Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2Q0

YDL007C-A, Putative uncharacterized protein YDL007C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL007C-AQ2V2Q0 NSR1YGR159C 1245 nt18.57■□□□□ 0.56
YDL007C-AQ2V2Q0 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.37■□□□□ 0.53
YDL007C-AQ2V2Q0 NOP1YDL014W 984 nt17.82■□□□□ 0.44
YDL007C-AQ2V2Q0 MDJ1YFL016C 1536 nt16.65■□□□□ 0.26
YDL007C-AQ2V2Q0 YKL036CYKL036C 393 nt16.18■□□□□ 0.18
YDL007C-AQ2V2Q0 SRX1YKL086W 384 nt15.57■□□□□ 0.08
YDL007C-AQ2V2Q0 Q0297Q0297 156 nt15.52■□□□□ 0.08
YDL007C-AQ2V2Q0 YJL027CYJL027C 417 nt15.39■□□□□ 0.05
YDL007C-AQ2V2Q0 YCR051WYCR051W 669 nt14.7□□□□□ -0.06
YDL007C-AQ2V2Q0 DBP2YNL112W 1641 nt14.67□□□□□ -0.06
YDL007C-AQ2V2Q0 SCS3YGL126W 1143 nt14.56□□□□□ -0.08
YDL007C-AQ2V2Q0 YBR190WYBR190W 312 nt14.34□□□□□ -0.11
YDL007C-AQ2V2Q0 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL007C-AQ2V2Q0 CCC1YLR220W 969 nt14.02□□□□□ -0.17
YDL007C-AQ2V2Q0 YOL085CYOL085C 342 nt14.02□□□□□ -0.17
YDL007C-AQ2V2Q0 RTC3YHR087W 336 nt13.95□□□□□ -0.18
YDL007C-AQ2V2Q0 RPP1BYDL130W 321 nt13.91□□□□□ -0.18
YDL007C-AQ2V2Q0 PKP1YIL042C 1185 nt13.78□□□□□ -0.2
YDL007C-AQ2V2Q0 RVS167YDR388W 1449 nt13.73□□□□□ -0.21
YDL007C-AQ2V2Q0 SCJ1YMR214W 1134 nt13.57□□□□□ -0.24
YDL007C-AQ2V2Q0 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
YDL007C-AQ2V2Q0 PET122YER153C 765 nt13.29□□□□□ -0.28
YDL007C-AQ2V2Q0 PUT4YOR348C 1884 nt13.21□□□□□ -0.3
YDL007C-AQ2V2Q0 SHR5YOL110W 714 nt13.2□□□□□ -0.3
YDL007C-AQ2V2Q0 SCR1SCR1 522 nt13.1□□□□□ -0.31
YDL007C-AQ2V2Q0 URN1YPR152C 1398 nt12.97□□□□□ -0.33
YDL007C-AQ2V2Q0 ATS1YAL020C 1002 nt12.97□□□□□ -0.33
YDL007C-AQ2V2Q0 YDJ1YNL064C 1230 nt12.96□□□□□ -0.33
YDL007C-AQ2V2Q0 SSA3YBL075C 1950 nt12.95□□□□□ -0.34
YDL007C-AQ2V2Q0 RRN5YLR141W 1092 nt12.89□□□□□ -0.35
YDL007C-AQ2V2Q0 OPI9YLR338W 858 nt12.88□□□□□ -0.35
YDL007C-AQ2V2Q0 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
YDL007C-AQ2V2Q0 DEP1YAL013W 1218 nt12.85□□□□□ -0.35
YDL007C-AQ2V2Q0 SAH1YER043C 1350 nt12.82□□□□□ -0.36
YDL007C-AQ2V2Q0 RPN10YHR200W 807 nt12.75□□□□□ -0.37
YDL007C-AQ2V2Q0 POA1YBR022W 534 nt12.74□□□□□ -0.37
YDL007C-AQ2V2Q0 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.68□□□□□ -0.38
YDL007C-AQ2V2Q0 YNL208WYNL208W 600 nt12.68□□□□□ -0.38
YDL007C-AQ2V2Q0 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
YDL007C-AQ2V2Q0 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.64□□□□□ -0.39
YDL007C-AQ2V2Q0 RSB1YOR049C 1065 nt12.52□□□□□ -0.41
YDL007C-AQ2V2Q0 BSC6YOL137W 1494 nt12.52□□□□□ -0.41
YDL007C-AQ2V2Q0 PUN1YLR414C 792 nt12.5□□□□□ -0.41
YDL007C-AQ2V2Q0 YJR018WYJR018W 363 nt12.38□□□□□ -0.43
YDL007C-AQ2V2Q0 PTC2YER089C 1395 nt12.36□□□□□ -0.43
YDL007C-AQ2V2Q0 BUD23YCR047C 828 nt12.35□□□□□ -0.43
YDL007C-AQ2V2Q0 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
YDL007C-AQ2V2Q0 TIR1YER011W 765 nt12.26□□□□□ -0.45
YDL007C-AQ2V2Q0 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
YDL007C-AQ2V2Q0 SSA1YAL005C 1929 nt12.16□□□□□ -0.46
YDL007C-AQ2V2Q0 YJR120WYJR120W 351 nt12.12□□□□□ -0.47
YDL007C-AQ2V2Q0 PST2YDR032C 597 nt12.08□□□□□ -0.48
YDL007C-AQ2V2Q0 RPP2BYDR382W 333 nt12.05□□□□□ -0.48
YDL007C-AQ2V2Q0 FIS1YIL065C 468 nt12.04□□□□□ -0.48
YDL007C-AQ2V2Q0 DAL1YIR027C 1383 nt12.04□□□□□ -0.48
YDL007C-AQ2V2Q0 INM2YDR287W 879 nt12□□□□□ -0.49
YDL007C-AQ2V2Q0 FPR4YLR449W 1179 nt11.94□□□□□ -0.5
YDL007C-AQ2V2Q0 Q0182Q0182 405 nt11.92□□□□□ -0.5
YDL007C-AQ2V2Q0 PHO4YFR034C 939 nt11.91□□□□□ -0.5
YDL007C-AQ2V2Q0 SRB2YHR041C 633 nt11.88□□□□□ -0.51
YDL007C-AQ2V2Q0 SSA4YER103W 1929 nt11.84□□□□□ -0.51
YDL007C-AQ2V2Q0 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
YDL007C-AQ2V2Q0 YBL100CYBL100C 315 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL007C-AQ2V2Q0 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL007C-AQ2V2Q0 BDH2YAL061W 1254 nt11.78□□□□□ -0.52
YDL007C-AQ2V2Q0 YDR095CYDR095C 411 nt11.68□□□□□ -0.54
YDL007C-AQ2V2Q0 FUN26YAL022C 1554 nt11.67□□□□□ -0.54
YDL007C-AQ2V2Q0 WWM1YFL010C 636 nt11.66□□□□□ -0.54
YDL007C-AQ2V2Q0 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.64□□□□□ -0.55
YDL007C-AQ2V2Q0 LSM3YLR438C-A 270 nt11.62□□□□□ -0.55
YDL007C-AQ2V2Q0 SHU1YHL006C 453 nt11.61□□□□□ -0.55
YDL007C-AQ2V2Q0 TRM9YML014W 840 nt11.6□□□□□ -0.55
YDL007C-AQ2V2Q0 DCW1YKL046C 1350 nt11.58□□□□□ -0.56
YDL007C-AQ2V2Q0 YGR021WYGR021W 873 nt11.55□□□□□ -0.56
YDL007C-AQ2V2Q0 ALF1YNL148C 765 nt11.53□□□□□ -0.56
YDL007C-AQ2V2Q0 CCT6YDR188W 1641 nt11.52□□□□□ -0.57
YDL007C-AQ2V2Q0 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
YDL007C-AQ2V2Q0 HOM6YJR139C 1080 nt11.48□□□□□ -0.57
YDL007C-AQ2V2Q0 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.48□□□□□ -0.57
YDL007C-AQ2V2Q0 RPP2AYOL039W 321 nt11.46□□□□□ -0.57
YDL007C-AQ2V2Q0 PTP1YDL230W 1008 nt11.45□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.43□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.43□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 BDF1YLR399C 2061 nt11.42□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 YKL097CYKL097C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 YMR090WYMR090W 684 nt11.42□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 SIS1YNL007C 1059 nt11.41□□□□□ -0.58
YDL007C-AQ2V2Q0 CAC2YML102W 1407 nt11.38□□□□□ -0.59
YDL007C-AQ2V2Q0 MOT3YMR070W 1473 nt11.36□□□□□ -0.59
YDL007C-AQ2V2Q0 YDL221WYDL221W 552 nt11.35□□□□□ -0.59
YDL007C-AQ2V2Q0 YBR220CYBR220C 1683 nt11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms