Protein–RNA interactions for Protein: Q08179

MDM38, Mitochondrial distribution and morphology protein 38, yeastyeast

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Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM38Q08179 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.54■■□□□ 1.04
MDM38Q08179 NSR1YGR159C 1245 nt21.36■■□□□ 1.01
MDM38Q08179 NOP1YDL014W 984 nt20.96■□□□□ 0.95
MDM38Q08179 YKL036CYKL036C 393 nt19.39■□□□□ 0.69
MDM38Q08179 MDJ1YFL016C 1536 nt18.94■□□□□ 0.62
MDM38Q08179 Q0297Q0297 156 nt18.38■□□□□ 0.53
MDM38Q08179 SRX1YKL086W 384 nt18.33■□□□□ 0.52
MDM38Q08179 YJL027CYJL027C 417 nt18.1■□□□□ 0.49
MDM38Q08179 SCS3YGL126W 1143 nt17.68■□□□□ 0.42
MDM38Q08179 YCR051WYCR051W 669 nt17.37■□□□□ 0.37
MDM38Q08179 YOL085CYOL085C 342 nt16.79■□□□□ 0.28
MDM38Q08179 DBP2YNL112W 1641 nt16.78■□□□□ 0.28
MDM38Q08179 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.55■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 PKP1YIL042C 1185 nt16.52■□□□□ 0.24
MDM38Q08179 RPP1BYDL130W 321 nt16.49■□□□□ 0.23
MDM38Q08179 CCC1YLR220W 969 nt16.35■□□□□ 0.21
MDM38Q08179 SSA3YBL075C 1950 nt16.35■□□□□ 0.21
MDM38Q08179 YBR190WYBR190W 312 nt16.13■□□□□ 0.17
MDM38Q08179 ATS1YAL020C 1002 nt15.81■□□□□ 0.12
MDM38Q08179 RVS167YDR388W 1449 nt15.77■□□□□ 0.12
MDM38Q08179 PET122YER153C 765 nt15.75■□□□□ 0.11
MDM38Q08179 RTC3YHR087W 336 nt15.75■□□□□ 0.11
MDM38Q08179 SCJ1YMR214W 1134 nt15.73■□□□□ 0.11
MDM38Q08179 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.66■□□□□ 0.1
MDM38Q08179 SCR1SCR1 522 nt15.58■□□□□ 0.08
MDM38Q08179 RRN5YLR141W 1092 nt15.28■□□□□ 0.04
MDM38Q08179 SHR5YOL110W 714 nt15.25■□□□□ 0.03
MDM38Q08179 YDJ1YNL064C 1230 nt15.16■□□□□ 0.02
MDM38Q08179 RSB1YOR049C 1065 nt14.99□□□□□ -0.01
MDM38Q08179 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.98□□□□□ -0.01
MDM38Q08179 GAR1YHR089C 618 nt14.79□□□□□ -0.04
MDM38Q08179 URN1YPR152C 1398 nt14.78□□□□□ -0.04
MDM38Q08179 DEP1YAL013W 1218 nt14.78□□□□□ -0.04
MDM38Q08179 PST2YDR032C 597 nt14.64□□□□□ -0.07
MDM38Q08179 PUT4YOR348C 1884 nt14.61□□□□□ -0.07
MDM38Q08179 RPN10YHR200W 807 nt14.58□□□□□ -0.08
MDM38Q08179 OPI9YLR338W 858 nt14.57□□□□□ -0.08
MDM38Q08179 YNL208WYNL208W 600 nt14.57□□□□□ -0.08
MDM38Q08179 SAH1YER043C 1350 nt14.45□□□□□ -0.1
MDM38Q08179 ARE1YCR048W 1833 nt14.36□□□□□ -0.11
MDM38Q08179 TIR1YER011W 765 nt14.31□□□□□ -0.12
MDM38Q08179 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.18□□□□□ -0.14
MDM38Q08179 PUN1YLR414C 792 nt14.14□□□□□ -0.15
MDM38Q08179 POA1YBR022W 534 nt14.14□□□□□ -0.15
MDM38Q08179 SSA1YAL005C 1929 nt14.12□□□□□ -0.15
MDM38Q08179 YJR018WYJR018W 363 nt14.1□□□□□ -0.15
MDM38Q08179 YKL097CYKL097C 411 nt14.09□□□□□ -0.15
MDM38Q08179 SSA4YER103W 1929 nt14.08□□□□□ -0.16
MDM38Q08179 SHU1YHL006C 453 nt14.04□□□□□ -0.16
MDM38Q08179 SPT5YML010W 3192 nt13.98□□□□□ -0.17
MDM38Q08179 PTC2YER089C 1395 nt13.95□□□□□ -0.18
MDM38Q08179 YJR120WYJR120W 351 nt13.93□□□□□ -0.18
MDM38Q08179 SRB2YHR041C 633 nt13.9□□□□□ -0.18
MDM38Q08179 BUD23YCR047C 828 nt13.84□□□□□ -0.19
MDM38Q08179 BSC6YOL137W 1494 nt13.84□□□□□ -0.19
MDM38Q08179 RPP2BYDR382W 333 nt13.83□□□□□ -0.2
MDM38Q08179 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.79□□□□□ -0.2
MDM38Q08179 NAB2YGL122C 1578 nt13.77□□□□□ -0.21
MDM38Q08179 PAC11YDR488C 1602 nt13.76□□□□□ -0.21
MDM38Q08179 WWM1YFL010C 636 nt13.69□□□□□ -0.22
MDM38Q08179 BDF1YLR399C 2061 nt13.68□□□□□ -0.22
MDM38Q08179 YGR021WYGR021W 873 nt13.63□□□□□ -0.23
MDM38Q08179 DAL1YIR027C 1383 nt13.6□□□□□ -0.23
MDM38Q08179 FIS1YIL065C 468 nt13.6□□□□□ -0.23
MDM38Q08179 INM2YDR287W 879 nt13.59□□□□□ -0.23
MDM38Q08179 HOM6YJR139C 1080 nt13.58□□□□□ -0.24
MDM38Q08179 BDH2YAL061W 1254 nt13.57□□□□□ -0.24
MDM38Q08179 FPR4YLR449W 1179 nt13.55□□□□□ -0.24
MDM38Q08179 MNP1YGL068W 585 nt13.53□□□□□ -0.24
MDM38Q08179 YOR139CYOR139C 393 nt13.52□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 NVJ2YPR091C 2313 nt13.51□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 TAT1YBR069C 1860 nt13.51□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.48□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 PHO4YFR034C 939 nt13.48□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 YBL100CYBL100C 315 nt13.48□□□□□ -0.25
MDM38Q08179 LSM3YLR438C-A 270 nt13.4□□□□□ -0.26
MDM38Q08179 NPL3YDR432W 1245 nt13.39□□□□□ -0.27
MDM38Q08179 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
MDM38Q08179 YOL037CYOL037C 354 nt13.34□□□□□ -0.27
MDM38Q08179 FUN26YAL022C 1554 nt13.32□□□□□ -0.28
MDM38Q08179 TRM9YML014W 840 nt13.29□□□□□ -0.28
MDM38Q08179 YPS1YLR120C 1710 nt13.19□□□□□ -0.3
MDM38Q08179 CCT6YDR188W 1641 nt13.18□□□□□ -0.3
MDM38Q08179 Q0182Q0182 405 nt13.16□□□□□ -0.3
MDM38Q08179 YDR095CYDR095C 411 nt13.13□□□□□ -0.31
MDM38Q08179 ALF1YNL148C 765 nt13.11□□□□□ -0.31
MDM38Q08179 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.05□□□□□ -0.32
MDM38Q08179 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.05□□□□□ -0.32
MDM38Q08179 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.04□□□□□ -0.32
MDM38Q08179 FPS1YLL043W 2010 nt13□□□□□ -0.33
MDM38Q08179 YLR281CYLR281C 468 nt13□□□□□ -0.33
MDM38Q08179 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.99□□□□□ -0.33
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