Protein–RNA interactions for Protein: P40363

YJL068C, S-formylglutathione hydrolase, yeastyeast

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL068CP40363 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.11■□□□□ 0.65
YJL068CP40363 NSR1YGR159C 1245 nt19.1■□□□□ 0.65
YJL068CP40363 NOP1YDL014W 984 nt18.55■□□□□ 0.56
YJL068CP40363 MDJ1YFL016C 1536 nt17.06■□□□□ 0.32
YJL068CP40363 YKL036CYKL036C 393 nt16.96■□□□□ 0.31
YJL068CP40363 SRX1YKL086W 384 nt16.17■□□□□ 0.18
YJL068CP40363 Q0297Q0297 156 nt16.15■□□□□ 0.18
YJL068CP40363 YJL027CYJL027C 417 nt15.81■□□□□ 0.12
YJL068CP40363 YCR051WYCR051W 669 nt15.35■□□□□ 0.05
YJL068CP40363 SCS3YGL126W 1143 nt15.32■□□□□ 0.04
YJL068CP40363 DBP2YNL112W 1641 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL068CP40363 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 YOL085CYOL085C 342 nt14.66□□□□□ -0.06
YJL068CP40363 YBR190WYBR190W 312 nt14.61□□□□□ -0.07
YJL068CP40363 CCC1YLR220W 969 nt14.55□□□□□ -0.08
YJL068CP40363 RPP1BYDL130W 321 nt14.49□□□□□ -0.09
YJL068CP40363 PKP1YIL042C 1185 nt14.45□□□□□ -0.1
YJL068CP40363 RTC3YHR087W 336 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL068CP40363 RVS167YDR388W 1449 nt14.19□□□□□ -0.14
YJL068CP40363 SCJ1YMR214W 1134 nt13.98□□□□□ -0.17
YJL068CP40363 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.85□□□□□ -0.19
YJL068CP40363 PET122YER153C 765 nt13.84□□□□□ -0.19
YJL068CP40363 SCR1SCR1 522 nt13.73□□□□□ -0.21
YJL068CP40363 ATS1YAL020C 1002 nt13.66□□□□□ -0.22
YJL068CP40363 SHR5YOL110W 714 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL068CP40363 RRN5YLR141W 1092 nt13.43□□□□□ -0.26
YJL068CP40363 YDJ1YNL064C 1230 nt13.42□□□□□ -0.26
YJL068CP40363 URN1YPR152C 1398 nt13.32□□□□□ -0.28
YJL068CP40363 PUT4YOR348C 1884 nt13.31□□□□□ -0.28
YJL068CP40363 DEP1YAL013W 1218 nt13.25□□□□□ -0.29
YJL068CP40363 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.16□□□□□ -0.3
YJL068CP40363 RPN10YHR200W 807 nt13.15□□□□□ -0.3
YJL068CP40363 RSB1YOR049C 1065 nt13.15□□□□□ -0.3
YJL068CP40363 OPI9YLR338W 858 nt13.14□□□□□ -0.31
YJL068CP40363 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL068CP40363 SAH1YER043C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
YJL068CP40363 YNL208WYNL208W 600 nt13.06□□□□□ -0.32
YJL068CP40363 ARE1YCR048W 1833 nt13.03□□□□□ -0.32
YJL068CP40363 Q0182Q0182 405 nt12.94□□□□□ -0.34
YJL068CP40363 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.91□□□□□ -0.34
YJL068CP40363 POA1YBR022W 534 nt12.91□□□□□ -0.34
YJL068CP40363 PUN1YLR414C 792 nt12.8□□□□□ -0.36
YJL068CP40363 SSA3YBL075C 1950 nt12.74□□□□□ -0.37
YJL068CP40363 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
YJL068CP40363 YJR018WYJR018W 363 nt12.7□□□□□ -0.38
YJL068CP40363 BSC6YOL137W 1494 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL068CP40363 PST2YDR032C 597 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL068CP40363 BUD23YCR047C 828 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL068CP40363 PTC2YER089C 1395 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL068CP40363 SSA1YAL005C 1929 nt12.52□□□□□ -0.4
YJL068CP40363 NAB2YGL122C 1578 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL068CP40363 RPP2BYDR382W 333 nt12.46□□□□□ -0.41
YJL068CP40363 YJR120WYJR120W 351 nt12.39□□□□□ -0.43
YJL068CP40363 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
YJL068CP40363 INM2YDR287W 879 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL068CP40363 FPR4YLR449W 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL068CP40363 FIS1YIL065C 468 nt12.27□□□□□ -0.45
YJL068CP40363 SRB2YHR041C 633 nt12.23□□□□□ -0.45
YJL068CP40363 PHO4YFR034C 939 nt12.18□□□□□ -0.46
YJL068CP40363 SHU1YHL006C 453 nt12.18□□□□□ -0.46
YJL068CP40363 MOT3YMR070W 1473 nt12.18□□□□□ -0.46
YJL068CP40363 YKL097CYKL097C 411 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL068CP40363 BDH2YAL061W 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL068CP40363 YBL100CYBL100C 315 nt12.13□□□□□ -0.47
YJL068CP40363 WWM1YFL010C 636 nt12.1□□□□□ -0.47
YJL068CP40363 SPT5YML010W 3192 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL068CP40363 YGR021WYGR021W 873 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL068CP40363 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL068CP40363 YPS1YLR120C 1710 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL068CP40363 FUN26YAL022C 1554 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL068CP40363 LSM3YLR438C-A 270 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL068CP40363 TRM9YML014W 840 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL068CP40363 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL068CP40363 HOM6YJR139C 1080 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL068CP40363 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.9□□□□□ -0.5
YJL068CP40363 MEP2YNL142W 1500 nt11.9□□□□□ -0.5
YJL068CP40363 YDR095CYDR095C 411 nt11.89□□□□□ -0.51
YJL068CP40363 ALF1YNL148C 765 nt11.89□□□□□ -0.51
YJL068CP40363 MNP1YGL068W 585 nt11.85□□□□□ -0.51
YJL068CP40363 CCT6YDR188W 1641 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL068CP40363 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YJL068CP40363 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.78□□□□□ -0.52
YJL068CP40363 RKM5YLR137W 1104 nt11.78□□□□□ -0.52
YJL068CP40363 SSA4YER103W 1929 nt11.74□□□□□ -0.53
YJL068CP40363 RPP2AYOL039W 321 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL068CP40363 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
YJL068CP40363 YOL037CYOL037C 354 nt11.66□□□□□ -0.54
YJL068CP40363 SIS1YNL007C 1059 nt11.64□□□□□ -0.55
YJL068CP40363 NPL3YDR432W 1245 nt11.63□□□□□ -0.55
YJL068CP40363 YOR139CYOR139C 393 nt11.61□□□□□ -0.55
YJL068CP40363 PTP1YDL230W 1008 nt11.58□□□□□ -0.56
YJL068CP40363 EMI2YDR516C 1503 nt11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms