RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W SSN2P38931 1420 aa6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SWI3P32591 825 aa6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W NPR3P38742 1146 aa6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SLX8P40072 274 aa6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W RPG1P38249 964 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SPC42P36094 363 aa6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W YJR008WP47085 338 aa6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W ECM5Q03214 1411 aa6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W CLN1P20437 546 aa6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SEC27P41811 889 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W GLE1Q12315 538 aa5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W BDP1P46678 594 aa5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W NDL1Q06568 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W PSR1Q07800 427 aa5.99□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W PHO87P25360 923 aa5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W RPL5P26321 297 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W TY4A-JP47023 414 aa5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W GEF1P37020 779 aa5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W TAF1P46677 1066 aa5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W PSK2Q08217 1101 aa5.98□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W MMS1Q06211 1407 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W KAR3P17119 729 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W AIM21P40563 679 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W PUP2P32379 260 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W ITC1P53125 1264 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W MEH1Q02205 184 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W VPS30Q02948 557 aa5.97□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W MDM38Q08179 573 aa5.96□□□□□ -1.45
CYK3YDL117W RAD2P07276 1031 aa5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W PDR1P12383 1068 aa5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W PSO2P30620 661 aa5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W DSF2P38213 736 aa5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W ORM2Q06144 216 aa5.96□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W MGA2P40578 1113 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W MRX12P47084 519 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RSC1P53236 928 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W GDE1Q02979 1223 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W ARR1Q06596 294 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W NOT3P06102 836 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W CLB1P24868 471 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W COG8Q04632 607 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W HIR3P47171 1648 aa5.95□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W GCD6P32501 712 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W JJJ1P53863 590 aa5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RIM101P33400 625 aa5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W LAM1P38851 1228 aa5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W BUD4P47136 1447 aa5.94□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W YPR172WQ06608 200 aa5.93□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W UFD4P33202 1483 aa5.93□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W KEX2P13134 814 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W BRF1P29056 596 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RNT1Q02555 471 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SPP41P38904 1435 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W MDS3P53094 1487 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W RAD3P06839 778 aa5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W MYO4P32492 1471 aa5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SWH1P35845 1188 aa5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W EDE1P34216 1381 aa5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W PEP1P32319 1579 aa5.91□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SWI6P09959 803 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W GAL11P19659 1081 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data5.9□□□□□ -1.46not detected
CYK3YDL117W BNI4P53858 892 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W VTC3Q02725 835 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W VPS60Q03390 229 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W SLP1Q12232 587 aa5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CYK3YDL117W UBP1P25037 809 aa5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W CIN4P39110 191 aa5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W MET10P39692 1035 aa5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YIR014WP40570 242 aa5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W IAH1P41734 238 aa5.9□□□□□ -1.47
CYK3YDL117W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms