Protein–RNA interactions for Protein: Q05043

RSF1, Respiration factor 1, yeastyeast

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RSF1Q05043 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.23■□□□□ 0.67
RSF1Q05043 NSR1YGR159C 1245 nt18.95■□□□□ 0.62
RSF1Q05043 NOP1YDL014W 984 nt18.94■□□□□ 0.62
RSF1Q05043 YKL036CYKL036C 393 nt17.67■□□□□ 0.42
RSF1Q05043 MDJ1YFL016C 1536 nt17.01■□□□□ 0.31
RSF1Q05043 Q0297Q0297 156 nt16.6■□□□□ 0.25
RSF1Q05043 YJL027CYJL027C 417 nt16.54■□□□□ 0.24
RSF1Q05043 SRX1YKL086W 384 nt16.49■□□□□ 0.23
RSF1Q05043 SCS3YGL126W 1143 nt16.16■□□□□ 0.18
RSF1Q05043 YCR051WYCR051W 669 nt15.63■□□□□ 0.09
RSF1Q05043 YOL085CYOL085C 342 nt15.25■□□□□ 0.03
RSF1Q05043 DBP2YNL112W 1641 nt14.95□□□□□ -0.02
RSF1Q05043 PKP1YIL042C 1185 nt14.91□□□□□ -0.02
RSF1Q05043 RPP1BYDL130W 321 nt14.9□□□□□ -0.02
RSF1Q05043 SCJ1YMR214W 1134 nt14.81□□□□□ -0.04
RSF1Q05043 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.69□□□□□ -0.06
RSF1Q05043 ATS1YAL020C 1002 nt14.56□□□□□ -0.08
RSF1Q05043 CCC1YLR220W 969 nt14.52□□□□□ -0.09
RSF1Q05043 YBR190WYBR190W 312 nt14.5□□□□□ -0.09
RSF1Q05043 RTC3YHR087W 336 nt14.24□□□□□ -0.13
RSF1Q05043 SCR1SCR1 522 nt14.19□□□□□ -0.14
RSF1Q05043 PET122YER153C 765 nt14.12□□□□□ -0.15
RSF1Q05043 RVS167YDR388W 1449 nt14.02□□□□□ -0.16
RSF1Q05043 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14□□□□□ -0.17
RSF1Q05043 RRN5YLR141W 1092 nt13.76□□□□□ -0.21
RSF1Q05043 YDJ1YNL064C 1230 nt13.6□□□□□ -0.23
RSF1Q05043 RSB1YOR049C 1065 nt13.59□□□□□ -0.23
RSF1Q05043 SHR5YOL110W 714 nt13.52□□□□□ -0.25
RSF1Q05043 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.5□□□□□ -0.25
RSF1Q05043 PST2YDR032C 597 nt13.43□□□□□ -0.26
RSF1Q05043 PUT4YOR348C 1884 nt13.28□□□□□ -0.28
RSF1Q05043 URN1YPR152C 1398 nt13.24□□□□□ -0.29
RSF1Q05043 DEP1YAL013W 1218 nt13.23□□□□□ -0.29
RSF1Q05043 GAR1YHR089C 618 nt13.18□□□□□ -0.3
RSF1Q05043 YKL097CYKL097C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
RSF1Q05043 OPI9YLR338W 858 nt13.05□□□□□ -0.32
RSF1Q05043 SAH1YER043C 1350 nt13.05□□□□□ -0.32
RSF1Q05043 ARE1YCR048W 1833 nt13□□□□□ -0.33
RSF1Q05043 RPN10YHR200W 807 nt12.98□□□□□ -0.33
RSF1Q05043 YNL208WYNL208W 600 nt12.94□□□□□ -0.34
RSF1Q05043 POA1YBR022W 534 nt12.9□□□□□ -0.34
RSF1Q05043 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.86□□□□□ -0.35
RSF1Q05043 SHU1YHL006C 453 nt12.77□□□□□ -0.37
RSF1Q05043 TIR1YER011W 765 nt12.75□□□□□ -0.37
RSF1Q05043 SSA3YBL075C 1950 nt12.72□□□□□ -0.37
RSF1Q05043 PUN1YLR414C 792 nt12.66□□□□□ -0.38
RSF1Q05043 BSC6YOL137W 1494 nt12.63□□□□□ -0.39
RSF1Q05043 YJR018WYJR018W 363 nt12.61□□□□□ -0.39
RSF1Q05043 BUD23YCR047C 828 nt12.59□□□□□ -0.39
RSF1Q05043 Q0182Q0182 405 nt12.59□□□□□ -0.39
RSF1Q05043 PTC2YER089C 1395 nt12.57□□□□□ -0.4
RSF1Q05043 SSA1YAL005C 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
RSF1Q05043 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.44□□□□□ -0.42
RSF1Q05043 YOR139CYOR139C 393 nt12.41□□□□□ -0.42
RSF1Q05043 NAB2YGL122C 1578 nt12.4□□□□□ -0.42
RSF1Q05043 YJR120WYJR120W 351 nt12.37□□□□□ -0.43
RSF1Q05043 NPL3YDR432W 1245 nt12.34□□□□□ -0.43
RSF1Q05043 YGR021WYGR021W 873 nt12.33□□□□□ -0.44
RSF1Q05043 RPP2BYDR382W 333 nt12.31□□□□□ -0.44
RSF1Q05043 SRB2YHR041C 633 nt12.26□□□□□ -0.45
RSF1Q05043 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
RSF1Q05043 DAL1YIR027C 1383 nt12.21□□□□□ -0.45
RSF1Q05043 HOM6YJR139C 1080 nt12.21□□□□□ -0.45
RSF1Q05043 FIS1YIL065C 468 nt12.2□□□□□ -0.46
RSF1Q05043 WWM1YFL010C 636 nt12.18□□□□□ -0.46
RSF1Q05043 YOL037CYOL037C 354 nt12.18□□□□□ -0.46
RSF1Q05043 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
RSF1Q05043 MNP1YGL068W 585 nt12.12□□□□□ -0.47
RSF1Q05043 PHO4YFR034C 939 nt12.1□□□□□ -0.47
RSF1Q05043 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.08□□□□□ -0.48
RSF1Q05043 SPT5YML010W 3192 nt12.07□□□□□ -0.48
RSF1Q05043 RKM5YLR137W 1104 nt12.04□□□□□ -0.48
RSF1Q05043 YBL100CYBL100C 315 nt12.04□□□□□ -0.48
RSF1Q05043 BDH2YAL061W 1254 nt12.02□□□□□ -0.49
RSF1Q05043 LSM3YLR438C-A 270 nt11.97□□□□□ -0.49
RSF1Q05043 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.94□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.94□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.94□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.94□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.94□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 YPS1YLR120C 1710 nt11.91□□□□□ -0.5
RSF1Q05043 FUN26YAL022C 1554 nt11.89□□□□□ -0.51
RSF1Q05043 MEP2YNL142W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
RSF1Q05043 TRM9YML014W 840 nt11.85□□□□□ -0.51
RSF1Q05043 MOT3YMR070W 1473 nt11.84□□□□□ -0.51
RSF1Q05043 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.82□□□□□ -0.52
RSF1Q05043 YLR281CYLR281C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
RSF1Q05043 YDR095CYDR095C 411 nt11.8□□□□□ -0.52
RSF1Q05043 PUS2YGL063W 1113 nt11.78□□□□□ -0.52
RSF1Q05043 ALF1YNL148C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
RSF1Q05043 SSA4YER103W 1929 nt11.74□□□□□ -0.53
RSF1Q05043 WHI5YOR083W 888 nt11.72□□□□□ -0.53
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