Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.49■■□□□ 1.99
YRF1-2P40105 NOP1YDL014W 984 nt26.42■■□□□ 1.82
YRF1-2P40105 NSR1YGR159C 1245 nt26.16■■□□□ 1.78
YRF1-2P40105 YKL036CYKL036C 393 nt25.48■■□□□ 1.67
YRF1-2P40105 YJL027CYJL027C 417 nt23.85■■□□□ 1.41
YRF1-2P40105 SCS3YGL126W 1143 nt23.81■■□□□ 1.4
YRF1-2P40105 Q0297Q0297 156 nt23.63■■□□□ 1.37
YRF1-2P40105 SRX1YKL086W 384 nt23.51■■□□□ 1.35
YRF1-2P40105 MDJ1YFL016C 1536 nt23.3■■□□□ 1.32
YRF1-2P40105 YCR051WYCR051W 669 nt22.34■■□□□ 1.17
YRF1-2P40105 YOL085CYOL085C 342 nt21.79■■□□□ 1.08
YRF1-2P40105 SCJ1YMR214W 1134 nt21.72■■□□□ 1.07
YRF1-2P40105 PKP1YIL042C 1185 nt21.7■■□□□ 1.06
YRF1-2P40105 ATS1YAL020C 1002 nt21.15■□□□□ 0.98
YRF1-2P40105 RPP1BYDL130W 321 nt21.15■□□□□ 0.98
YRF1-2P40105 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.89■□□□□ 0.93
YRF1-2P40105 DBP2YNL112W 1641 nt20.67■□□□□ 0.9
YRF1-2P40105 CCC1YLR220W 969 nt20.54■□□□□ 0.88
YRF1-2P40105 PET122YER153C 765 nt20.37■□□□□ 0.85
YRF1-2P40105 SCR1SCR1 522 nt20.19■□□□□ 0.82
YRF1-2P40105 RTC3YHR087W 336 nt19.94■□□□□ 0.78
YRF1-2P40105 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.84■□□□□ 0.77
YRF1-2P40105 RSB1YOR049C 1065 nt19.68■□□□□ 0.74
YRF1-2P40105 RRN5YLR141W 1092 nt19.57■□□□□ 0.72
YRF1-2P40105 PST2YDR032C 597 nt19.4■□□□□ 0.7
YRF1-2P40105 YBR190WYBR190W 312 nt19.39■□□□□ 0.69
YRF1-2P40105 RVS167YDR388W 1449 nt19.36■□□□□ 0.69
YRF1-2P40105 YKL097CYKL097C 411 nt19.34■□□□□ 0.69
YRF1-2P40105 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.25■□□□□ 0.67
YRF1-2P40105 YDJ1YNL064C 1230 nt19.02■□□□□ 0.64
YRF1-2P40105 SHR5YOL110W 714 nt18.88■□□□□ 0.61
YRF1-2P40105 SHU1YHL006C 453 nt18.69■□□□□ 0.58
YRF1-2P40105 GAR1YHR089C 618 nt18.61■□□□□ 0.57
YRF1-2P40105 YOR139CYOR139C 393 nt18.48■□□□□ 0.55
YRF1-2P40105 DEP1YAL013W 1218 nt18.41■□□□□ 0.54
YRF1-2P40105 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.25■□□□□ 0.51
YRF1-2P40105 URN1YPR152C 1398 nt18.17■□□□□ 0.5
YRF1-2P40105 NPL3YDR432W 1245 nt18.1■□□□□ 0.49
YRF1-2P40105 TIR1YER011W 765 nt17.92■□□□□ 0.46
YRF1-2P40105 MNP1YGL068W 585 nt17.88■□□□□ 0.45
YRF1-2P40105 YNL208WYNL208W 600 nt17.83■□□□□ 0.44
YRF1-2P40105 RPN10YHR200W 807 nt17.79■□□□□ 0.44
YRF1-2P40105 SRB2YHR041C 633 nt17.74■□□□□ 0.43
YRF1-2P40105 YOL037CYOL037C 354 nt17.67■□□□□ 0.42
YRF1-2P40105 SSA1YAL005C 1929 nt17.66■□□□□ 0.42
YRF1-2P40105 OPI9YLR338W 858 nt17.64■□□□□ 0.42
YRF1-2P40105 SAH1YER043C 1350 nt17.59■□□□□ 0.41
YRF1-2P40105 HOM6YJR139C 1080 nt17.52■□□□□ 0.39
YRF1-2P40105 YGR021WYGR021W 873 nt17.48■□□□□ 0.39
YRF1-2P40105 WWM1YFL010C 636 nt17.45■□□□□ 0.38
YRF1-2P40105 PUT4YOR348C 1884 nt17.39■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 YJR120WYJR120W 351 nt17.36■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.34■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.34■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.34■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.34■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.34■□□□□ 0.37
YRF1-2P40105 ARE1YCR048W 1833 nt17.3■□□□□ 0.36
YRF1-2P40105 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.28■□□□□ 0.36
YRF1-2P40105 MOT3YMR070W 1473 nt17.27■□□□□ 0.35
YRF1-2P40105 YJR018WYJR018W 363 nt17.24■□□□□ 0.35
YRF1-2P40105 BSC6YOL137W 1494 nt17.21■□□□□ 0.34
YRF1-2P40105 RKM5YLR137W 1104 nt17.2■□□□□ 0.34
YRF1-2P40105 PUN1YLR414C 792 nt17.11■□□□□ 0.33
YRF1-2P40105 PUS2YGL063W 1113 nt17.1■□□□□ 0.33
YRF1-2P40105 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.05■□□□□ 0.32
YRF1-2P40105 YLR281CYLR281C 468 nt16.96■□□□□ 0.31
YRF1-2P40105 SSA3YBL075C 1950 nt16.94■□□□□ 0.3
YRF1-2P40105 RPP2BYDR382W 333 nt16.93■□□□□ 0.3
YRF1-2P40105 POA1YBR022W 534 nt16.91■□□□□ 0.3
YRF1-2P40105 PTC2YER089C 1395 nt16.85■□□□□ 0.29
YRF1-2P40105 WHI5YOR083W 888 nt16.85■□□□□ 0.29
YRF1-2P40105 FMP45YDL222C 930 nt16.84■□□□□ 0.29
YRF1-2P40105 YLR236CYLR236C 324 nt16.83■□□□□ 0.28
YRF1-2P40105 BUD23YCR047C 828 nt16.81■□□□□ 0.28
YRF1-2P40105 BDH2YAL061W 1254 nt16.78■□□□□ 0.28
YRF1-2P40105 MRPL8YJL063C 717 nt16.71■□□□□ 0.27
YRF1-2P40105 FIS1YIL065C 468 nt16.69■□□□□ 0.26
YRF1-2P40105 DSK2YMR276W 1122 nt16.65■□□□□ 0.26
YRF1-2P40105 YPR011CYPR011C 981 nt16.59■□□□□ 0.25
YRF1-2P40105 YBL100CYBL100C 315 nt16.58■□□□□ 0.24
YRF1-2P40105 NAB2YGL122C 1578 nt16.56■□□□□ 0.24
YRF1-2P40105 UBX6YJL048C 1191 nt16.51■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 PHO4YFR034C 939 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 YCH1YGR203W 447 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 IMP2'YIL154C 1041 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 ADO1YJR105W 1023 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 FPR4YLR449W 1179 nt16.5■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 RTG1YOL067C 534 nt16.49■□□□□ 0.23
YRF1-2P40105 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.45■□□□□ 0.22
YRF1-2P40105 YEL076CYEL076C 651 nt16.45■□□□□ 0.22
YRF1-2P40105 YLR464WYLR464W 651 nt16.45■□□□□ 0.22
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