ -0.26
CSL4P53859 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.4□□□□□ -0.26
CSL4P53859 URN1YPR152C 1398 nt13.33□□□□□ -0.27
CSL4P53859 DEP1YAL013W 1218 nt13.33□□□□□ -0.28
CSL4P53859 GAR1YHR089C 618 nt13.19□□□□□ -0.3
CSL4P53859 OPI9YLR338W 858 nt13.17□□□□□ -0.3
CSL4P53859 ARE1YCR048W 1833 nt13.16□□□□□ -0.3
CSL4P53859 SAH1YER043C 1350 nt13.16□□□□□ -0.3
CSL4P53859 YNL208WYNL208W 600 nt13.04□□□□□ -0.32
CSL4P53859 RPN10YHR200W 807 nt13□□□□□ -0.33
CSL4P53859 POA1YBR022W 534 nt12.99□□□□□ -0.33
CSL4P53859 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.94□□□□□ -0.34
CSL4P53859 SHU1YHL006C 453 nt12.92□□□□□ -0.34
CSL4P53859 SSA3YBL075C 1950 nt12.81□□□□□ -0.36
CSL4P53859 TIR1YER011W 765 nt12.75□□□□□ -0.37
CSL4P53859 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
CSL4P53859 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
CSL4P53859 BSC6YOL137W 1494 nt12.72□□□□□ -0.37
CSL4P53859 YJR018WYJR018W 363 nt12.71□□□□□ -0.37
CSL4P53859 SSA1YAL005C 1929 nt12.68□□□□□ -0.38
CSL4P53859 PTC2YER089C 1395 nt12.66□□□□□ -0.38
CSL4P53859 YJR120WYJR120W 351 nt12.63□□□□□ -0.39
CSL4P53859 BUD23YCR047C 828 nt12.61□□□□□ -0.39
CSL4P53859 NPL3YDR432W 1245 nt12.61□□□□□ -0.39
CSL4P53859 Q0182Q0182 405 nt12.57□□□□□ -0.4
CSL4P53859 SRB2YHR041C 633 nt12.57□□□□□ -0.4
CSL4P53859 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.49□□□□□ -0.41
CSL4P53859 NAB2YGL122C 1578 nt12.47□□□□□ -0.41
CSL4P53859 FIS1YIL065C 468 nt12.36□□□□□ -0.43
CSL4P53859 RPP2BYDR382W 333 nt12.33□□□□□ -0.44
CSL4P53859 SPT5YML010W 3192 nt12.33□□□□□ -0.44
CSL4P53859 DAL1YIR027C 1383 nt12.29□□□□□ -0.44
CSL4P53859 YOL037CYOL037C 354 nt12.25□□□□□ -0.45
CSL4P53859 FPR4YLR449W 1179 nt12.24□□□□□ -0.45
CSL4P53859 INM2YDR287W 879 nt12.23□□□□□ -0.45
CSL4P53859 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CSL4P53859 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CSL4P53859 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CSL4P53859 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CSL4P53859 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CSL4P53859 WWM1YFL010C 636 nt12.21□□□□□ -0.45
CSL4P53859 PHO4YFR034C 939 nt12.2□□□□□ -0.46
CSL4P53859 YGR021WYGR021W 873 nt12.19□□□□□ -0.46
CSL4P53859 BDH2YAL061W 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
CSL4P53859 YBL100CYBL100C 315 nt12.12□□□□□ -0.47
CSL4P53859 HOM6YJR139C 1080 nt12.08□□□□□ -0.48
CSL4P53859 MNP1YGL068W 585 nt12.07□□□□□ -0.48
CSL4P53859 MOT3YMR070W 1473 nt12.07□□□□□ -0.48
CSL4P53859 YPS1YLR120C 1710 nt12.03□□□□□ -0.48
CSL4P53859 FUN26YAL022C 1554 nt12□□□□□ -0.49
CSL4P53859 MEP2YNL142W 1500 nt11.95□□□□□ -0.5
CSL4P53859 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.94□□□□□ -0.5
CSL4P53859 LSM3YLR438C-A 270 nt11.94□□□□□ -0.5
CSL4P53859 YDR095CYDR095C 411 nt11.93□□□□□ -0.5
CSL4P53859 PUS2YGL063W 1113 nt11.93□□□□□ -0.5
CSL4P53859 RKM5YLR137W 1104 nt11.92□□□□□ -0.5
CSL4P53859 TRM9YML014W 840 nt11.9□□□□□ -0.5
CSL4P53859 MRPL8YJL063C 717 nt11.87□□□□□ -0.51
CSL4P53859 SSA4YER103W 1929 nt11.84□□□□□ -0.51
CSL4P53859 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.84□□□□□ -0.51
CSL4P53859 YLR281CYLR281C 468 nt11.84□□□□□ -0.51
CSL4P53859 CCT6YDR188W 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
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