RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	VPS52	P39904	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PFA4	YOL003C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	SYO1	Q07395	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	SEC39	Q12745	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	RPN12	P32496	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	UTR4	P32626	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	YME1	P32795	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	MSN2	P33748	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	BNA4	P38169	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	MET18	P40469	1032 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
PFA4	YOL003C	JJJ1	P53863	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	SLG1	P54867	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	VPS72	Q03388	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PFA4	YOL003C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	NDE1	P40215	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	DOT5	P40553	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	TWF1	P53250	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	COR1	P07256	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	NDC1	P32500	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	FRE1	P32791	686 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	SEC66	P33754	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CST26	P38226	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	VID24	P38263	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PFA4	YOL003C	RTT101	P47050	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	IVY1	Q04934	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	PHO92	Q06390	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	SIR4	P11978	1358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	SPC110	P32380	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	MBB1	P39534	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RTT103	Q05543	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ATG29	Q12092	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	TIP41	Q12199	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	APC1	P53886	1748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CKA1	P15790	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	BUD14	P27637	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ATS1	P31386	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	PTR2	P32901	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CMC1	P36064	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	MDM31	P38880	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ERP2	P39704	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	COS10	P52924	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	GPI1	P53306	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RPH1	P39956	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	RPR2	P40571	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YDL186W	P48568	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	MRPL19	P53875	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YNL050C	P53952	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	PPT2	Q12036	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ROX1	P25042	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	YCR022C	P25620	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	GPI10	P30777	616 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PFA4	YOL003C	ATP11	P32453	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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