Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		23.92	■■□□□ 1.42
MRD1	Q06106	NSR1	YGR159C	1245 nt		23.67	■■□□□ 1.38
MRD1	Q06106	NOP1	YDL014W	984 nt		23.36	■■□□□ 1.33
MRD1	Q06106	YKL036C	YKL036C	393 nt		21.69	■■□□□ 1.06
MRD1	Q06106	MDJ1	YFL016C	1536 nt		20.82	■□□□□ 0.92
MRD1	Q06106	Q0297	Q0297	156 nt		20.51	■□□□□ 0.87
MRD1	Q06106	SRX1	YKL086W	384 nt		20.41	■□□□□ 0.86
MRD1	Q06106	YJL027C	YJL027C	417 nt		20.28	■□□□□ 0.84
MRD1	Q06106	SCS3	YGL126W	1143 nt		19.82	■□□□□ 0.76
MRD1	Q06106	YCR051W	YCR051W	669 nt		19.34	■□□□□ 0.69
MRD1	Q06106	YOL085C	YOL085C	342 nt		18.78	■□□□□ 0.6
MRD1	Q06106	DBP2	YNL112W	1641 nt		18.52	■□□□□ 0.55
MRD1	Q06106	PKP1	YIL042C	1185 nt		18.44	■□□□□ 0.54
MRD1	Q06106	RPP1B	YDL130W	321 nt		18.39	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		18.36	■□□□□ 0.53
MRD1	Q06106	CCC1	YLR220W	969 nt		18.13	■□□□□ 0.49
MRD1	Q06106	SCJ1	YMR214W	1134 nt		17.79	■□□□□ 0.44
MRD1	Q06106	ATS1	YAL020C	1002 nt		17.78	■□□□□ 0.44
MRD1	Q06106	YBR190W	YBR190W	312 nt		17.75	■□□□□ 0.43
MRD1	Q06106	PET122	YER153C	765 nt		17.53	■□□□□ 0.4
MRD1	Q06106	RVS167	YDR388W	1449 nt		17.46	■□□□□ 0.39
MRD1	Q06106	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		17.41	■□□□□ 0.38
MRD1	Q06106	SCR1	SCR1	522 nt		17.41	■□□□□ 0.38
MRD1	Q06106	RTC3	YHR087W	336 nt		17.33	■□□□□ 0.36
MRD1	Q06106	RRN5	YLR141W	1092 nt		17.04	■□□□□ 0.32
MRD1	Q06106	SHR5	YOL110W	714 nt		16.89	■□□□□ 0.29
MRD1	Q06106	YDJ1	YNL064C	1230 nt		16.86	■□□□□ 0.29
MRD1	Q06106	RSB1	YOR049C	1065 nt		16.74	■□□□□ 0.27
MRD1	Q06106	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		16.72	■□□□□ 0.27
MRD1	Q06106	PST2	YDR032C	597 nt		16.45	■□□□□ 0.22
MRD1	Q06106	GAR1	YHR089C	618 nt		16.43	■□□□□ 0.22
MRD1	Q06106	DEP1	YAL013W	1218 nt		16.31	■□□□□ 0.2
MRD1	Q06106	URN1	YPR152C	1398 nt		16.29	■□□□□ 0.2
MRD1	Q06106	YNL208W	YNL208W	600 nt		16.12	■□□□□ 0.17
MRD1	Q06106	RPN10	YHR200W	807 nt		16.11	■□□□□ 0.17
MRD1	Q06106	OPI9	YLR338W	858 nt		16.04	■□□□□ 0.16
MRD1	Q06106	PUT4	YOR348C	1884 nt		15.97	■□□□□ 0.15
MRD1	Q06106	TIR1	YER011W	765 nt		15.88	■□□□□ 0.13
MRD1	Q06106	YKL097C	YKL097C	411 nt		15.87	■□□□□ 0.13
MRD1	Q06106	SAH1	YER043C	1350 nt		15.87	■□□□□ 0.13
MRD1	Q06106	ARE1	YCR048W	1833 nt		15.73	■□□□□ 0.11
MRD1	Q06106	SHU1	YHL006C	453 nt		15.72	■□□□□ 0.11
MRD1	Q06106	SSA1	YAL005C	1929 nt		15.65	■□□□□ 0.1
MRD1	Q06106	PUN1	YLR414C	792 nt		15.58	■□□□□ 0.08
MRD1	Q06106	YJR018W	YJR018W	363 nt		15.56	■□□□□ 0.08
MRD1	Q06106	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		15.52	■□□□□ 0.08
MRD1	Q06106	POA1	YBR022W	534 nt		15.46	■□□□□ 0.07
MRD1	Q06106	SRB2	YHR041C	633 nt		15.4	■□□□□ 0.06
MRD1	Q06106	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		15.4	■□□□□ 0.06
MRD1	Q06106	SSA3	YBL075C	1950 nt		15.38	■□□□□ 0.05
MRD1	Q06106	YJR120W	YJR120W	351 nt		15.36	■□□□□ 0.05
MRD1	Q06106	PTC2	YER089C	1395 nt		15.35	■□□□□ 0.05
MRD1	Q06106	RPP2B	YDR382W	333 nt		15.3	■□□□□ 0.04
MRD1	Q06106	WWM1	YFL010C	636 nt		15.2	■□□□□ 0.02
MRD1	Q06106	YGR021W	YGR021W	873 nt		15.2	■□□□□ 0.02
MRD1	Q06106	YOR139C	YOR139C	393 nt		15.2	■□□□□ 0.02
MRD1	Q06106	BUD23	YCR047C	828 nt		15.16	■□□□□ 0.02
MRD1	Q06106	HOM6	YJR139C	1080 nt		15.14	■□□□□ 0.01
MRD1	Q06106	NAB2	YGL122C	1578 nt		15.13	■□□□□ 0.01
MRD1	Q06106	BSC6	YOL137W	1494 nt		15.11	■□□□□ 0.01
MRD1	Q06106	MNP1	YGL068W	585 nt		15.06	■□□□□ 0
MRD1	Q06106	NPL3	YDR432W	1245 nt		15.04	■□□□□ -0
MRD1	Q06106	BDH2	YAL061W	1254 nt		15.03	■□□□□ -0
MRD1	Q06106	INM2	YDR287W	879 nt		15	□□□□□ -0.01
MRD1	Q06106	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		14.98	□□□□□ -0.01
MRD1	Q06106	DAL1	YIR027C	1383 nt		14.97	□□□□□ -0.01
MRD1	Q06106	FIS1	YIL065C	468 nt		14.94	□□□□□ -0.02
MRD1	Q06106	RKM5	YLR137W	1104 nt		14.91	□□□□□ -0.02
MRD1	Q06106	YOL037C	YOL037C	354 nt		14.91	□□□□□ -0.02
MRD1	Q06106	FPR4	YLR449W	1179 nt		14.9	□□□□□ -0.02
MRD1	Q06106	LSM3	YLR438C-A	270 nt		14.88	□□□□□ -0.03
MRD1	Q06106	YBL100C	YBL100C	315 nt		14.87	□□□□□ -0.03
MRD1	Q06106	PHO4	YFR034C	939 nt		14.82	□□□□□ -0.04
MRD1	Q06106	FUN26	YAL022C	1554 nt		14.7	□□□□□ -0.06
MRD1	Q06106	TRM9	YML014W	840 nt		14.7	□□□□□ -0.06
MRD1	Q06106	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		14.61	□□□□□ -0.07
MRD1	Q06106	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		14.61	□□□□□ -0.07
MRD1	Q06106	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		14.61	□□□□□ -0.07
MRD1	Q06106	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		14.61	□□□□□ -0.07
MRD1	Q06106	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		14.61	□□□□□ -0.07
MRD1	Q06106	CCT6	YDR188W	1641 nt		14.57	□□□□□ -0.08
MRD1	Q06106	YLR281C	YLR281C	468 nt		14.54	□□□□□ -0.08
MRD1	Q06106	YPS1	YLR120C	1710 nt		14.48	□□□□□ -0.09
MRD1	Q06106	WHI5	YOR083W	888 nt		14.46	□□□□□ -0.09
MRD1	Q06106	PUS2	YGL063W	1113 nt		14.44	□□□□□ -0.1
MRD1	Q06106	ALF1	YNL148C	765 nt		14.44	□□□□□ -0.1
MRD1	Q06106	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		14.43	□□□□□ -0.1
MRD1	Q06106	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		14.43	□□□□□ -0.1
MRD1	Q06106	YDR095C	YDR095C	411 nt		14.42	□□□□□ -0.1
MRD1	Q06106	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		14.32	□□□□□ -0.12
MRD1	Q06106	SPT5	YML010W	3192 nt		14.29	□□□□□ -0.12
MRD1	Q06106	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		14.28	□□□□□ -0.12

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms