Protein–RNA interactions for Protein: P40532

APQ12, Nuclear membrane organization protein APQ12, yeastyeast

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APQ12P40532 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.65■□□□□ 0.74
APQ12P40532 NSR1YGR159C 1245 nt19.56■□□□□ 0.72
APQ12P40532 NOP1YDL014W 984 nt19.13■□□□□ 0.65
APQ12P40532 YKL036CYKL036C 393 nt17.62■□□□□ 0.41
APQ12P40532 MDJ1YFL016C 1536 nt17.35■□□□□ 0.37
APQ12P40532 Q0297Q0297 156 nt16.72■□□□□ 0.27
APQ12P40532 SRX1YKL086W 384 nt16.7■□□□□ 0.26
APQ12P40532 YJL027CYJL027C 417 nt16.46■□□□□ 0.23
APQ12P40532 SCS3YGL126W 1143 nt16.01■□□□□ 0.15
APQ12P40532 YCR051WYCR051W 669 nt15.84■□□□□ 0.13
APQ12P40532 DBP2YNL112W 1641 nt15.34■□□□□ 0.05
APQ12P40532 YOL085CYOL085C 342 nt15.26■□□□□ 0.03
APQ12P40532 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.08■□□□□ 0
APQ12P40532 PKP1YIL042C 1185 nt15.02■□□□□ -0
APQ12P40532 RPP1BYDL130W 321 nt15□□□□□ -0.01
APQ12P40532 CCC1YLR220W 969 nt14.96□□□□□ -0.01
APQ12P40532 YBR190WYBR190W 312 nt14.82□□□□□ -0.04
APQ12P40532 RTC3YHR087W 336 nt14.5□□□□□ -0.09
APQ12P40532 RVS167YDR388W 1449 nt14.48□□□□□ -0.09
APQ12P40532 ATS1YAL020C 1002 nt14.33□□□□□ -0.12
APQ12P40532 SCJ1YMR214W 1134 nt14.33□□□□□ -0.12
APQ12P40532 PET122YER153C 765 nt14.32□□□□□ -0.12
APQ12P40532 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.28□□□□□ -0.12
APQ12P40532 SCR1SCR1 522 nt14.21□□□□□ -0.13
APQ12P40532 SHR5YOL110W 714 nt13.94□□□□□ -0.18
APQ12P40532 RRN5YLR141W 1092 nt13.92□□□□□ -0.18
APQ12P40532 YDJ1YNL064C 1230 nt13.82□□□□□ -0.2
APQ12P40532 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.64□□□□□ -0.23
APQ12P40532 RSB1YOR049C 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
APQ12P40532 URN1YPR152C 1398 nt13.56□□□□□ -0.24
APQ12P40532 DEP1YAL013W 1218 nt13.53□□□□□ -0.24
APQ12P40532 GAR1YHR089C 618 nt13.51□□□□□ -0.25
APQ12P40532 PUT4YOR348C 1884 nt13.45□□□□□ -0.26
APQ12P40532 RPN10YHR200W 807 nt13.37□□□□□ -0.27
APQ12P40532 YNL208WYNL208W 600 nt13.36□□□□□ -0.27
APQ12P40532 OPI9YLR338W 858 nt13.35□□□□□ -0.27
APQ12P40532 PST2YDR032C 597 nt13.27□□□□□ -0.29
APQ12P40532 SAH1YER043C 1350 nt13.27□□□□□ -0.29
APQ12P40532 ARE1YCR048W 1833 nt13.2□□□□□ -0.3
APQ12P40532 TIR1YER011W 765 nt13.06□□□□□ -0.32
APQ12P40532 POA1YBR022W 534 nt13.04□□□□□ -0.32
APQ12P40532 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.03□□□□□ -0.32
APQ12P40532 PUN1YLR414C 792 nt12.97□□□□□ -0.33
APQ12P40532 YJR018WYJR018W 363 nt12.93□□□□□ -0.34
APQ12P40532 SSA1YAL005C 1929 nt12.9□□□□□ -0.34
APQ12P40532 PTC2YER089C 1395 nt12.82□□□□□ -0.36
APQ12P40532 BSC6YOL137W 1494 nt12.74□□□□□ -0.37
APQ12P40532 BUD23YCR047C 828 nt12.74□□□□□ -0.37
APQ12P40532 YKL097CYKL097C 411 nt12.74□□□□□ -0.37
APQ12P40532 SHU1YHL006C 453 nt12.72□□□□□ -0.37
APQ12P40532 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
APQ12P40532 YJR120WYJR120W 351 nt12.69□□□□□ -0.38
APQ12P40532 NAB2YGL122C 1578 nt12.66□□□□□ -0.38
APQ12P40532 SRB2YHR041C 633 nt12.64□□□□□ -0.39
APQ12P40532 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.53□□□□□ -0.4
APQ12P40532 SSA3YBL075C 1950 nt12.51□□□□□ -0.41
APQ12P40532 DAL1YIR027C 1383 nt12.49□□□□□ -0.41
APQ12P40532 INM2YDR287W 879 nt12.49□□□□□ -0.41
APQ12P40532 WWM1YFL010C 636 nt12.47□□□□□ -0.41
APQ12P40532 FPR4YLR449W 1179 nt12.47□□□□□ -0.41
APQ12P40532 FIS1YIL065C 468 nt12.44□□□□□ -0.42
APQ12P40532 YGR021WYGR021W 873 nt12.42□□□□□ -0.42
APQ12P40532 BDH2YAL061W 1254 nt12.41□□□□□ -0.42
APQ12P40532 PHO4YFR034C 939 nt12.36□□□□□ -0.43
APQ12P40532 HOM6YJR139C 1080 nt12.36□□□□□ -0.43
APQ12P40532 YBL100CYBL100C 315 nt12.36□□□□□ -0.43
APQ12P40532 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.28□□□□□ -0.44
APQ12P40532 MNP1YGL068W 585 nt12.28□□□□□ -0.44
APQ12P40532 LSM3YLR438C-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
APQ12P40532 YOR139CYOR139C 393 nt12.21□□□□□ -0.45
APQ12P40532 FUN26YAL022C 1554 nt12.21□□□□□ -0.46
APQ12P40532 TRM9YML014W 840 nt12.2□□□□□ -0.46
APQ12P40532 RKM5YLR137W 1104 nt12.18□□□□□ -0.46
APQ12P40532 NPL3YDR432W 1245 nt12.14□□□□□ -0.47
APQ12P40532 SPT5YML010W 3192 nt12.14□□□□□ -0.47
APQ12P40532 YPS1YLR120C 1710 nt12.12□□□□□ -0.47
APQ12P40532 YOL037CYOL037C 354 nt12.1□□□□□ -0.47
APQ12P40532 CCT6YDR188W 1641 nt12.07□□□□□ -0.48
APQ12P40532 YDR095CYDR095C 411 nt12.04□□□□□ -0.48
APQ12P40532 ALF1YNL148C 765 nt12.04□□□□□ -0.48
APQ12P40532 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12□□□□□ -0.49
APQ12P40532 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.98□□□□□ -0.49
APQ12P40532 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.98□□□□□ -0.49
APQ12P40532 MEP2YNL142W 1500 nt11.96□□□□□ -0.49
APQ12P40532 SIS1YNL007C 1059 nt11.86□□□□□ -0.51
APQ12P40532 RPP2AYOL039W 321 nt11.83□□□□□ -0.52
APQ12P40532 YLR281CYLR281C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
APQ12P40532 WHI5YOR083W 888 nt11.78□□□□□ -0.52
APQ12P40532 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.76□□□□□ -0.53
APQ12P40532 DCW1YKL046C 1350 nt11.76□□□□□ -0.53
APQ12P40532 PTP1YDL230W 1008 nt11.75□□□□□ -0.53
APQ12P40532 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.1 ms