RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-222	ENST00000592408	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.82	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEC24B	O95487	1268 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	IGF1R	P08069	1367 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	CUL7	Q14999	1698 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-222	ENST00000592408	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	IER5L	Q5T953	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	GSE1	Q14687	1217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-222	ENST00000592408	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	POTEM	A6NI47	508 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	NES	P48681	1621 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLCG2	P16885	1265 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23	2e-11	■■□□□ 13.5
EFTUD2-222	ENST00000592408	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-222	ENST00000592408	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSEN1	P49768	467 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.47	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
EFTUD2-222	ENST00000592408	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26	8e-16	■□□□□ 9.3
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	ST18	O60284	1047 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR62	O43379	1518 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EFTUD2-222	ENST00000592408	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	ITGAE	P38570	1179 aa		13.36	□□□□□ -0.27
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms