Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YML009W-BYML009W-B 477 nt32.07■■■□□ 2.72
YRF1-8P0CX22 NOP1YDL014W 984 nt30.84■■■□□ 2.53
YRF1-8P0CX22 NSR1YGR159C 1245 nt30.41■■■□□ 2.46
YRF1-8P0CX22 YKL036CYKL036C 393 nt29.76■■■□□ 2.35
YRF1-8P0CX22 YJL027CYJL027C 417 nt27.93■■■□□ 2.06
YRF1-8P0CX22 SCS3YGL126W 1143 nt27.83■■■□□ 2.05
YRF1-8P0CX22 Q0297Q0297 156 nt27.6■■■□□ 2.01
YRF1-8P0CX22 SRX1YKL086W 384 nt27.42■■□□□ 1.98
YRF1-8P0CX22 MDJ1YFL016C 1536 nt26.76■■□□□ 1.87
YRF1-8P0CX22 YCR051WYCR051W 669 nt26.13■■□□□ 1.77
YRF1-8P0CX22 YOL085CYOL085C 342 nt25.61■■□□□ 1.69
YRF1-8P0CX22 PKP1YIL042C 1185 nt25.52■■□□□ 1.68
YRF1-8P0CX22 SCJ1YMR214W 1134 nt25.33■■□□□ 1.65
YRF1-8P0CX22 ATS1YAL020C 1002 nt24.85■■□□□ 1.57
YRF1-8P0CX22 RPP1BYDL130W 321 nt24.73■■□□□ 1.55
YRF1-8P0CX22 TRN1tP(UGG)A 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 SUF9tP(UGG)F 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 SUF8tP(UGG)H 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 SUF7tP(UGG)M 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 SUF11tP(UGG)O2 72 nt24.32■■□□□ 1.48
YRF1-8P0CX22 CCC1YLR220W 969 nt24.03■■□□□ 1.44
YRF1-8P0CX22 DBP2YNL112W 1641 nt23.96■■□□□ 1.43
YRF1-8P0CX22 PET122YER153C 765 nt23.83■■□□□ 1.41
YRF1-8P0CX22 SCR1SCR1 522 nt23.52■■□□□ 1.36
YRF1-8P0CX22 RTC3YHR087W 336 nt23.4■■□□□ 1.34
YRF1-8P0CX22 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt23.2■■□□□ 1.3
YRF1-8P0CX22 RRN5YLR141W 1092 nt23.04■■□□□ 1.28
YRF1-8P0CX22 RSB1YOR049C 1065 nt23.01■■□□□ 1.27
YRF1-8P0CX22 PST2YDR032C 597 nt22.83■■□□□ 1.24
YRF1-8P0CX22 YER088W-BYER088W-B 147 nt22.61■■□□□ 1.21
YRF1-8P0CX22 YKL097CYKL097C 411 nt22.58■■□□□ 1.21
YRF1-8P0CX22 RVS167YDR388W 1449 nt22.41■■□□□ 1.18
YRF1-8P0CX22 YDJ1YNL064C 1230 nt22.2■■□□□ 1.14
YRF1-8P0CX22 YBR190WYBR190W 312 nt22.07■■□□□ 1.12
YRF1-8P0CX22 SHR5YOL110W 714 nt21.96■■□□□ 1.11
YRF1-8P0CX22 SHU1YHL006C 453 nt21.94■■□□□ 1.1
YRF1-8P0CX22 GAR1YHR089C 618 nt21.82■■□□□ 1.08
YRF1-8P0CX22 YOR139CYOR139C 393 nt21.7■■□□□ 1.06
YRF1-8P0CX22 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt21.52■■□□□ 1.04
YRF1-8P0CX22 DEP1YAL013W 1218 nt21.36■■□□□ 1.01
YRF1-8P0CX22 NPL3YDR432W 1245 nt21.11■□□□□ 0.97
YRF1-8P0CX22 TIR1YER011W 765 nt20.97■□□□□ 0.95
YRF1-8P0CX22 URN1YPR152C 1398 nt20.95■□□□□ 0.94
YRF1-8P0CX22 MNP1YGL068W 585 nt20.87■□□□□ 0.93
YRF1-8P0CX22 SRB2YHR041C 633 nt20.84■□□□□ 0.93
YRF1-8P0CX22 YNL208WYNL208W 600 nt20.65■□□□□ 0.9
YRF1-8P0CX22 SSA1YAL005C 1929 nt20.64■□□□□ 0.89
YRF1-8P0CX22 RPN10YHR200W 807 nt20.51■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 YOL037CYOL037C 354 nt20.48■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 WWM1YFL010C 636 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 HOM6YJR139C 1080 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 IMT4tM(CAU)E 72 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 IMT3tM(CAU)J3 72 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 IMT1tM(CAU)O1 72 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 IMT2tM(CAU)P 72 nt20.46■□□□□ 0.87
YRF1-8P0CX22 YGR021WYGR021W 873 nt20.29■□□□□ 0.84
YRF1-8P0CX22 MOT3YMR070W 1473 nt20.23■□□□□ 0.83
YRF1-8P0CX22 OPI9YLR338W 858 nt20.22■□□□□ 0.83
YRF1-8P0CX22 YJR120WYJR120W 351 nt20.18■□□□□ 0.82
YRF1-8P0CX22 PUS2YGL063W 1113 nt20.1■□□□□ 0.81
YRF1-8P0CX22 SAH1YER043C 1350 nt20.09■□□□□ 0.81
YRF1-8P0CX22 RKM5YLR137W 1104 nt20.08■□□□□ 0.81
YRF1-8P0CX22 BSC6YOL137W 1494 nt20.08■□□□□ 0.81
YRF1-8P0CX22 YJR018WYJR018W 363 nt19.9■□□□□ 0.78
YRF1-8P0CX22 YLR281CYLR281C 468 nt19.88■□□□□ 0.77
YRF1-8P0CX22 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt19.84■□□□□ 0.77
YRF1-8P0CX22 SSA3YBL075C 1950 nt19.83■□□□□ 0.76
YRF1-8P0CX22 WHI5YOR083W 888 nt19.76■□□□□ 0.75
YRF1-8P0CX22 FMP45YDL222C 930 nt19.72■□□□□ 0.75
YRF1-8P0CX22 YLR236CYLR236C 324 nt19.7■□□□□ 0.74
YRF1-8P0CX22 YPR011CYPR011C 981 nt19.67■□□□□ 0.74
YRF1-8P0CX22 RPP2BYDR382W 333 nt19.58■□□□□ 0.73
YRF1-8P0CX22 ARE1YCR048W 1833 nt19.57■□□□□ 0.72
YRF1-8P0CX22 PUN1YLR414C 792 nt19.56■□□□□ 0.72
YRF1-8P0CX22 UBX6YJL048C 1191 nt19.55■□□□□ 0.72
YRF1-8P0CX22 BDH2YAL061W 1254 nt19.53■□□□□ 0.72
YRF1-8P0CX22 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt19.5■□□□□ 0.71
YRF1-8P0CX22 PUT4YOR348C 1884 nt19.47■□□□□ 0.71
YRF1-8P0CX22 MRPL8YJL063C 717 nt19.47■□□□□ 0.71
YRF1-8P0CX22 DSK2YMR276W 1122 nt19.44■□□□□ 0.7
YRF1-8P0CX22 YCH1YGR203W 447 nt19.32■□□□□ 0.68
YRF1-8P0CX22 RTG1YOL067C 534 nt19.3■□□□□ 0.68
YRF1-8P0CX22 LPX1YOR084W 1164 nt19.27■□□□□ 0.68
YRF1-8P0CX22 SPP1YPL138C 1062 nt19.27■□□□□ 0.68
YRF1-8P0CX22 PTC2YER089C 1395 nt19.24■□□□□ 0.67
YRF1-8P0CX22 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19.24■□□□□ 0.67
YRF1-8P0CX22 YEL076CYEL076C 651 nt19.24■□□□□ 0.67
YRF1-8P0CX22 YLR464WYLR464W 651 nt19.24■□□□□ 0.67
YRF1-8P0CX22 ADO1YJR105W 1023 nt19.21■□□□□ 0.67
YRF1-8P0CX22 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.14■□□□□ 0.66
YRF1-8P0CX22 YBL100CYBL100C 315 nt19.11■□□□□ 0.65
YRF1-8P0CX22 IMP2'YIL154C 1041 nt19.11■□□□□ 0.65
YRF1-8P0CX22 LSM3YLR438C-A 270 nt19.1■□□□□ 0.65
YRF1-8P0CX22 BUD23YCR047C 828 nt19.03■□□□□ 0.64
YRF1-8P0CX22 FIS1YIL065C 468 nt19.02■□□□□ 0.64
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