Protein–RNA interactions for Protein: Q12092

ATG29, Autophagy-related protein 29, yeastyeast

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG29Q12092 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.89■□□□□ 0.77
ATG29Q12092 NSR1YGR159C 1245 nt19.75■□□□□ 0.75
ATG29Q12092 NOP1YDL014W 984 nt19.36■□□□□ 0.69
ATG29Q12092 YKL036CYKL036C 393 nt17.84■□□□□ 0.45
ATG29Q12092 MDJ1YFL016C 1536 nt17.52■□□□□ 0.39
ATG29Q12092 Q0297Q0297 156 nt16.91■□□□□ 0.3
ATG29Q12092 SRX1YKL086W 384 nt16.88■□□□□ 0.29
ATG29Q12092 YJL027CYJL027C 417 nt16.66■□□□□ 0.26
ATG29Q12092 SCS3YGL126W 1143 nt16.22■□□□□ 0.19
ATG29Q12092 YCR051WYCR051W 669 nt16.03■□□□□ 0.16
ATG29Q12092 DBP2YNL112W 1641 nt15.47■□□□□ 0.07
ATG29Q12092 YOL085CYOL085C 342 nt15.42■□□□□ 0.06
ATG29Q12092 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.27■□□□□ 0.04
ATG29Q12092 RPP1BYDL130W 321 nt15.18■□□□□ 0.02
ATG29Q12092 PKP1YIL042C 1185 nt15.18■□□□□ 0.02
ATG29Q12092 CCC1YLR220W 969 nt15.09■□□□□ 0.01
ATG29Q12092 YBR190WYBR190W 312 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG29Q12092 SSA3YBL075C 1950 nt14.73□□□□□ -0.05
ATG29Q12092 RVS167YDR388W 1449 nt14.65□□□□□ -0.06
ATG29Q12092 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
ATG29Q12092 ATS1YAL020C 1002 nt14.5□□□□□ -0.09
ATG29Q12092 SCJ1YMR214W 1134 nt14.5□□□□□ -0.09
ATG29Q12092 PET122YER153C 765 nt14.49□□□□□ -0.09
ATG29Q12092 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.43□□□□□ -0.1
ATG29Q12092 SCR1SCR1 522 nt14.39□□□□□ -0.11
ATG29Q12092 SHR5YOL110W 714 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG29Q12092 RRN5YLR141W 1092 nt14.05□□□□□ -0.16
ATG29Q12092 YDJ1YNL064C 1230 nt13.98□□□□□ -0.17
ATG29Q12092 RSB1YOR049C 1065 nt13.8□□□□□ -0.2
ATG29Q12092 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.78□□□□□ -0.2
ATG29Q12092 URN1YPR152C 1398 nt13.69□□□□□ -0.22
ATG29Q12092 DEP1YAL013W 1218 nt13.66□□□□□ -0.22
ATG29Q12092 GAR1YHR089C 618 nt13.65□□□□□ -0.22
ATG29Q12092 RPN10YHR200W 807 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG29Q12092 PUT4YOR348C 1884 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG29Q12092 OPI9YLR338W 858 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG29Q12092 YNL208WYNL208W 600 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG29Q12092 PST2YDR032C 597 nt13.41□□□□□ -0.26
ATG29Q12092 SAH1YER043C 1350 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG29Q12092 ARE1YCR048W 1833 nt13.3□□□□□ -0.28
ATG29Q12092 TIR1YER011W 765 nt13.2□□□□□ -0.3
ATG29Q12092 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG29Q12092 PUN1YLR414C 792 nt13.13□□□□□ -0.31
ATG29Q12092 POA1YBR022W 534 nt13.12□□□□□ -0.31
ATG29Q12092 YJR018WYJR018W 363 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG29Q12092 SSA1YAL005C 1929 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG29Q12092 YKL097CYKL097C 411 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG29Q12092 PTC2YER089C 1395 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG29Q12092 SHU1YHL006C 453 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG29Q12092 BUD23YCR047C 828 nt12.86□□□□□ -0.35
ATG29Q12092 BSC6YOL137W 1494 nt12.85□□□□□ -0.35
ATG29Q12092 RPP2BYDR382W 333 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG29Q12092 YJR120WYJR120W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG29Q12092 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
ATG29Q12092 NAB2YGL122C 1578 nt12.78□□□□□ -0.36
ATG29Q12092 SSA4YER103W 1929 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG29Q12092 SRB2YHR041C 633 nt12.75□□□□□ -0.37
ATG29Q12092 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG29Q12092 DAL1YIR027C 1383 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG29Q12092 INM2YDR287W 879 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG29Q12092 WWM1YFL010C 636 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG29Q12092 YGR021WYGR021W 873 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG29Q12092 FIS1YIL065C 468 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG29Q12092 FPR4YLR449W 1179 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG29Q12092 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG29Q12092 HOM6YJR139C 1080 nt12.5□□□□□ -0.41
ATG29Q12092 PHO4YFR034C 939 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG29Q12092 YBL100CYBL100C 315 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG29Q12092 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG29Q12092 MNP1YGL068W 585 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG29Q12092 BDF1YLR399C 2061 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG29Q12092 LSM3YLR438C-A 270 nt12.4□□□□□ -0.42
ATG29Q12092 Q0182Q0182 405 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG29Q12092 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG29Q12092 RKM5YLR137W 1104 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 FUN26YAL022C 1554 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 NPL3YDR432W 1245 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 TRM9YML014W 840 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 PAC11YDR488C 1602 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 YOL037CYOL037C 354 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG29Q12092 YPS1YLR120C 1710 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG29Q12092 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG29Q12092 CCT6YDR188W 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
ATG29Q12092 ALF1YNL148C 765 nt12.18□□□□□ -0.46
ATG29Q12092 YDR095CYDR095C 411 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG29Q12092 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.13□□□□□ -0.47
ATG29Q12092 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.13□□□□□ -0.47
ATG29Q12092 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
ATG29Q12092 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG29Q12092 MEP2YNL142W 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
ATG29Q12092 SIS1YNL007C 1059 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG29Q12092 YLR281CYLR281C 468 nt11.94□□□□□ -0.5
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