Protein–RNA interactions for Protein: P53306

GPI1, Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit GPI1, yeastyeast

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Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPI1P53306 NSR1YGR159C 1245 nt19.45■□□□□ 0.7
GPI1P53306 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.15■□□□□ 0.66
GPI1P53306 NOP1YDL014W 984 nt18.45■□□□□ 0.54
GPI1P53306 MDJ1YFL016C 1536 nt17.66■□□□□ 0.42
GPI1P53306 YKL036CYKL036C 393 nt16.62■□□□□ 0.25
GPI1P53306 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
GPI1P53306 SRX1YKL086W 384 nt16.13■□□□□ 0.17
GPI1P53306 Q0297Q0297 156 nt16.03■□□□□ 0.16
GPI1P53306 DBP2YNL112W 1641 nt15.47■□□□□ 0.07
GPI1P53306 YCR051WYCR051W 669 nt15.24■□□□□ 0.03
GPI1P53306 YBR190WYBR190W 312 nt15.2■□□□□ 0.02
GPI1P53306 SCS3YGL126W 1143 nt14.89□□□□□ -0.03
GPI1P53306 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.85□□□□□ -0.03
GPI1P53306 RTC3YHR087W 336 nt14.79□□□□□ -0.04
GPI1P53306 CCC1YLR220W 969 nt14.65□□□□□ -0.06
GPI1P53306 RVS167YDR388W 1449 nt14.41□□□□□ -0.1
GPI1P53306 YOL085CYOL085C 342 nt14.41□□□□□ -0.1
GPI1P53306 RPP1BYDL130W 321 nt14.37□□□□□ -0.11
GPI1P53306 SCJ1YMR214W 1134 nt14.28□□□□□ -0.12
GPI1P53306 SSA3YBL075C 1950 nt14.27□□□□□ -0.12
GPI1P53306 PKP1YIL042C 1185 nt14.21□□□□□ -0.13
GPI1P53306 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
GPI1P53306 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.9□□□□□ -0.18
GPI1P53306 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
GPI1P53306 PET122YER153C 765 nt13.78□□□□□ -0.2
GPI1P53306 ARE1YCR048W 1833 nt13.75□□□□□ -0.21
GPI1P53306 URN1YPR152C 1398 nt13.71□□□□□ -0.22
GPI1P53306 POA1YBR022W 534 nt13.64□□□□□ -0.23
GPI1P53306 SAH1YER043C 1350 nt13.62□□□□□ -0.23
GPI1P53306 OPI9YLR338W 858 nt13.62□□□□□ -0.23
GPI1P53306 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.56□□□□□ -0.24
GPI1P53306 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
GPI1P53306 SCR1SCR1 522 nt13.5□□□□□ -0.25
GPI1P53306 YDJ1YNL064C 1230 nt13.46□□□□□ -0.25
GPI1P53306 BSC6YOL137W 1494 nt13.44□□□□□ -0.26
GPI1P53306 RPN10YHR200W 807 nt13.41□□□□□ -0.26
GPI1P53306 RRN5YLR141W 1092 nt13.33□□□□□ -0.28
GPI1P53306 YNL208WYNL208W 600 nt13.32□□□□□ -0.28
GPI1P53306 PUN1YLR414C 792 nt13.21□□□□□ -0.29
GPI1P53306 BUD23YCR047C 828 nt13.19□□□□□ -0.3
GPI1P53306 GAR1YHR089C 618 nt13.19□□□□□ -0.3
GPI1P53306 ATS1YAL020C 1002 nt13.19□□□□□ -0.3
GPI1P53306 SPT5YML010W 3192 nt13.18□□□□□ -0.3
GPI1P53306 PTC2YER089C 1395 nt13.11□□□□□ -0.31
GPI1P53306 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.07□□□□□ -0.32
GPI1P53306 YJR018WYJR018W 363 nt13.05□□□□□ -0.32
GPI1P53306 NAB2YGL122C 1578 nt13.02□□□□□ -0.33
GPI1P53306 RSB1YOR049C 1065 nt12.91□□□□□ -0.34
GPI1P53306 SSA4YER103W 1929 nt12.9□□□□□ -0.35
GPI1P53306 FIS1YIL065C 468 nt12.81□□□□□ -0.36
GPI1P53306 TIR1YER011W 765 nt12.79□□□□□ -0.36
GPI1P53306 YJR120WYJR120W 351 nt12.78□□□□□ -0.36
GPI1P53306 DAL1YIR027C 1383 nt12.76□□□□□ -0.37
GPI1P53306 SSA1YAL005C 1929 nt12.73□□□□□ -0.37
GPI1P53306 FPR4YLR449W 1179 nt12.68□□□□□ -0.38
GPI1P53306 MEP2YNL142W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
GPI1P53306 RPP2BYDR382W 333 nt12.66□□□□□ -0.38
GPI1P53306 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
GPI1P53306 PHO4YFR034C 939 nt12.64□□□□□ -0.39
GPI1P53306 YPS1YLR120C 1710 nt12.56□□□□□ -0.4
GPI1P53306 DCW1YKL046C 1350 nt12.45□□□□□ -0.42
GPI1P53306 YBL100CYBL100C 315 nt12.45□□□□□ -0.42
GPI1P53306 BDF1YLR399C 2061 nt12.45□□□□□ -0.42
GPI1P53306 SRB2YHR041C 633 nt12.43□□□□□ -0.42
GPI1P53306 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
GPI1P53306 YDR095CYDR095C 411 nt12.41□□□□□ -0.42
GPI1P53306 BDH2YAL061W 1254 nt12.35□□□□□ -0.43
GPI1P53306 PST2YDR032C 597 nt12.3□□□□□ -0.44
GPI1P53306 FUN26YAL022C 1554 nt12.3□□□□□ -0.44
GPI1P53306 EMI2YDR516C 1503 nt12.29□□□□□ -0.44
GPI1P53306 TAT1YBR069C 1860 nt12.29□□□□□ -0.44
GPI1P53306 YMR090WYMR090W 684 nt12.23□□□□□ -0.45
GPI1P53306 YBR220CYBR220C 1683 nt12.22□□□□□ -0.45
GPI1P53306 PTP1YDL230W 1008 nt12.19□□□□□ -0.46
GPI1P53306 ALF1YNL148C 765 nt12.19□□□□□ -0.46
GPI1P53306 TRM9YML014W 840 nt12.18□□□□□ -0.46
GPI1P53306 RPP2AYOL039W 321 nt12.18□□□□□ -0.46
GPI1P53306 YDL221WYDL221W 552 nt12.17□□□□□ -0.46
GPI1P53306 CAC2YML102W 1407 nt12.15□□□□□ -0.46
GPI1P53306 WWM1YFL010C 636 nt12.15□□□□□ -0.46
GPI1P53306 LSM3YLR438C-A 270 nt12.12□□□□□ -0.47
GPI1P53306 CCT6YDR188W 1641 nt12.11□□□□□ -0.47
GPI1P53306 SDH1YKL148C 1923 nt12.1□□□□□ -0.47
GPI1P53306 SIS1YNL007C 1059 nt12.05□□□□□ -0.48
GPI1P53306 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.02□□□□□ -0.49
GPI1P53306 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.02□□□□□ -0.49
GPI1P53306 IRC15YPL017C 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
GPI1P53306 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.98□□□□□ -0.49
GPI1P53306 SCC4YER147C 1875 nt11.96□□□□□ -0.49
GPI1P53306 YGR021WYGR021W 873 nt11.96□□□□□ -0.49
GPI1P53306 SHU1YHL006C 453 nt11.9□□□□□ -0.5
GPI1P53306 GIS3YLR094C 1509 nt11.9□□□□□ -0.5
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