Protein–RNA interactions for Protein: P47050

RTT101, Cullin-8, yeastyeast

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Length 842 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT101P47050 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.18■□□□□ 0.98
RTT101P47050 NSR1YGR159C 1245 nt20.92■□□□□ 0.94
RTT101P47050 NOP1YDL014W 984 nt20.64■□□□□ 0.89
RTT101P47050 YKL036CYKL036C 393 nt19.14■□□□□ 0.65
RTT101P47050 MDJ1YFL016C 1536 nt18.46■□□□□ 0.55
RTT101P47050 Q0297Q0297 156 nt18.07■□□□□ 0.48
RTT101P47050 SRX1YKL086W 384 nt18.01■□□□□ 0.47
RTT101P47050 YJL027CYJL027C 417 nt17.9■□□□□ 0.46
RTT101P47050 SCS3YGL126W 1143 nt17.45■□□□□ 0.38
RTT101P47050 YCR051WYCR051W 669 nt17.13■□□□□ 0.33
RTT101P47050 YOL085CYOL085C 342 nt16.55■□□□□ 0.24
RTT101P47050 DBP2YNL112W 1641 nt16.34■□□□□ 0.21
RTT101P47050 PKP1YIL042C 1185 nt16.31■□□□□ 0.2
RTT101P47050 RPP1BYDL130W 321 nt16.23■□□□□ 0.19
RTT101P47050 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.2■□□□□ 0.18
RTT101P47050 CCC1YLR220W 969 nt16.09■□□□□ 0.17
RTT101P47050 YBR190WYBR190W 312 nt15.72■□□□□ 0.11
RTT101P47050 ATS1YAL020C 1002 nt15.64■□□□□ 0.09
RTT101P47050 SCJ1YMR214W 1134 nt15.61■□□□□ 0.09
RTT101P47050 PET122YER153C 765 nt15.48■□□□□ 0.07
RTT101P47050 RVS167YDR388W 1449 nt15.47■□□□□ 0.07
RTT101P47050 RTC3YHR087W 336 nt15.42■□□□□ 0.06
RTT101P47050 SCR1SCR1 522 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT101P47050 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.38■□□□□ 0.05
RTT101P47050 RRN5YLR141W 1092 nt15.06■□□□□ 0
RTT101P47050 SHR5YOL110W 714 nt14.93□□□□□ -0.02
RTT101P47050 YDJ1YNL064C 1230 nt14.87□□□□□ -0.03
RTT101P47050 RSB1YOR049C 1065 nt14.8□□□□□ -0.04
RTT101P47050 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.75□□□□□ -0.05
RTT101P47050 GAR1YHR089C 618 nt14.54□□□□□ -0.08
RTT101P47050 DEP1YAL013W 1218 nt14.48□□□□□ -0.09
RTT101P47050 PST2YDR032C 597 nt14.45□□□□□ -0.1
RTT101P47050 URN1YPR152C 1398 nt14.45□□□□□ -0.1
RTT101P47050 SSA3YBL075C 1950 nt14.35□□□□□ -0.11
RTT101P47050 RPN10YHR200W 807 nt14.29□□□□□ -0.12
RTT101P47050 YNL208WYNL208W 600 nt14.26□□□□□ -0.13
RTT101P47050 OPI9YLR338W 858 nt14.2□□□□□ -0.14
RTT101P47050 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
RTT101P47050 SAH1YER043C 1350 nt14.08□□□□□ -0.16
RTT101P47050 TIR1YER011W 765 nt14.04□□□□□ -0.16
RTT101P47050 YKL097CYKL097C 411 nt13.98□□□□□ -0.17
RTT101P47050 ARE1YCR048W 1833 nt13.92□□□□□ -0.18
RTT101P47050 SHU1YHL006C 453 nt13.85□□□□□ -0.19
RTT101P47050 SSA1YAL005C 1929 nt13.82□□□□□ -0.2
RTT101P47050 PUN1YLR414C 792 nt13.81□□□□□ -0.2
RTT101P47050 YJR018WYJR018W 363 nt13.8□□□□□ -0.2
RTT101P47050 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.78□□□□□ -0.2
RTT101P47050 POA1YBR022W 534 nt13.75□□□□□ -0.21
RTT101P47050 PTC2YER089C 1395 nt13.61□□□□□ -0.23
RTT101P47050 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.61□□□□□ -0.23
RTT101P47050 RPP2BYDR382W 333 nt13.58□□□□□ -0.24
RTT101P47050 SRB2YHR041C 633 nt13.57□□□□□ -0.24
RTT101P47050 YJR120WYJR120W 351 nt13.54□□□□□ -0.24
RTT101P47050 BUD23YCR047C 828 nt13.51□□□□□ -0.25
RTT101P47050 WWM1YFL010C 636 nt13.44□□□□□ -0.26
RTT101P47050 NAB2YGL122C 1578 nt13.42□□□□□ -0.26
RTT101P47050 YGR021WYGR021W 873 nt13.41□□□□□ -0.26
RTT101P47050 BSC6YOL137W 1494 nt13.41□□□□□ -0.26
RTT101P47050 YOR139CYOR139C 393 nt13.35□□□□□ -0.27
RTT101P47050 HOM6YJR139C 1080 nt13.34□□□□□ -0.27
RTT101P47050 INM2YDR287W 879 nt13.3□□□□□ -0.28
RTT101P47050 MNP1YGL068W 585 nt13.3□□□□□ -0.28
RTT101P47050 BDH2YAL061W 1254 nt13.3□□□□□ -0.28
RTT101P47050 NPL3YDR432W 1245 nt13.28□□□□□ -0.28
RTT101P47050 FPR4YLR449W 1179 nt13.27□□□□□ -0.29
RTT101P47050 DAL1YIR027C 1383 nt13.26□□□□□ -0.29
RTT101P47050 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.22□□□□□ -0.29
RTT101P47050 FIS1YIL065C 468 nt13.2□□□□□ -0.3
RTT101P47050 YBL100CYBL100C 315 nt13.19□□□□□ -0.3
RTT101P47050 RKM5YLR137W 1104 nt13.16□□□□□ -0.3
RTT101P47050 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
RTT101P47050 YOL037CYOL037C 354 nt13.14□□□□□ -0.31
RTT101P47050 PHO4YFR034C 939 nt13.13□□□□□ -0.31
RTT101P47050 TRM9YML014W 840 nt13.05□□□□□ -0.32
RTT101P47050 FUN26YAL022C 1554 nt13.03□□□□□ -0.32
RTT101P47050 SPT5YML010W 3192 nt13□□□□□ -0.33
RTT101P47050 CCT6YDR188W 1641 nt12.87□□□□□ -0.35
RTT101P47050 ALF1YNL148C 765 nt12.85□□□□□ -0.35
RTT101P47050 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT101P47050 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT101P47050 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT101P47050 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT101P47050 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT101P47050 YPS1YLR120C 1710 nt12.82□□□□□ -0.36
RTT101P47050 YLR281CYLR281C 468 nt12.81□□□□□ -0.36
RTT101P47050 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT101P47050 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT101P47050 WHI5YOR083W 888 nt12.77□□□□□ -0.37
RTT101P47050 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
RTT101P47050 SSA4YER103W 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
RTT101P47050 PUS2YGL063W 1113 nt12.75□□□□□ -0.37
RTT101P47050 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.71□□□□□ -0.37
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