Protein–RNA interactions for Protein: Q99247

YOL087C, Uncharacterized WD repeat-containing protein YOL087C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOL087CQ99247 NSR1YGR159C 1245 nt19.79■□□□□ 0.76
YOL087CQ99247 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.21■□□□□ 0.67
YOL087CQ99247 MDJ1YFL016C 1536 nt18.63■□□□□ 0.57
YOL087CQ99247 NOP1YDL014W 984 nt18.16■□□□□ 0.5
YOL087CQ99247 YJL027CYJL027C 417 nt16.99■□□□□ 0.31
YOL087CQ99247 SSA3YBL075C 1950 nt16.68■□□□□ 0.26
YOL087CQ99247 YKL036CYKL036C 393 nt16.43■□□□□ 0.22
YOL087CQ99247 DBP2YNL112W 1641 nt16.07■□□□□ 0.16
YOL087CQ99247 YBR190WYBR190W 312 nt16.01■□□□□ 0.15
YOL087CQ99247 SRX1YKL086W 384 nt15.9■□□□□ 0.14
YOL087CQ99247 Q0297Q0297 156 nt15.72■□□□□ 0.11
YOL087CQ99247 RTC3YHR087W 336 nt15.65■□□□□ 0.1
YOL087CQ99247 PUT4YOR348C 1884 nt15.33■□□□□ 0.04
YOL087CQ99247 YCR051WYCR051W 669 nt15.07■□□□□ 0
YOL087CQ99247 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YOL087CQ99247 SCS3YGL126W 1143 nt14.87□□□□□ -0.03
YOL087CQ99247 CCC1YLR220W 969 nt14.87□□□□□ -0.03
YOL087CQ99247 RVS167YDR388W 1449 nt14.79□□□□□ -0.04
YOL087CQ99247 POA1YBR022W 534 nt14.78□□□□□ -0.04
YOL087CQ99247 ARE1YCR048W 1833 nt14.77□□□□□ -0.05
YOL087CQ99247 SCJ1YMR214W 1134 nt14.66□□□□□ -0.06
YOL087CQ99247 SPT5YML010W 3192 nt14.65□□□□□ -0.06
YOL087CQ99247 BSC6YOL137W 1494 nt14.65□□□□□ -0.06
YOL087CQ99247 SSA4YER103W 1929 nt14.64□□□□□ -0.07
YOL087CQ99247 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.61□□□□□ -0.07
YOL087CQ99247 SAH1YER043C 1350 nt14.47□□□□□ -0.09
YOL087CQ99247 URN1YPR152C 1398 nt14.32□□□□□ -0.12
YOL087CQ99247 OPI9YLR338W 858 nt14.26□□□□□ -0.13
YOL087CQ99247 YOL085CYOL085C 342 nt14.26□□□□□ -0.13
YOL087CQ99247 BUD23YCR047C 828 nt14.19□□□□□ -0.14
YOL087CQ99247 BDF1YLR399C 2061 nt14.16□□□□□ -0.14
YOL087CQ99247 RPP1BYDL130W 321 nt14.11□□□□□ -0.15
YOL087CQ99247 DEP1YAL013W 1218 nt14.1□□□□□ -0.15
YOL087CQ99247 PKP1YIL042C 1185 nt14.08□□□□□ -0.16
YOL087CQ99247 SHR5YOL110W 714 nt14.07□□□□□ -0.16
YOL087CQ99247 TAT1YBR069C 1860 nt13.95□□□□□ -0.18
YOL087CQ99247 PAC11YDR488C 1602 nt13.9□□□□□ -0.19
YOL087CQ99247 PTC2YER089C 1395 nt13.87□□□□□ -0.19
YOL087CQ99247 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.85□□□□□ -0.19
YOL087CQ99247 Q0182Q0182 405 nt13.85□□□□□ -0.19
YOL087CQ99247 MEP2YNL142W 1500 nt13.82□□□□□ -0.2
YOL087CQ99247 PUN1YLR414C 792 nt13.8□□□□□ -0.2
YOL087CQ99247 RPN10YHR200W 807 nt13.79□□□□□ -0.2
YOL087CQ99247 NAB2YGL122C 1578 nt13.77□□□□□ -0.21
YOL087CQ99247 YNL208WYNL208W 600 nt13.66□□□□□ -0.22
YOL087CQ99247 DCW1YKL046C 1350 nt13.66□□□□□ -0.22
YOL087CQ99247 PET122YER153C 765 nt13.59□□□□□ -0.23
YOL087CQ99247 YJR018WYJR018W 363 nt13.57□□□□□ -0.24
YOL087CQ99247 FIS1YIL065C 468 nt13.56□□□□□ -0.24
YOL087CQ99247 NVJ2YPR091C 2313 nt13.48□□□□□ -0.25
YOL087CQ99247 YBR220CYBR220C 1683 nt13.47□□□□□ -0.25
YOL087CQ99247 FPR4YLR449W 1179 nt13.43□□□□□ -0.26
YOL087CQ99247 DAL1YIR027C 1383 nt13.42□□□□□ -0.26
YOL087CQ99247 YPS1YLR120C 1710 nt13.39□□□□□ -0.27
YOL087CQ99247 EMI2YDR516C 1503 nt13.39□□□□□ -0.27
YOL087CQ99247 YDJ1YNL064C 1230 nt13.36□□□□□ -0.27
YOL087CQ99247 PHO4YFR034C 939 nt13.34□□□□□ -0.27
YOL087CQ99247 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.32□□□□□ -0.28
YOL087CQ99247 GAR1YHR089C 618 nt13.29□□□□□ -0.28
YOL087CQ99247 YMR090WYMR090W 684 nt13.28□□□□□ -0.28
YOL087CQ99247 SCR1SCR1 522 nt13.27□□□□□ -0.29
YOL087CQ99247 YJR120WYJR120W 351 nt13.25□□□□□ -0.29
YOL087CQ99247 ATS1YAL020C 1002 nt13.23□□□□□ -0.29
YOL087CQ99247 MOT3YMR070W 1473 nt13.22□□□□□ -0.29
YOL087CQ99247 SDH1YKL148C 1923 nt13.21□□□□□ -0.29
YOL087CQ99247 YDL221WYDL221W 552 nt13.2□□□□□ -0.3
YOL087CQ99247 PCH2YBR186W 1695 nt13.2□□□□□ -0.3
YOL087CQ99247 GUT2YIL155C 1950 nt13.17□□□□□ -0.3
YOL087CQ99247 YDR095CYDR095C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
YOL087CQ99247 INM2YDR287W 879 nt13.13□□□□□ -0.31
YOL087CQ99247 RRN5YLR141W 1092 nt13.1□□□□□ -0.31
YOL087CQ99247 CAC2YML102W 1407 nt13.1□□□□□ -0.31
YOL087CQ99247 SEC11YIR022W 504 nt13.03□□□□□ -0.32
YOL087CQ99247 PTP1YDL230W 1008 nt13□□□□□ -0.33
YOL087CQ99247 SCC4YER147C 1875 nt12.99□□□□□ -0.33
YOL087CQ99247 RPP2BYDR382W 333 nt12.99□□□□□ -0.33
YOL087CQ99247 PIB2YGL023C 1908 nt12.96□□□□□ -0.34
YOL087CQ99247 SSA1YAL005C 1929 nt12.95□□□□□ -0.34
YOL087CQ99247 YBL100CYBL100C 315 nt12.94□□□□□ -0.34
YOL087CQ99247 IRC15YPL017C 1500 nt12.89□□□□□ -0.35
YOL087CQ99247 RPP2AYOL039W 321 nt12.89□□□□□ -0.35
YOL087CQ99247 TIR1YER011W 765 nt12.86□□□□□ -0.35
YOL087CQ99247 YSC84YHR016C 1407 nt12.86□□□□□ -0.35
YOL087CQ99247 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.85□□□□□ -0.35
YOL087CQ99247 GIS3YLR094C 1509 nt12.83□□□□□ -0.36
YOL087CQ99247 RTF1YGL244W 1677 nt12.78□□□□□ -0.36
YOL087CQ99247 FPS1YLL043W 2010 nt12.77□□□□□ -0.37
YOL087CQ99247 RSB1YOR049C 1065 nt12.76□□□□□ -0.37
YOL087CQ99247 FUN26YAL022C 1554 nt12.75□□□□□ -0.37
YOL087CQ99247 YHL050CYHL050C 2094 nt12.74□□□□□ -0.37
YOL087CQ99247 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
YOL087CQ99247 SRB2YHR041C 633 nt12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 134.3 ms