Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.45■□□□□ 0.7
SEC39Q12745 NOP1YDL014W 984 nt19.14■□□□□ 0.65
SEC39Q12745 NSR1YGR159C 1245 nt19.02■□□□□ 0.64
SEC39Q12745 YKL036CYKL036C 393 nt17.96■□□□□ 0.47
SEC39Q12745 MDJ1YFL016C 1536 nt17.6■□□□□ 0.41
SEC39Q12745 YJL027CYJL027C 417 nt16.82■□□□□ 0.28
SEC39Q12745 Q0297Q0297 156 nt16.81■□□□□ 0.28
SEC39Q12745 SRX1YKL086W 384 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC39Q12745 SCS3YGL126W 1143 nt16.49■□□□□ 0.23
SEC39Q12745 SSA3YBL075C 1950 nt16.42■□□□□ 0.22
SEC39Q12745 YCR051WYCR051W 669 nt15.82■□□□□ 0.12
SEC39Q12745 YOL085CYOL085C 342 nt15.48■□□□□ 0.07
SEC39Q12745 YBR190WYBR190W 312 nt15.24■□□□□ 0.03
SEC39Q12745 SCJ1YMR214W 1134 nt15.18■□□□□ 0.02
SEC39Q12745 PKP1YIL042C 1185 nt15.15■□□□□ 0.02
SEC39Q12745 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
SEC39Q12745 RPP1BYDL130W 321 nt15.08■□□□□ 0
SEC39Q12745 RTC3YHR087W 336 nt14.87□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 ATS1YAL020C 1002 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC39Q12745 PUT4YOR348C 1884 nt14.69□□□□□ -0.06
SEC39Q12745 CCC1YLR220W 969 nt14.64□□□□□ -0.07
SEC39Q12745 SCR1SCR1 522 nt14.39□□□□□ -0.11
SEC39Q12745 PET122YER153C 765 nt14.32□□□□□ -0.12
SEC39Q12745 SSA4YER103W 1929 nt14.25□□□□□ -0.13
SEC39Q12745 SPT5YML010W 3192 nt14.19□□□□□ -0.14
SEC39Q12745 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.14□□□□□ -0.15
SEC39Q12745 POA1YBR022W 534 nt14.14□□□□□ -0.15
SEC39Q12745 ARE1YCR048W 1833 nt14.09□□□□□ -0.15
SEC39Q12745 RVS167YDR388W 1449 nt14.07□□□□□ -0.16
SEC39Q12745 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
SEC39Q12745 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.94□□□□□ -0.18
SEC39Q12745 RRN5YLR141W 1092 nt13.93□□□□□ -0.18
SEC39Q12745 BDF1YLR399C 2061 nt13.82□□□□□ -0.2
SEC39Q12745 RSB1YOR049C 1065 nt13.81□□□□□ -0.2
SEC39Q12745 PAC11YDR488C 1602 nt13.77□□□□□ -0.21
SEC39Q12745 SAH1YER043C 1350 nt13.74□□□□□ -0.21
SEC39Q12745 YDJ1YNL064C 1230 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC39Q12745 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.67□□□□□ -0.22
SEC39Q12745 PST2YDR032C 597 nt13.66□□□□□ -0.22
SEC39Q12745 TAT1YBR069C 1860 nt13.61□□□□□ -0.23
SEC39Q12745 SHR5YOL110W 714 nt13.61□□□□□ -0.23
SEC39Q12745 URN1YPR152C 1398 nt13.58□□□□□ -0.24
SEC39Q12745 OPI9YLR338W 858 nt13.53□□□□□ -0.24
SEC39Q12745 BUD23YCR047C 828 nt13.52□□□□□ -0.25
SEC39Q12745 NVJ2YPR091C 2313 nt13.42□□□□□ -0.26
SEC39Q12745 YKL097CYKL097C 411 nt13.39□□□□□ -0.27
SEC39Q12745 MEP2YNL142W 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
SEC39Q12745 GAR1YHR089C 618 nt13.29□□□□□ -0.28
SEC39Q12745 DEP1YAL013W 1218 nt13.22□□□□□ -0.29
SEC39Q12745 PTC2YER089C 1395 nt13.17□□□□□ -0.3
SEC39Q12745 PUN1YLR414C 792 nt13.14□□□□□ -0.31
SEC39Q12745 NAB2YGL122C 1578 nt13.13□□□□□ -0.31
SEC39Q12745 DCW1YKL046C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
SEC39Q12745 RPN10YHR200W 807 nt13.06□□□□□ -0.32
SEC39Q12745 SHU1YHL006C 453 nt13□□□□□ -0.33
SEC39Q12745 YBR220CYBR220C 1683 nt12.99□□□□□ -0.33
SEC39Q12745 YNL208WYNL208W 600 nt12.94□□□□□ -0.34
SEC39Q12745 FIS1YIL065C 468 nt12.88□□□□□ -0.35
SEC39Q12745 TIR1YER011W 765 nt12.86□□□□□ -0.35
SEC39Q12745 EMI2YDR516C 1503 nt12.86□□□□□ -0.35
SEC39Q12745 YMR090WYMR090W 684 nt12.84□□□□□ -0.35
SEC39Q12745 FPS1YLL043W 2010 nt12.83□□□□□ -0.36
SEC39Q12745 YJR018WYJR018W 363 nt12.82□□□□□ -0.36
SEC39Q12745 PCH2YBR186W 1695 nt12.8□□□□□ -0.36
SEC39Q12745 YPS1YLR120C 1710 nt12.78□□□□□ -0.36
SEC39Q12745 GUT2YIL155C 1950 nt12.78□□□□□ -0.36
SEC39Q12745 DAL1YIR027C 1383 nt12.76□□□□□ -0.37
SEC39Q12745 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.73□□□□□ -0.37
SEC39Q12745 FPR4YLR449W 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
SEC39Q12745 SDH1YKL148C 1923 nt12.72□□□□□ -0.37
SEC39Q12745 SEC11YIR022W 504 nt12.68□□□□□ -0.38
SEC39Q12745 YOR139CYOR139C 393 nt12.68□□□□□ -0.38
SEC39Q12745 YDL221WYDL221W 552 nt12.67□□□□□ -0.38
SEC39Q12745 PHO4YFR034C 939 nt12.66□□□□□ -0.38
SEC39Q12745 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.63□□□□□ -0.39
SEC39Q12745 NPL3YDR432W 1245 nt12.62□□□□□ -0.39
SEC39Q12745 SSA1YAL005C 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
SEC39Q12745 YDR095CYDR095C 411 nt12.54□□□□□ -0.4
SEC39Q12745 PIB2YGL023C 1908 nt12.54□□□□□ -0.4
SEC39Q12745 YGR021WYGR021W 873 nt12.49□□□□□ -0.41
SEC39Q12745 CAC2YML102W 1407 nt12.48□□□□□ -0.41
SEC39Q12745 INM2YDR287W 879 nt12.48□□□□□ -0.41
SEC39Q12745 SCC4YER147C 1875 nt12.48□□□□□ -0.41
SEC39Q12745 YJR120WYJR120W 351 nt12.45□□□□□ -0.42
SEC39Q12745 UME6YDR207C 2511 nt12.45□□□□□ -0.42
SEC39Q12745 YOL037CYOL037C 354 nt12.4□□□□□ -0.42
SEC39Q12745 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
SEC39Q12745 HOM6YJR139C 1080 nt12.37□□□□□ -0.43
SEC39Q12745 PTP1YDL230W 1008 nt12.36□□□□□ -0.43
SEC39Q12745 Q0182Q0182 405 nt12.35□□□□□ -0.43
SEC39Q12745 YSC84YHR016C 1407 nt12.35□□□□□ -0.43
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