RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PFA4YOL003C DRS1P32892 752 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PFA4YOL003C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PFA4YOL003C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PFA4YOL003C AVT3P36062 692 aa13.61□□□□□ -0.23
PFA4YOL003C FAP1P53971 965 aa13.38□□□□□ -0.27
PFA4YOL003C ISW2Q08773 1120 aa13.21□□□□□ -0.29
PFA4YOL003C PRI1P10363 409 aa13.12□□□□□ -0.31
PFA4YOL003C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PFA4YOL003C TFA1P36100 482 aa13.03□□□□□ -0.32
PFA4YOL003C RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PFA4YOL003C AAD16Q02895 342 aa12.9□□□□□ -0.34
PFA4YOL003C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PFA4YOL003C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PFA4YOL003C PRY3P47033 881 aa12.55□□□□□ -0.4
PFA4YOL003C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PFA4YOL003C REB1P21538 810 aa12.39□□□□□ -0.43
PFA4YOL003C SPT21P35209 758 aa12.15□□□□□ -0.46
PFA4YOL003C YCK3P39962 524 aa11.97□□□□□ -0.49
PFA4YOL003C RIM101P33400 625 aa11.95□□□□□ -0.5
PFA4YOL003C MRPL32P25348 183 aa11.94□□□□□ -0.5
PFA4YOL003C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PFA4YOL003C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PFA4YOL003C OXP1P28273 1286 aa11.57□□□□□ -0.56
PFA4YOL003C CDC27P38042 758 aa11.54□□□□□ -0.56
PFA4YOL003C TFC8Q12308 588 aa11.53□□□□□ -0.56
PFA4YOL003C HOP09932 586 aa11.48□□□□□ -0.57
PFA4YOL003C DCD1P06773 312 aa11.38□□□□□ -0.59
PFA4YOL003C PTP3P40048 928 aa11.37□□□□□ -0.59
PFA4YOL003C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PFA4YOL003C SSP1P38871 571 aa11.32□□□□□ -0.6
PFA4YOL003C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PFA4YOL003C RSM7P47150 247 aa11.21□□□□□ -0.61
PFA4YOL003C YLR271WQ06152 274 aa11.21□□□□□ -0.61
PFA4YOL003C YGL015CP33199 130 aa11.18□□□□□ -0.62
PFA4YOL003C BCH2P36122 765 aa11.18□□□□□ -0.62
PFA4YOL003C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data11.15□□□□□ -0.62not detected
PFA4YOL003C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PFA4YOL003C MAP2P38174 421 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PFA4YOL003C AI2P03876 854 aa11.02□□□□□ -0.65
PFA4YOL003C SCY1P53009 804 aa11□□□□□ -0.65
PFA4YOL003C EPS1P40557 701 aa10.97□□□□□ -0.65
PFA4YOL003C MGA2P40578 1113 aa10.95□□□□□ -0.66
PFA4YOL003C BBC1P47068 1157 aa10.95□□□□□ -0.66
PFA4YOL003C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PFA4YOL003C BDF1P35817 686 aa10.9□□□□□ -0.66
PFA4YOL003C CST9Q06032 482 aa10.85□□□□□ -0.67
PFA4YOL003C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PFA4YOL003C SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PFA4YOL003C MRM1P25270 412 aa10.66□□□□□ -0.7
PFA4YOL003C DMA1P38823 416 aa10.62□□□□□ -0.71
PFA4YOL003C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PFA4YOL003C TGL3P40308 642 aa10.58□□□□□ -0.72
PFA4YOL003C RTG3P38165 486 aa10.53□□□□□ -0.72
PFA4YOL003C RCR1P38212 213 aa10.49□□□□□ -0.73
PFA4YOL003C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.46□□□□□ -0.73not detected
PFA4YOL003C RAM2P29703 316 aa10.46□□□□□ -0.73
PFA4YOL003C VPS29P38759 282 aa10.45□□□□□ -0.74
PFA4YOL003C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data10.36□□□□□ -0.75not detected
PFA4YOL003C YAP5P40574 245 aa10.35□□□□□ -0.75
PFA4YOL003C MAK11P20484 414 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PFA4YOL003C YOR238WQ08634 303 aa10.31□□□□□ -0.76
PFA4YOL003C MST1P07236 462 aa10.29□□□□□ -0.76
PFA4YOL003C STS1P38637 319 aa10.29□□□□□ -0.76
PFA4YOL003C DBP1P24784 617 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PFA4YOL003C YFR006WP43590 535 aa10.23□□□□□ -0.77
PFA4YOL003C SET1P38827 1080 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PFA4YOL003C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PFA4YOL003C PIB1Q06651 286 aa10.17□□□□□ -0.78
PFA4YOL003C COQ8P27697 501 aa10.16□□□□□ -0.78
PFA4YOL003C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PFA4YOL003C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PFA4YOL003C EDS1P38073 919 aa10.1□□□□□ -0.79
PFA4YOL003C MIF2P35201 549 aa10.09□□□□□ -0.79
PFA4YOL003C YPR148CQ06523 435 aa10.08□□□□□ -0.8
PFA4YOL003C IFH1P39520 1085 aa10.05□□□□□ -0.8
PFA4YOL003C SAM3Q08986 587 aa10.05□□□□□ -0.8
PFA4YOL003C GTT3P39996 337 aa10.04□□□□□ -0.8
PFA4YOL003C PTC3P34221 468 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PFA4YOL003C VPS70P47161 811 aa9.94□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C YOL036WQ08206 761 aa9.93□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C UBP9P39967 754 aa9.91□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C CKB1P43639 278 aa9.91□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C GYP5Q12344 894 aa9.91□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C MSB4Q12317 492 aa9.9□□□□□ -0.82
PFA4YOL003C GUT1P32190 709 aa9.89□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C YBL029C-AQ3E756 94 aa9.89□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C ATH1P48016 1211 aa9.88□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C WSC3Q12215 556 aa9.88□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C VNX1P42839 908 aa9.87□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C SET4P42948 560 aa9.86□□□□□ -0.83
PFA4YOL003C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C DCW1P36091 449 aa9.79□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C SOL3P38858 249 aa9.78□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PFA4YOL003C HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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