RNA–Protein interactions for RNA: YHL008C

YHL008C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHL008C, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CYHL008C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C TPM2P40414 161 aa10.43□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C YBT1P32386 1661 aa10.42□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C TEA1P47988 759 aa10.42□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C CLB5P30283 435 aa10.4□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C TRM3Q07527 1436 aa10.4□□□□□ -0.74
YHL008CYHL008C SWE1P32944 819 aa10.4□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C MET10P39692 1035 aa10.4□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C RPN1P38764 993 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C ESC2Q06340 456 aa10.38□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C DSN1P40568 576 aa10.37□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C GDB1Q06625 1536 aa10.36□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C CKB1P43639 278 aa10.36□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C LCD1Q04377 747 aa10.36□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C YDL144CQ07589 356 aa10.36□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C RAD2P07276 1031 aa10.35□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C TCD1P38756 429 aa10.34□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C PDR12Q02785 1511 aa10.34□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
YHL008CYHL008C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C SUI2P20459 304 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C RSC1P53236 928 aa10.32□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C COG8Q04632 607 aa10.32□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C MET5P47169 1442 aa10.32□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C PSH1Q12161 406 aa10.32□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C CIN4P39110 191 aa10.31□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C VPS60Q03390 229 aa10.31□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data10.31□□□□□ -0.76not detected
YHL008CYHL008C HSP82P02829 709 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C CLB1P24868 471 aa10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C LTV1P34078 463 aa10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C ITC1P53125 1264 aa10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C MDG1P53885 366 aa10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C DEP1P31385 405 aa10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C PIL1P53252 339 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C SPO14P36126 1683 aa10.28□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C MSH3P25336 1018 aa10.28□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C MED8P38304 223 aa10.27□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C SIC1P38634 284 aa10.27□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
YHL008CYHL008C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C YNL011CP53980 444 aa10.26□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C DOS2P54858 310 aa10.26□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C MCM2P29469 868 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C ECM1P39715 212 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C HAP5Q02516 242 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C PLP2Q12017 286 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C YRF1-1P0CX20 1796 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C YRF1-5P0CX21 1796 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C YRF1-8P0CX22 1796 aa10.25□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C VPS4P52917 437 aa10.24□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C RNT1Q02555 471 aa10.24□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C IOC4Q04213 475 aa10.23□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C YSP2Q06681 1438 aa10.23□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C MIC60P36112 540 aa10.22□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C RKM3P38222 552 aa10.22□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C BYE1P36106 594 aa10.21□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C SFI1Q12369 946 aa10.21□□□□□ -0.77
YHL008CYHL008C BUD3P25558 1636 aa10.21□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C RAD9P14737 1309 aa10.2□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C SRS2P12954 1174 aa10.2□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C MPP10P47083 593 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C POL32P47110 350 aa10.19□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C STU2P46675 888 aa10.19□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C NNF2P53253 936 aa10.19□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C IQG1Q12280 1495 aa10.17□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C DAL5P15365 543 aa10.17□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C SRP54P20424 541 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C TAF5P38129 798 aa10.17□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data10.17□□□□□ -0.78not detected
YHL008CYHL008C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
YHL008CYHL008C CEP3P40969 608 aa10.15□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C DNF2Q12675 1612 aa10.14□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C CYC8P14922 966 aa10.14□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C RPN12P32496 274 aa10.14□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C SCT1P32784 759 aa10.14□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C YIL092WP40497 633 aa10.14□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C BNR1P40450 1375 aa10.13□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C YGL140CP53120 1219 aa10.13□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C SAP190P36123 1033 aa10.12□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C YOL087CQ99247 1116 aa10.12□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C SWI3P32591 825 aa10.11□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data10.11□□□□□ -0.79not detected
YHL008CYHL008C RRT14P40470 206 aa10.11□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C CIR1P42940 261 aa10.11□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C MRS2Q01926 470 aa10.11□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
YHL008CYHL008C TRK1P12685 1235 aa10.1□□□□□ -0.79
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