RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C ERG12P07277 443 aa5.23□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C CLB5P30283 435 aa5.23□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C PAT1P25644 796 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TEA1P47988 759 aa5.19□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C SEC2P17065 759 aa5.18□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C RRN7P40992 514 aa5.18□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-DR4O74302 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-AP0CX57 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-PR1P0CX58 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-ORP0CX59 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-PR2P0CX60 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-DR5P0CX65 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-ER2P0CX66 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-GR3P0CX67 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-LR1P0CX68 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-MR2P0CX69 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C KEX2P13134 814 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C DIT2P21595 489 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-JR2P47099 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-DR1Q03856 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-BRQ12217 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-NL2Q12470 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C TY1A-GR2Q12485 440 aa5.17□□□□□ -1.58
YFR056CYFR056C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.16□□□□□ -1.58not detected
YFR056CYFR056C AIR1P40507 360 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C ERF2Q06551 359 aa5.14□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C BRE2P43132 505 aa5.13□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C YMR196WQ04336 1088 aa5.13□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C CLA4P48562 842 aa5.12□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C RTF1P53064 558 aa5.12□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C ATF2P53296 535 aa5.12□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C YNL115CP53925 644 aa5.12□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C CST6P40535 587 aa5.11□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C NIS1P53939 407 aa5.11□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C BDP1P46678 594 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C TUB4P53378 473 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C LAM6Q08001 693 aa5.09□□□□□ -1.59
YFR056CYFR056C SIT4P20604 311 aa5.08□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C PAC1P39946 494 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C SLY41P22215 453 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C FPK1P53739 893 aa5.07□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C AGE1Q04412 482 aa5.06□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C MET22P32179 357 aa5.05□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C GLC3P32775 704 aa5.05□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C KXD1P53158 218 aa5.05□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C TBF1Q02457 562 aa5.05□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C GCR2Q01722 534 aa5.04□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C HED1Q03937 162 aa5.03□□□□□ -1.6
YFR056CYFR056C CDC4P07834 779 aa5.02□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C MOD5P07884 428 aa5.02□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C GLN1P32288 370 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C HST2P53686 357 aa5.02□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C MMP1Q12372 583 aa5.02□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C PUS6P53294 404 aa5.01□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C SCJ1P25303 377 aa5□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C HXT10P43581 546 aa5□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C PUS5Q06244 254 aa5□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C AIM7Q12156 149 aa5□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C ALR1Q08269 859 aa4.99□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C YDL206WQ12424 762 aa4.99□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C TRM1P15565 570 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C RPA14P50106 137 aa4.98□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C HST3P53687 447 aa4.98□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C ESS1P22696 170 aa4.97□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YFR056CYFR056C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data4.97□□□□□ -1.61not detected
YFR056CYFR056C KIP2P28743 706 aa4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C TPD3P31383 635 aa4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C ENV9Q08651 330 aa4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C YDL176WQ12027 708 aa4.96□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C ASH1P34233 588 aa4.95□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C CSN12P47130 423 aa4.95□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C YPR097WQ06839 1073 aa4.95□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C LEU3P08638 886 aa4.94□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C MET32Q12041 191 aa4.94□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C AFT1P22149 690 aa4.93□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C YJU3P28321 313 aa4.93□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C ARG8P18544 423 aa4.92□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C IXR1P33417 597 aa4.92□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C YDR444WQ04093 687 aa4.91□□□□□ -1.62
YFR056CYFR056C KIN1P13185 1064 aa4.9□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C MTC5Q03897 1148 aa4.9□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C SSA2P10592 639 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C UGA3P26370 528 aa4.89□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C RPN1P38764 993 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C RSC30P38781 883 aa4.87□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C YJR115WP47152 169 aa4.87□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C SRF1Q12516 437 aa4.87□□□□□ -1.63
YFR056CYFR056C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.2 ms